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SMARTer PrepX试剂盒SMARTer PrepX试剂（Illumina Sequencing）酶试剂盒Takara Clontech

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SMARTer PrepX试剂盒SMARTer PrepX试剂（Illumina Sequencing）
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 640103 PrepX™ ILMN Barcodes 1-24 24 barcodes 询价 SMARTer PrepX试剂盒SMARTer PrepX试剂（Illumina Sequencing） SMARTer PrepX试剂盒SMARTer PrepX试剂（Illumina Sequencing）
Clontech 640107 PrepX™ ILMN Barcodes 1-96 96 barcodes 询价 SMARTer PrepX试剂盒SMARTer PrepX试剂（Illumina Sequencing） SMARTer PrepX试剂盒SMARTer PrepX试剂（Illumina Sequencing）
Clontech 640101 PrepX™ DNA Library Kit 24 samples 询价 SMARTer PrepX试剂盒SMARTer PrepX试剂（Illumina Sequencing） SMARTer PrepX试剂盒SMARTer PrepX试剂（Illumina Sequencing） SMARTer PrepX试剂盒SMARTer PrepX试剂（Illumina Sequencing）
Clontech 640102 PrepX™ DNA Library Kit 96 samples 询价 SMARTer PrepX试剂盒SMARTer PrepX试剂（Illumina Sequencing） SMARTer PrepX试剂盒SMARTer PrepX试剂（Illumina Sequencing） SMARTer PrepX试剂盒SMARTer PrepX试剂（Illumina Sequencing）
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SMARTer PrepX试剂盒——简单、自动化的NGS文库制备（For Illumina Sequencing）
· 一次性预分装联排管，不同试剂间使用颜色标记区分
· 在有效范围内，无论起始量高低，均能生成重复性好、质量高的NGS文库
· 良好应对各种实验样本通量
 
■ 应用领域
· 一致的DNA-seq、RNA-seq、ChIP-seq文库制备无缝式解决方案
· Illumina测序平台测序文库自动化制备，无需大量繁琐的手动操作
 
■ 产品说明
SMARTer PrepX试剂盒SMARTer PrepX试剂（Illumina Sequencing） SMARTer PrepX系列试剂盒提供了Illumina测序文库制备必需的每一种试剂。相关试剂已预分装在单次使用的联排管中，并使用不同的颜色区分标记，可以轻松完成SMARTer Apollo系统操作台面布置工作。SMARTer PrepX系列试剂盒和相关程序脚本的设计融入了灵活性，以适应不同样本通量的需求。设置过程十分简单：只需按照图形用户界面的相关提示将试剂放到指定位置，布置好操作台面，点击“Run”即可，无需人员看管。
 
■ 性能表现
样本起始量和样本质量对于任何测序应用来说都需要着重注意。在实验流程中使用过多的样品或得到的产量很低意味着浪费材料、拖延实验进度、糟糕的实验结果、下游测序实验难以开展。SMARTer PrepX试剂盒配合相关程序脚本通过生成一致的、高质量的NGS文库解决这些困扰。在有效的范围内，不再担心样本起始浓度的影响（Table I）。
 
  Table I. 可靠的测序覆盖度和表现
  Input amount   10 ng   100 ng
  Adapter reads (%)   0   0
  Confidently mapped read (%)   96.61   96.43
  Repetitive reads (%)   1.84   1.80
  Low-quality reads (%)   0   0
 
上述实验，使用SMARTer Apollo系统，搭配SMARTer PrepX DNA Library Kit，从10 ng和100 ng E. coli基因组DNA中完成高质量文库制备。获得的文库使用Illumina MiSeq®平台进行测序（2 × 150 bp）。
 
■ 上样量要求
每一种SMARTer PrepX试剂与一个对应不同通量的脚本相兼容，有最小样本上样量的需求。相关总结见Table II。
 
  Table II. SMARTer PrepX kits与SMARTer Apollo预编程脚本不同组合所需样本量
Code No. SMARTer Apollo试剂盒 兼容脚本 脚本通量 最小上样量/样本
640101*  SMARTer PrepX DNA Library Kit PrepX ILMN 8 1-8  1 ng DNA
640102*  SMARTer PrepX DNA Library Kit  PrepX ILMN 32i 4-32  1 ng DNA
 
* Code No.640101提供足够运行24个样本的试剂量，每批次多达8个样本。Code No. 640102提供足够运行96个样本的试剂量，每批次多达32个样本。
 
 
 
产品详情请点击：SMARTer PrepX试剂盒SMARTer PrepX试剂（Illumina Sequencing）
 
 
 
 

