NEBNext 多样本接头引物试剂盒 1(双端检索引物,8×12种) #E7600S 96 次反应-NEB酶试剂 New England Biolabs

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产品资料 – RNA 试剂 – 二代测序 RNA 文库制备试剂

NEBNext 多样本接头引物试剂盒 1(双端检索引物,8×12种)                              收藏

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产品特点

·提高连接效率
·极大降低接头二聚体
·增加文库产量 
·增加样品识别特异性 (双端检索)
·大量单端检索/可用检索 
·提供检索表和样本示例表

概述

NEBNext 接头是为 DNA、ChIP DNA 和 RNA(不包括 Small RNA)文库构建而设计的,能够确保接头的高效连接及文库的高产量,并且最大限度的减少接头二聚体的形成。NEBNext 接头包含一个特殊的发卡环状结构,能够更高效的和经末端修复的带 dA 尾的 DNA 结合。环状结构包含一个 U,当 U 被 USER 酶(由 UDG 和内切酶 VIII 组合而成)切掉后,环状结构打开,使它可以成为 PCR 的反应底物。检索序列通过 PCR 引入文库,从而实现了多样本的制备。NEBNext 接头引物不仅能够用于 NEBNext 产品,也可以用于其它的兼容 Illumina 标准平台的文库制备法。

提供单端和双端检索引物。同时也提供用于重亚硫酸盐测序的甲基化接头。
   
 
NEBNext 多样本接头引物试剂盒 1(双端检索引物,8x12种)                               #E7600S 96 次反应

功能验证

每个试剂盒都通过对基因组 DNA、ChIP DNA 和 mRNA 进行文库构建,并在 Illumina 平台测序进行验证。   


请联系我们。 NEBNextSelector.neb.com 可以使用在线产品选择工具进行产品选择。

NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 4(Unique 双端 Index 引物,UMI 接头,适用于 DNA) #E7878L 384 次反应-NEB酶试剂 New England Biolabs

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产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于 Illumina 测序平台/接头 & 引物

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#E7878L
384 次反应
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#E7878S
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 NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 1(Unique 双端 Index 引物,UMI 接头,适用于 DNA)

#E7395S        96 次反应
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NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 2(Unique 双端 Index 引物,UMI 接头,适用于 DNA)
#E7874S        96 次反应
#E7874L      384 次反应
 
NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 3(Unique 双端 Index 引物,UMI 接头,适用于 DNA)
#E7876S        96 次反应
#E7876L      384 次反应
 

 

产品特点:

 

接头引物可用于 PCR-free 的文库扩增
提高样本识别特异性
高效稳定的连接效率
更灵敏地检测低频单核苷酸变异(SNV)
可支持更高通量
 

概述:

 用于 Illumina® 平台的 NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 4(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)为更精简、标记更多样本的 NGS 文库制备所设计,可以在单分子水平追踪测序反应,并在生物信息学水平去除错配 Reads,以获得最佳准确性。这些接头引物包含一对唯一的双端索引(i5 和 i7)和一段 UMI 序列,使制备的文库可以在有或没有 PCR 的情况下实现多重标记。该产品包含 96 个独特的、预混的含有 UMIs 的接头引物,包装在一个一次性的密封着可穿刺的铝箔封板膜 96 孔板中。通用引物在单独试管中提供。

 
NEBNext® 多样本接头引物系列产品可用于 NEBNext® 文库制备产品或其它标准的 Illumina® 平台兼容的文库制备流程。除该产品外,还有另外三款适用于 DNA 的含 Unique 双端 UMI 接头的 NEBNext® 多样本接头引物试剂盒(NEB #E7395、#E7874 和 #E7876),可用于标记 384 个样本;也可提供适用于 RNA 测序的 NEBNext® Unique 双端 UMI 接头(NEB #E7416)。对于不需要 UMI 标记的样本,NEBNext® 提供了多款产品便于灵活选择:96 种 Unique 双端 Index 引物(NEB #E6440、#E6442、#E6444、#E6446 和 #E6448)、8 x 12 种双端 Index 引物(NEB #E7600 和 #E7780)、单端 Index 引物(12 种和 96 种单端 Index 引物,NEB #E7335、#E7500、#E7710、#E7730 和 #E6609)和可适用于 EM-seq™ 和重亚硫酸盐测序的接头引物试剂盒(NEB #E7140)。
 
