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NEBNext®多样本接头引物试剂盒 1（Unique 双端 UMI 接头，适用于 DNA） 收藏
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相关产品：
NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 1（Unique 双端 UMI 接头，适用于 RNA）
产品特点：
·接头引物可用于 PCR-free 的文库扩增
· 高效稳定的连接效率
· 更灵敏地检测低频单核苷酸变异（SNV）
· 可支持更高通量
概述：
用于 Illumina® 平台的 NEBNext® 多样本接头引物是 NEBNext® 文库制备系列产品的重要组成部分，有多种不同的产品可用于 NEBNext® 产品或其它标准的 Illumina® 平台兼容的文库制备流程。该产品经设计和优化，适用于包括 PCR-free 在内的 DNA 测序流程。这些独特的双端检索引物接头还分别包含一段唯一的分子标签序列（UMI），以便识别和删除扩增文库中的 PCR 错误或重复。提供 96 个独特的、预混的含有 UMIs 的接头引物，包装在一个一次性的密封着可穿刺的铝箔封板膜 96 孔板中。PCR 扩增需要的通用引物也包含在内。
可提供适用于 RNA 测序的 NEBNext® Unique 双端 UMI 接头（NEB #E7416），也可提供单端、双端和 Unique 双端引物以及优化的接头。
产品描述：
NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 1（Unique 双端 UMI 接头，适用于 DNA）可实现更高的连接效率。A）以 100 ng、250 ng 和 500 ng 的人 NA19240 基因组 DNA（Coriell Institute for Biomedical Research）为起始样本，使用 NEBNext® Ultra II FS DNA 文库制备试剂盒（NEB #E6177）和图中相应供应商提供的接头引物制备文库，不进行 PCR 扩增。连接后，使用 SPRIselect 磁珠进行两轮纯化，使用 NEBNext® 文库定量试剂盒（NEB #E7630）对文库进行定量。B)以 100 ng NA19240 基因组 DNA 为起始样本，使用 Ultra II FS DNA 文库制备试剂盒在 96 孔板中制备 90 个文库，供应商提供的 30 个接头引物如图所示，不进行 PCR 扩增。两轮磁珠纯化后，进行 qPCR 定量。
NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 1（Unique 双端 UMI 接头，适用于 DNA）可更灵敏地检测低频变异。AcroMetrix 肿瘤 Hotspot Control DNA（Thermo Scientific® #969056）作为突变 DNA 源（>500个突变，等位基因频率为 5-35%），以不同比例与 NA19240 基因组 DNA 混合，产生一系列不同的等位基因频率。使用 NEBNext® Ultra II DNA 文库制备试剂盒（NEB #E7645）和 NEBNext® Unique 双端 UMI 接头制备文库，并使用 Twist Bioscience® 的 152 个基因的定制 panel 对所有样本进行多重杂交捕获。文库使用 Illumina NovaSeq® 测序，Reads 被降采样至 1.1 亿，并使用 BWA MEM（0.7.17）比对至 hg38。在不使用 UMI 序列或构建 UMI 共有序列（Fgbio 0.8.1）的情况下，使用 MarkDuplicates（Picard 2.20.6）分析比对上的 reads。使用 Strelka2（2.9.10）从最终的 BAM 文件中分析体细胞突变。（A）当使用 UMIs 删除重复序列，所得的 SNV 总数和正确的数量都增加。（B）用 UMI 进行共有序列比较，能提高检测灵敏度。等位基因频率越低，UMIs 在 SNV 检测中的优势就越大。
实验流程：