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人单细胞TCR profiling分析SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit酶试剂盒Takara Clontech

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人单细胞TCR profiling分析SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 634431 SMARTer® Human scTCR a/b Profiling Kit 96 Rxns ￥50,363 人单细胞TCR profiling分析SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit 人单细胞TCR profiling分析SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit 人单细胞TCR profiling分析SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit
Clontech 634432 SMARTer® Human scTCR a/b Profiling Kit 480 Rxns ￥155,860 人单细胞TCR profiling分析SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit 人单细胞TCR profiling分析SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit 人单细胞TCR profiling分析SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit
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SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit—
阐明单细胞中T细胞受体Alpha-Beta 链配对
· 工作流程灵活—可以利用FACS（流式细胞术）或手动分选细胞构建 Illumina测序文库
· 易于使用—优化的index允许将96个细胞混合制成12个文库，
   并可以进一步混合在一个flow-cell lane中测序
· 灵敏度高—基于RACE方法可以检测低丰度TCR变异体
· 特异性好—完整reads，大部分reads可以比对到目标区域，提供准确链配对信息
 
尽管批量T细胞测序有助于进一步了解T细胞受体库（TCR）多样性，但是批量测序不能确定T细胞群内特定的alpha-beta 受体链配对信息。由于特定的TCR alpha-beta链配对介导抗原特异性，获得配对信息对于深入了解抗原识别，靶向免疫治疗TCR的有效设计至关重要，也有助于确立T细胞群的祖先关系。单个T细胞测序可以确定特定细胞的配对信息，但是价格可能非常昂贵并涉及复杂的分析，因为大部分方法需要对大量的细胞测序。
 
使用SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit可以解决这些问题，在SMART cDNA Synthesis中通过采用一系列indexed oligo可以将手动或FACS分选的96个样品制成12个测序pool，并且这12个pool可以进一步混合，这样所有的96个样品可以在一个flow-cell lane 中测序。与用于大量样品测序的SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit 一样，试剂采用了SMART cDNA synthesis和RACE方法，通过进一步的TCR基因特异性PCR完整捕获和扩增TCR-alpha 和TCR-beta可变区构建Illumina测序文库，为TCR测序提供了一种高灵敏度的方法。
 
如果您需要软件对采用本试剂盒构建文库测序获得的数据进行demultiplex分析，请登录SMARTer Human scTCR Demultiplexer。
 
人单细胞TCR profiling分析SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit
图1. 在单细胞水平进行T细胞研究的优势。
 
Panel A. T细胞受体alpha链 (TCR-α) 和beta链组成示意图。 Panel B. 示意了难以从批量细胞测序数据中获得alpha链 (TCR-α) 和beta链配对信息。针对稀有克隆型可以分析部分细胞中的配对信息（橙色克隆型），但是对于高表达的克隆型(TCRA V2J1, TCRA V2J2, TCRB V3D1J1, TCRB V2D1J2)可能有4种配对组合。
 
人单细胞TCR profiling分析SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit
图2. SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit技术流程及pooling策略。
 
Panel A. 第一链cDNA合成由dT引物（RT引物）起始，MMLV型逆转录酶（RT）会在mRNA 5’端添加几个非模板核苷酸。SMART-Seq Indexed Oligos与这几个非模板核苷酸互补结合作为模板，通过RT在第一链cDNA末端添加额外核苷酸序列（也就是模板转换步骤）。试剂盒中提供8种不同的SMART-Seq Indexed Oligo，每一个SMART-Seq Indexed Oligo中内嵌唯一的六碱基index作为细胞barcode，用于下游pooling细胞的识别。通过RT添加到cDNA末端的额外序列-被称为“SMART sequence”-作为接下来几轮PCR扩增的引物结合位点，确保只有来自于全长cDNA的序列才能被扩增。经过pool（Panel B所示）和纯化后，通过连续两轮基因特异性PCR扩增来自于TCR-α 和/或 TCR-β可变区的cDNA序列。第一轮PCR采用扩增过的双链cDNA为模板，正向引物与SMART sequence互补，同时包含Illumina Read 2序列（TCR Primer 1），反向引物与TCR-α和TCR-β的恒定区（即不变区）互补（TCR a/b Human Primer 1）。第二轮PCR以第一轮PCR产物为模板，采用的正向引物与第一轮PCR添加的Read 2 序列互补。反向引物与恒定区结合，位于PCR1 primers内侧 (TCR a/b Human Primer 2 Reverse HT Index)，扩增TCR-α和TCR-β cDNA的完整可变区及部分恒定区。正向引物和反向引物包含适用于Illumina测序平台的接头序列和index，可以将多达96个样品混合用于在一个flow-cell lane中测序。Panel B. 按列混合样品，这样每个pool中包含8个细胞，每个细胞带有不同index的SMART-Seq Indexed Oligo 。在PCR 2中通过正向和反向HT indexes的不同组合使用，可以将多样品进一步混合在一个flow-cell lane 中测序（更多信息参见User Manual）。
 