大宗订购,可通过我们的客户定制解决方案团队进行产品定制或批量采购。请通过 custom@neb-china.com 与我们联系。
 
用于 Illumina® 平台的 NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 4(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)能够同时适用于 PCR-free 和基于扩增的 DNA 文库制备流程。请参阅下图以了解更多区别。
NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 4(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)实验流程
 
NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 4(Unique 双端 Index 引物,UMI 接头,适用于 DNA)                               #E7878L 384 次反应
 

产品描述:

 

NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 4(Unique 双端 Index 引物,UMI 接头,适用于 DNA)                               #E7878L 384 次反应

NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 4(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)可实现更高的连接效率。
A)以 100 ng、250 ng 和 500 ng 的人 NA19240 基因组 DNA(Coriell Institute for Biomedical Research)为起始样本,使用 NEBNext® UltraII FS DNA 文库制备试剂盒(NEB #E7805)和图中相应供应商提供的接头引物制备文库,不进行 PCR 扩增。所使用的接头引物分别为:NEBNext® 多样本接头引物试剂盒(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)、xGen® Dual Index UMI Adapters (IDT®) 和 Nextflex® Unique Dual index Barcodes 1-96 (Bioo Scientific®)。连接后,使用 SPRIselect 磁珠进行两轮纯化,使用 NEBNext® 文库定量试剂盒(Illumina®)(NEB #E7630)对文库进行定量。
B)以 100 ng NA19240 基因组 DNA 为起始样本,使用 Ultra II FS DNA 文库制备试剂盒在 96 孔板中制备 90 个文库,不进行 PCR 扩增。所使用的 NEB、IDT 和 Bioo 的 30 个接头引物如图所示。磁珠纯化后,进行 qPCR 定量。
 
NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 4(Unique 双端 Index 引物,UMI 接头,适用于 DNA)                               #E7878L 384 次反应
NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 4(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)可更灵敏地检测低频变异。
AcroMetrix® 肿瘤 Hotspot Control DNA(Thermo Scientific®)作为突变 DNA 源(> 500 个突变,等位基因频率为 5-35%),以不同比例与 NA19240 基因组 DNA 混合,产生一系列不同的等位基因频率(5%-35%、2.5%-17.5% 和 1%-7%)。使用 NEBNext® Ultra II DNA 文库制备试剂盒(NEB #E7645)和 NEBNext® 多样本接头引物试剂盒(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)制备文库,并使用 Twist Bioscience® 的 152 个基因的定制 panel 对所有样本进行多重杂交捕获。文库使用 Illumina NovaSeq® 6000(PE140)进行测序,Reads 被降采样至 1.1 亿,并使用 BWA MEM(0.7.17)比对至 hg38。在不使用 UMI 序列或构建 UMI 共有序列(Fgbio 0.8.1)的情况下,使用 MarkDuplicates(Picard 2.20.6)分析比对上的 reads。使用 Strelka2(2.9.10)从最终的 BAM 文件中分析体细胞突变。
(A)当使用 UMIs 删除重复序列,所得的 SNV 总数和正确的数量都增加。
(B)用 UMI 进行共有序列比较,能提高检测灵敏度。等位基因频率越低,UMIs 在 SNV 检测中的优势就越大。
 

 NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 4(Unique 双端 Index 引物,UMI 接头,适用于 DNA)                               #E7878L 384 次反应
NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 4(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)可实现一致的文库产量。
以 50 ng 的人 NA19240 基因组 DNA(Coriell Institute for Biomedical Research)为起始样本,使用 NEBNext® Ultra II FS PCR-free DNA 文库制备试剂盒(NEB #E6177)和 NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 2(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)在 96 孔板中制备每个文库。文库经纯化后,进行 qPCR 定量。96 个样本之间的文库浓度从 3.4 nM 到 7.3 nM,差异为 2.1 倍。
 
NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 4(Unique 双端 Index 引物,UMI 接头,适用于 DNA)                               #E7878L 384 次反应
 
NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 4(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)可在 MiSeq® 和 NovaSeq 6000 上实现一致的聚类效率。
图注:使用 NEBNext® Ultra II FS PCR-free DNA 文库制备试剂盒(NEB #E6177)和 NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 4(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)制备 96 个文库,以等摩尔浓度合并后在 Illumina MiSeq 和 NovaSeq 6000 上测序。对所有文库的总 Reads 数进行合计,并测定每个文库贡献的总 Reads 数的比例(每个文库的预期比例 = 1.04%)。所有 96 个文库都能实现一致的聚类效率,并在两个测序平台上实现预期频率。
NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 4(Unique 双端 Index 引物,UMI 接头,适用于 DNA)                               #E7878L 384 次反应
使用 NEBNext® 多样本接头引物试剂盒(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)制备 384 个文库,可在 Illumina NovaSeq 6000 测序平台上实现一致的聚类效率。
使用 NEBNext® Ultra II FS PCR-free DNA 文库制备试剂盒(NEB #E6177)和 NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 1-4(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)制备 384 个文库,以等摩尔浓度合并后在 Illumina NovaSeq 6000 上测序。对所有文库的总 Reads 数进行合计,并测定每个文库贡献的总 Reads 数的比例(每个文库的预期比例 = 0.26%)。所有 384 个文库都能实现一致的聚类效率,并在测序平台上实现预期频率。
 

 

NEBNext®多样本接头引物试剂盒 1(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA) #E7395L 384 次反应-NEB酶试剂 New England Biolabs

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产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于 Illumina 测序平台/接头 & 引物

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相关产品:

NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 1(Unique 双端 UMI 接头,适用于 RNA)

产品特点:

·接头引物可用于 PCR-free 的文库扩增 

 ·  高效稳定的连接效率

 ·  更灵敏地检测低频单核苷酸变异(SNV

 · 可支持更高通量

概述:

 用于 Illumina® 平台的 NEBNext® 多样本接头引物是 NEBNext® 文库制备系列产品的重要组成部分,有多种不同的产品可用于 NEBNext® 产品或其它标准的 Illumina® 平台兼容的文库制备流程。该产品经设计和优化,适用于包括 PCR-free 在内的 DNA 测序流程。这些独特的双端检索引物接头还分别包含一段唯一的分子标签序列(UMI,以便识别和删除扩增文库中的 PCR 错误或重复。提供 96 个独特的、预混的含有 UMIs 的接头引物,包装在一个一次性的密封着可穿刺的铝箔封板膜 96 孔板中。PCR 扩增需要的通用引物也包含在内。

可提供适用于 RNA 测序的 NEBNext® Unique 双端 UMI 接头(NEB #E7416),也可提供单端、双端和 Unique 双端引物以及优化的接头。

产品描述:

 NEBNext®多样本接头引物试剂盒 1(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)                               #E7395L 384 次反应

NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 1Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)可实现更高的连接效率。A)以 100 ng250 ng 500 ng 的人 NA19240 基因组 DNACoriell Institute for Biomedical Research)为起始样本,使用 NEBNext® Ultra II FS DNA 文库制备试剂盒(NEB #E6177)和图中相应供应商提供的接头引物制备文库,不进行 PCR 扩增。连接后,使用 SPRIselect 磁珠进行两轮纯化,使用 NEBNext® 文库定量试剂盒(NEB #E7630)对文库进行定量。B) 100 ng NA19240 基因组 DNA 为起始样本,使用 Ultra II FS DNA 文库制备试剂盒在 96 孔板中制备 90 个文库,供应商提供的 30 个接头引物如图所示,不进行 PCR 扩增。两轮磁珠纯化后,进行 qPCR 定量。

 

NEBNext®多样本接头引物试剂盒 1(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)                               #E7395L 384 次反应

 

NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 1Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA可更灵敏地检测低频变异。AcroMetrix 肿瘤 Hotspot Control DNAThermo Scientific® #969056)作为突变 DNA 源(>500个突变,等位基因频率为 5-35%),以不同比例与 NA19240 基因组 DNA 混合,产生一系列不同的等位基因频率。使用 NEBNext® Ultra II DNA 文库制备试剂盒(NEB #E7645)和 NEBNext® Unique 双端 UMI 接头制备文库,并使用 Twist Bioscience® 152 个基因的定制 panel 对所有样本进行多重杂交捕获。文库使用 Illumina NovaSeq® 测序,Reads 降采样1.1 亿,并使用 BWA MEM0.7.17)比对至 hg38。在不使用 UMI 序列或构建 UMI 共有序列(Fgbio 0.8.1)的情况下,使用 MarkDuplicatesPicard 2.20.6)分析比对上的 reads。使用 Strelka22.9.10)从最终的 BAM 文件中分析体细胞突变。(A)当使用 UMIs 删除重复序列,所得的 SNV 总数和正确的数量都增加。(B)用 UMI 进行共有序列比较,能提高检测灵敏度。等位基因频率越低,UMIs SNV 检测中的优势就越大。

实验流程:

 NEBNext®多样本接头引物试剂盒 1(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)                               #E7395L 384 次反应

NEBNext 多样本接头引物试剂盒 2(96 种 Unique 双端) #E6442L 384 rxns-NEB酶试剂 New England Biolabs

上海金畔生物科技有限公司代理New England Biolabs(NEB)酶试剂全线产品,欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于 Illumina 测序平台/接头 & 引物

NEBNext 多样本接头引物试剂盒 2(96 种 Unique 双端)                              收藏

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#E6442L
384 rxns
25,119.00

#E6442S
96 rxns
6,979.00

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产品特点

·提高连接效率
·极大降低接头二聚体
·增加文库产量
·增加样品识别特异性(双端检索)
·独特的双端检索引物对可以检测标签跳跃
·大量单端检索/可用检索
·提供检索表和样本示例表
 

概述

NEBNext 接头是为 DNA、ChIP DNA 和 RNA(不包括 Small RNA)文库构建而设计的,能够确保接头的高效连接及文库的高产量,并且最大限度的减少接头二聚体的形成。NEBNext 接头包含一个特殊的发卡环状结构,能够更高效的和经末端修复的带 dA 尾的 DNA 结合。环状结构包含一个 U,当 U 被 USER® 酶(由 UDG 和内切酶 VIII 组合而成)切掉后,环状结构打开,使它可以成为 PCR 的反应底物。检索序列通过 PCR 引入文库,从而实现了多样本的制备。NEBNext 接头引物不仅能够用于 NEBNext 产品,也可以用于其它的兼容 Illumina 标准平台的文库制备方法。
 
提供单端和双端检索引物。双端检索引物可以解决 Illumina 测序仪标签跳跃(Index hopping)的问题。
 
功能验证
每个试剂盒都通过文库构建,并在 Illumina 平台测序进行验证。
 
 
 NEBNext 多样本接头引物试剂盒 2(96 种 Unique 双端)                               #E6442L 384 rxns

贮存温度

-20°C

 

请联系我们。 NEBNextSelector.neb.com 可以使用在线产品选择工具进行产品选择。

 

NEBNext 多样本接头引物试剂盒 3 (96 种 Unique 双端) #E6444L 384 rxns-NEB酶试剂 New England Biolabs

上海金畔生物科技有限公司代理New England Biolabs(NEB)酶试剂全线产品,欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于 Illumina 测序平台/接头 & 引物

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货 号
规 格
价 格(元)
北京库存
上海库存
广州库存
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#E6444L
384 rxns
25,119.00

#E6444S
96 rxns
6,979.00

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产品特点

·提高连接效率
·极大降低接头二聚体
·增加文库产量
·增加样品识别特异性(双端检索)
·独特的双端检索引物对可以检测标签跳跃
·大量单端检索/可用检索
·提供检索表和样本示例表
 

