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降解样品NGS用 cDNA文库构建SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing酶试剂盒Takara Clontech

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降解样品NGS用 cDNA文库构建SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 634938 SMARTer® Universal Low Input RNA Kit for Sequencing 10 Rxns ￥14,109 降解样品NGS用 cDNA文库构建SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing 降解样品NGS用 cDNA文库构建SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing 降解样品NGS用 cDNA文库构建SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing
Clontech 634940 SMARTer® Universal Low Input RNA Kit for Sequencing 25 Rxns ￥30,216 降解样品NGS用 cDNA文库构建SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing 降解样品NGS用 cDNA文库构建SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing 降解样品NGS用 cDNA文库构建SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing
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SMARTer Universal Low Input RNA Kit—
降解样品NGS用 cDNA文库构建
· 灵敏度高，适用微量样品—适用于200 pg 去除rRNA的RNA样品（来自于2-100 ng总RNA）99%
· 从低品质样品中获得有效结果—FFPE样品的理想解决方案
· 高质量RNA-seq数据—在起始量范围内获得一致的 RNA-seq 数据 (200 pg-10 ng)
    ○ 简便-起始到结束不到4小时
    ○ 重复再现性 > 0.98
    ○ ERCC 相关性 > 0.99
    ○ 基因数 > 15,000
· 包括RT和PCR酶的完整试剂盒
· 请参考下表选择合适试剂：
 
cDNA 合成试剂 RNA-Seq 文库制备
SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing (Code Nos. 634938, 634940)   Ion Torrent 或 Illumina 试剂 (不包含)
 
SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing为微量低品质样品，如低RIN值或不含Poly A的mRNA样品提供了一种简便、高效的构建cDNA用于RNA-seq的解决方案，起始量可以低至200 pg去除rRNA的RNA（来自2-100 ng总RNA）。SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing设计专用FFPE或激光捕获样品的RNA-seq，在转录本覆盖度，重复性，比对率和ERCC相关性方面都优于现有方法。采用本试剂制备的cDNA兼容Illumina 和Ion Torrent微量文库制备试剂盒。
对于10-100 ng 总RNA中的rRNA去除，推荐使用 RiboGone – Mammalian kit。
 
其他样品起始量解决方案：
· 250 pg-10 ng总RNA，推荐使用 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2- Pico Input Mammalian
· 100 ng-1 μg总RNA，推荐使用 SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian
 
产品详情请点击：降解样品NGS用 cDNA文库构建SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing
 
 

页面更新：2024-02-01 08:24:37

TCR NGS文库构建试剂盒SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2酶试剂盒Takara Clontech

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上海金畔生物科技有限公司代理Takara酶试剂盒全线产品，欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

TCR NGS文库构建试剂盒SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 634478 SMARTer® Human TCR a/b Profiling Kit v2 12 Rxns ￥24,557 TCR NGS文库构建试剂盒SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2 TCR NGS文库构建试剂盒SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2 TCR NGS文库构建试剂盒SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2
Clontech 634479 SMARTer® Human TCR a/b Profiling Kit v2 48 Rxns ￥53,723 TCR NGS文库构建试剂盒SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2 TCR NGS文库构建试剂盒SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2 TCR NGS文库构建试剂盒SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2
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· 适合不同起始量样本：支持total RNA(10 ng-1 μg外周血淋巴细胞来源或 1 ng-100 ng T细胞来源 total RNA)，或者纯化后完整的T细胞（1,000-10,000个）起始；
· 无需多对引物：每次反应仅需一对引物扩增相应的TCR亚基；
· 更灵敏特异的克隆型分析：优化的cDNA文库构建技术，确保克隆型的可靠分析；
· 添加UMI校正：引入UMI建库，校正PCR偏差及测序错误产生的reads；
· 更可靠的样本-数据拆析结果：整合UDI建库，在高通量型Illumina测序仪上有更好的样本拆析与测序可靠性；
· 更灵活的测序平台选择：可自由选择Miseq平台（分析V(D)J 全长信息），或是其它Illumina平台（分析CDR3区），支持最多192个样本同时测序；
 