人单细胞TCR profiling分析SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit
图3. 96孔板中混合细胞群的分析。
 
Panel A. 基于鉴别每孔的克隆型确定细胞种类。遗漏的7个细胞没能通过对高于阈值的TCR-α 或TCR-β的reads数分析确定克隆型。Panel B. 配对信息分析。分析获得了平板中34个细胞的TCR-αβ配对克隆型。Panel C. 以百分比展示了分析细胞的alpha，beta，或alpha-beta配对信息。遗漏的细胞没有包括在分析数据中。
 
 
Technote：
点击图片查看		 人单细胞TCR profiling分析SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit   SMART human scTCR-seq：
点击图片下载		 人单细胞TCR profiling分析SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit
 
产品详情请点击：人单细胞TCR profiling分析SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit
 
 
视频资料：在单细胞水平对人T细胞受体库分析的解决方案
人单细胞TCR profiling分析SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit
Takara Bio USA公司Dr. Ankita Das和Dr. Sarah Taylor探讨可以实现分析每个细胞中的TCRα和TCRβ链的可变区全长序列，构建测序文库的SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit。
 

页面更新：2024-01-31 13:52:35

SMARTer Apollo系统专用耗材酶试剂盒Takara Clontech

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SMARTer Apollo系统专用耗材
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 640088 Apollo™ 1.1 mL MiniTubes 960 tubes 询价 SMARTer Apollo系统专用耗材 SMARTer Apollo系统专用耗材
Clontech 640089 Apollo™ 96 Tip Rack Each 询价 SMARTer Apollo系统专用耗材 SMARTer Apollo系统专用耗材
Clontech 640086 Apollo™ Caps for 0.2 ml PCR 8-Tube Strips, Clear 125 caps 询价 SMARTer Apollo系统专用耗材 SMARTer Apollo系统专用耗材
Clontech 640084 Apollo™ Filter Tips 5 racks 询价 SMARTer Apollo系统专用耗材 SMARTer Apollo系统专用耗材
Clontech 640085 Apollo™ Piercing Tips 1000 tips 询价 SMARTer Apollo系统专用耗材 SMARTer Apollo系统专用耗材
Clontech 640087 Apollo™ Reservoirs 100 reservoirs 询价 SMARTer Apollo系统专用耗材 SMARTer Apollo系统专用耗材
Clontech 640082 SMARTer™ Apollo™ 0.2 ml PCR 8-Tube Strips, Clear 125 strips 询价 SMARTer Apollo系统专用耗材 SMARTer Apollo系统专用耗材
Clontech 640083 SMARTer™ Apollo™ Microtiter Plates 25 plates 询价 SMARTer Apollo系统专用耗材 SMARTer Apollo系统专用耗材
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SMARTer Apollo系统相关耗材
 
■ 产品说明
SMARTer Apollo系统专用耗材 我们提供多种SMARTer Apollo系统相关耗材制品，包括储液槽，离心管，管盖，平板，吸头，耗材支架。相关耗材和SMARTer Apollo试剂、程序脚本配合使用，为自动化DNA-seq，RNA-seq，ChIP-seq应用提供完整、易行、一致性良好的文库制备解决方案。
 
■ 产品图片
SMARTer Apollo系统专用耗材 SMARTer Apollo系统专用耗材
Apollo™ 1.1 ml MiniTubes
 Apollo™ 96 Tip Rack
 
SMARTer Apollo系统专用耗材 SMARTer Apollo系统专用耗材
Apollo™ Caps for 0.2 ml PCR 8-Tube Strips, Clear
 Apollo™ Filter Tips
 
SMARTer Apollo系统专用耗材 SMARTer Apollo系统专用耗材
Apollo™ Piercing Tips
 Apollo™ Reservoirs
 
SMARTer Apollo系统专用耗材 SMARTer Apollo系统专用耗材
SMARTer™ Apollo™ 0.2 ml PCR 8-Tube Strips, Clear
 SMARTer™ Apollo™ Microtiter Plates
 
 
 
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困难样本建库-SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian酶试剂盒Takara Clontech