概述

NEBNext 接头是为 DNA、ChIP DNA 和 RNA(不包括 Small RNA)文库构建而设计的,能够确保接头的高效连接及文库的高产量,并且最大限度的减少接头二聚体的形成。NEBNext 接头包含一个特殊的发卡环状结构,能够更高效的和经末端修复的带 dA 尾的 DNA 结合。环状结构包含一个 U,当 U 被 USER® 酶(由 UDG 和内切酶 VIII 组合而成)切掉后,环状结构打开,使它可以成为 PCR 的反应底物。检索序列通过 PCR 引入文库,从而实现了多样本的制备。NEBNext 接头引物不仅能够用于 NEBNext 产品,也可以用于其它的兼容 Illumina 标准平台的文库制备方法。
 
提供单端和双端检索引物。双端检索引物可以解决 Illumina 测序仪标签跳跃(Index hopping)的问题。
 
功能验证
每个试剂盒都通过文库构建,并在 Illumina 平台测序进行验证。
 
 
 NEBNext 多样本接头引物试剂盒 3 (96 种 Unique 双端)                               #E6444L 384 rxns

贮存温度

-20°C

 

请联系我们。 NEBNextSelector.neb.com 可以使用在线产品选择工具进行产品选择。

 

NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 2(Unique 双端 Index 引物,UMI 接头,适用于 DNA) #E7874L 384 次反应-NEB酶试剂 New England Biolabs

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产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于 Illumina 测序平台/接头 & 引物

NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 2(Unique 双端 Index 引物,UMI 接头,适用于 DNA)                              收藏

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#E7874L
384 次反应
32,559.00

#E7874S
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#E7876L      384 次反应
 
NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 4(Unique 双端 Index 引物,UMI 接头,适用于 DNA)
#E7878S        96 次反应
#E7878L      384 次反应
 

产品特点:

接头引物可用于 PCR-free 的文库扩增

提高样本识别特异性
高效稳定的连接效率
更灵敏地检测低频单核苷酸变异(SNV)
可支持更高通量

概述:

用于 Illumina® 平台的 NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 2(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)为更精简、标记更多样本的 NGS 文库制备所设计,可以在单分子水平追踪测序反应,并在生物信息学水平去除错配 Reads,以获得最佳准确性。这些接头引物包含一对唯一的双端索引(i5 和 i7)和一段 UMI 序列,使制备的文库可以在有或没有 PCR 的情况下实现多重标记。该产品包含 96 个独特的、预混的含有 UMIs 的接头引物,包装在一个一次性的密封着可穿刺的铝箔封板膜 96 孔板中。通用引物在单独试管中提供。
 
NEBNext® 多样本接头引物系列产品可用于 NEBNext® 文库制备产品或其它标准的 Illumina® 平台兼容的文库制备流程。除该产品外,还有另外三款适用于 DNA 的含 Unique 双端 UMI 接头的 NEBNext® 多样本接头引物试剂盒(NEB #E7395、#E7876 和 #E7878),可用于标记 384 个样本;也可提供适用于 RNA 测序的 NEBNext® Unique 双端 UMI 接头(NEB #E7416)。对于不需要 UMI 标记的样本,NEBNext® 提供了多款产品便于灵活选择:96 种 Unique 双端 Index 引物(NEB #E6440、#E6442、#E6444、#E6446 和 #E6448)、8 x 12 种双端 Index 引物(NEB #E7600 和 #E7780)、单端 Index 引物(12 种和 96 种单端 Index 引物,NEB #E7335、#E7500、#E7710、#E7730 和 #E6609)和可适用于 EM-seq™ 和重亚硫酸盐测序的接头引物试剂盒(NEB #E7140)。
 
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用于 Illumina® 平台的 NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 2(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)能够同时适用于 PCR-free 和基于扩增的 DNA 文库制备流程。请参阅下图以了解更多区别。
NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 2(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)实验流程
 
NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 2(Unique 双端 Index 引物,UMI 接头,适用于 DNA)                               #E7874L 384 次反应

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NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 2(Unique 双端 Index 引物,UMI 接头,适用于 DNA)                               #E7874L 384 次反应 

NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 2(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)可实现更高的连接效率。