■ 产品说明
T细胞是获得性免疫反应的重要组成部分，其表面受体蛋白（T cell receptors, TCRs）发挥着识别抗原分子的作用。NGS是解析TCR多样性的主流技术，对揭示个体获得性免疫反应的奥秘提供了宝贵的技术支撑。
SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2 (TCRv2)是一款具有更高重复性和特异性的TCR NGS文库构建试剂盒。该试剂盒整合SMART（Switching Mechanism at 5′ end of RNA Template）全长cDNA合成技术与5’RACE技术，可捕获TRA和TRB基因完整的V(D)J可变区，用于后续NGS分析。
TCRv2试剂盒支持不同input量的RNA（RIN≥8，取决于样本类型）或细胞起始，均可获得高品质的测序文库，如外周血淋巴细胞total RNA(10 ng-1 μg)、T细胞total RNA(1 ng-100 ng)，或纯化后完整的T细胞(1,000-10,000个)。文库中可同时包含α链和β链的多样性信息。
同时，TCRv2试剂盒包含UMI（Unique Molecular Identifier），用以去除PCR偏差及测序错误所产生的reads，提供更正确和可靠的结果。
相较于前代产品，TCRv2所建文库支持更多样的测序平台。既支持Miseq平台（分析V(D)J全长信息），也支持其它Illumina平台（分析CDR3区）。 此外，TCRv2试剂盒还整合了UDI（Unique Dual Index），能更正确拆析采用图案化流动槽技术（Patterned flow cell）测序平台（如NovaSeq™ system）的下机数据，同时也支持更多样本同时测序。
 
■ 建库原理
TCR NGS文库构建试剂盒SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2
 
TCR NGS文库构建试剂盒SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2
 
■ 不同起始量克隆型检测数据
TCR NGS文库构建试剂盒SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2
图1 不同的RNA或者T细胞起始量，均能获得高灵敏性和重复性的克隆型检测数据
 
Takara科学家以1、10、100 ng 人CD3+ T细胞total RNA和1,000、10,000个CD3+T细胞制备TRA和TRB文库，测序reads用Cogent NGS Immune Profiler软件分析。结果显示，无论采用RNA还是以复杂度较高的T细胞直接起始，TCRv2试剂盒所建文库均能获得良好的克隆型检测数据。
 
■ 灵敏度测试数据
TCR NGS文库构建试剂盒SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2
图2 Takara科学家向100 ng PBMC RNA样本中掺入不同浓度（10%，1%，0.1%，0.01%，0.001%和0.0001%）的Jurkat T细胞RNA（包含TRBV12-3-TRBJ1-2克隆型）。采用TCRv2试剂盒扩增TRB CDR3区域并制备文库、NextSeq系统测序。测序reads downsample至 2.5M reads。灰色标记的是所混入的Jurkat RNA检出下限，结果显示，在未通过UMI数据校正时，TRBV12-3的检测极限为0.01%，但是在UMI数据校正的情况下，检测极限下探至0.001%！
 
■ 同类产品比较实验
TCR NGS文库构建试剂盒SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2
图3 为了比较不同TCR分析方法（DNA based VS RNA based）的性能差异，Takara科学家分别以TCRv2（RNA based, 5’RACE）、Company X（RNA based，接头连接法）、Company Y(DNA based, 多重PCR)作为文库构建方案。接着分离了500万个PBMC细胞作为gDNA和RNA的提取材料，并以1.6 μg gDNA和100 ng RNA制备文库，分析TCR a/b文库的克隆型数量。从结果中可以看出，TCRv2文库获得TRA和TRB基因平均4.87万和16.3万个克隆型检测数据，远高于Company X RNA方法及Company Y DNA方法所获得克隆型数量！
*NT Not Tested
数据来源于Takara Bio USA, Inc.
 
SMART Human TCR-Seq v2：
点击图片下载
TCR NGS文库构建试剂盒SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2
 
产品详情请点击：TCR NGS文库构建试剂盒SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2
 
点击查看：Cogent NGS Immune Profiler Software
 
点击查看：更多数据
 

页面更新：2024-01-31 13:53:04

NGS文库定量酶试剂盒Takara Clontech

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NGS文库定量
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 638325 DNA Standards for Library Quantification 50 Rxns ￥2,859 NGS文库定量 NGS文库定量 NGS文库定量
Clontech 638324 Library Quantification Kit 500 Rxns ￥7,288 NGS文库定量 NGS文库定量 NGS文库定量
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NGS文库定量 延伸 NGS文库定量 → NGS文库定量 → NGS文库定量
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高性能的文库定量试剂盒
Library Quantification Kit
· 可以对Illumina测序文库进行高灵敏度定量
· 基于qPCR的方法，可以对低浓度的文库进行定量
· 只特异性检出含有接头的DNA
· 添加了四种已知浓度的标准样品
 
产品详情请点击：NGS文库定量
 
 
 

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