A)以 100 ng、250 ng 和 500 ng 的人 NA19240 基因组 DNA(Coriell Institute for Biomedical Research)为起始样本,使用 NEBNext® UltraII FS DNA 文库制备试剂盒(NEB #E7805)和图中相应供应商提供的接头引物制备文库,不进行 PCR 扩增。所使用的接头引物分别为:NEBNext® 多样本接头引物试剂盒(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)、xGen® Dual Index UMI Adapters (IDT®) 和 Nextflex® Unique Dual index Barcodes 1-96 (Bioo Scientific®)。连接后,使用 SPRIselect 磁珠进行两轮纯化,使用 NEBNext® 文库定量试剂盒(Illumina®)(NEB #E7630)对文库进行定量。
B)以 100 ng NA19240 基因组 DNA 为起始样本,使用 Ultra II FS DNA 文库制备试剂盒在 96 孔板中制备 90 个文库,不进行 PCR 扩增。所使用的 NEB、IDT 和 Bioo 的 30 个接头引物如图所示。磁珠纯化后,进行 qPCR 定量。

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NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 2(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)可更灵敏地检测低频变异。
AcroMetrix® 肿瘤 Hotspot Control DNA(Thermo Scientific®)作为突变 DNA 源(> 500 个突变,等位基因频率为 5-35%),以不同比例与 NA19240 基因组 DNA 混合,产生一系列不同的等位基因频率(5%-35%、2.5%-17.5% 和 1%-7%)。使用 NEBNext® Ultra II DNA 文库制备试剂盒(NEB #E7645)和 NEBNext® 多样本接头引物试剂盒(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)制备文库,并使用 Twist Bioscience® 的 152 个基因的定制 panel 对所有样本进行多重杂交捕获。文库使用 Illumina NovaSeq® 6000(PE140)进行测序,Reads 被降采样至 1.1 亿,并使用 BWA MEM(0.7.17)比对至 hg38。在不使用 UMI 序列或构建 UMI 共有序列(Fgbio 0.8.1)的情况下,使用 MarkDuplicates(Picard 2.20.6)分析比对上的 reads。使用 Strelka2(2.9.10)从最终的 BAM 文件中分析体细胞突变。
(A)当使用 UMIs 删除重复序列,所得的 SNV 总数和正确的数量都增加。
(B)用 UMI 进行共有序列比较,能提高检测灵敏度。等位基因频率越低,UMIs 在 SNV 检测中的优势就越大。

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NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 2(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)可实现一致的文库产量。
以 50 ng 的人 NA19240 基因组 DNA(Coriell Institute for Biomedical Research)为起始样本,使用 NEBNext® Ultra II FS PCR-free DNA 文库制备试剂盒(NEB #E6177)和 NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 2(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)在 96 孔板中制备每个文库。文库经纯化后,进行 qPCR 定量。96 个样本之间的文库浓度从 3.4 nM 到 7.3 nM,差异为 2.1 倍。

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NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 2(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)可在 MiSeq® 和 NovaSeq 6000 上实现一致的聚类效率。
图注:使用 NEBNext® Ultra II FS PCR-free DNA 文库制备试剂盒(NEB #E6177)和 NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 2(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)制备 96 个文库,以等摩尔浓度合并后在 Illumina MiSeq 和 NovaSeq 6000 上测序。对所有文库的总 Reads 数进行合计,并测定每个文库贡献的总 Reads 数的比例(每个文库的预期比例 = 1.04%)。所有 96 个文库都能实现一致的聚类效率,并在两个测序平台上实现预期频率。

NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 2(Unique 双端 Index 引物,UMI 接头,适用于 DNA)                               #E7874L 384 次反应 
使用 NEBNext® 多样本接头引物试剂盒(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)制备 384 个文库,可在 Illumina NovaSeq 6000 测序平台上实现一致的聚类效率。
使用 NEBNext® Ultra II FS PCR-free DNA 文库制备试剂盒(NEB #E6177)和 NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 1-4(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)制备 384 个文库,以等摩尔浓度合并后在 Illumina NovaSeq 6000 上测序。对所有文库的总 Reads 数进行合计,并测定每个文库贡献的总 Reads 数的比例(每个文库的预期比例 = 0.26%)。所有 384 个文库都能实现一致的聚类效率,并在测序平台上实现预期频率。