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困难样本建库-SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 635005 SMARTer® Stranded Total RNA-Seq Kit – Pico Input Mammalian(库存销售完毕即终卖) 12 Rxns ￥16,311 困难样本建库-SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian 困难样本建库-SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian 困难样本建库-SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian
Clontech 635006 SMARTer® Stranded Total RNA-Seq Kit – Pico Input Mammalian(库存销售完毕即终卖) 48 Rxns ￥47,874 困难样本建库-SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian 困难样本建库-SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian 困难样本建库-SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian
Clontech 634411 SMARTer® Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian 12 Rxns ￥13,396 困难样本建库-SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian 困难样本建库-SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian 困难样本建库-SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian
Clontech 634412 SMARTer® Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian 48 Rxns ￥45,546 困难样本建库-SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian 困难样本建库-SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian 困难样本建库-SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian
Clontech 634413 SMARTer® Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian 96 Rxns ￥59,918 困难样本建库-SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian 困难样本建库-SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian 困难样本建库-SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian
Clontech 634414 SMARTer® Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian 192 Rxns ￥107,811 困难样本建库-SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian 困难样本建库-SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian 困难样本建库-SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian
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SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input
Mammalian以皮克级总RNA构建Illumina链特性RNA-seq文库
· 皮克级样品起始—可以250 pg-10 ng人，小鼠或大鼠总RNA起始
· 用途广泛—可以不同品质RNA（包括FFPE/LCM样品及游离RNA）制备文库，获得高重复再现数据
· 性能提升-不增加PhiX也可获得较高的簇通过过滤百分比（FP%），识别更多转录本，重复更少
· 保留链来源信息—转录本链来源信息识别准确度高
· 快速，一体化流程—整体流程只需~6 h ，改良了buffer配方，缩短了文库纯化时间
· 无缝衔接Illumina测序—直接制备多达96种index的 Illumina®-ready文库
 
SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian设计用于从皮克级总RNA(250 pg–10 ng)中高效制备Illumina测序文库。本试剂中采用的技术适用于高品质，部分降解及低品质RNA（如来自于FFPE或LCM样品）。本试剂是一体化操作流程，保留了链来源信息，并且不需要下游文库制备，在反转录和PCR扩增过程中就可以添加indexes和接头。升级产品与原有SMARTer 皮克级产品相比，提升了在所有Illumina测序平台的测序性能，并且文库纯化操作更加方便。
核糖体RNA在总RNA中占有很高的比重（~90%）。在制备文库前从总RNA中去除掉这些大量的RNA，有利于降低测序成本，提高统计数据的比对比率。但是在以微量样品起始时，如果一开始就从总RNA中去除rRNA，会造成纯化后的起始样品太少而不能制备高品质测序文库，本试剂采用专有的特异针对哺乳动物rRNA和部分线粒体RNA的探针去除核糖体cDNA（来源于核糖体RNA的cDNA片段）。采用本试剂制备的文库与前代试剂制备的文库接头配置不同，即使是使用基于双通道SBS技术的Illumina平台如NextSeq®， MiniSeq™， 和 HiSeq® 3000/4000测序时，不需要添加大量PhiX也可以获得高比例的簇通过过滤百分比(%PF)。每个run可以获得更多的生物学相关测序reads，这又反过来减少了测序成本。采用Pico v2 Kit同样可以获得更多的特异转录本，更低的rRNA、mtRNA比对率和重复率。此外，Pico v2 Kit包含了一种新的PCR buffer，提高了文库纯化效率。
试剂盒提供12，48，96和192次反应规格。高通量版本试剂 (Code No. 634413,634414) 包含12种反向引物，8种正向引物，最多可以构建96种indexes文库。包括文库构建及纯化的整体流程只需~6 h。
 
不同样品起始量解决方案：
· 10-100 ng 总RNA, 推荐使用 SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit – Low Input Mammalian
· 100 ng-1 μg总RNA, 推荐使用SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian
 
困难样本建库-SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian
图1. SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian技术流程
 
困难样本建库-SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian
图2. SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian提高了通过过滤百分比（FP%）。如图所示，分别采用Pico v1 或Pico v2制备文库并使用NextSeq 500 或 MiniSeq平台测序。图中，蓝色图框表示未过滤（原始）reads的簇密度分布，绿色图框表示通过过滤reads的簇密度分布。 图中显示了通过过滤的reads数（以百万计）和每个run的%PF。
 
困难样本建库-SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian
图3. 新的SeqAmp CB PCR buffer利于磁珠-沉淀物形成。Pico v2中的PCR buffer经过重新设计可以更快、更紧密的形成磁珠-沉淀物。经过磁力分离后，在新的SeqAmp CB buffer（右）中的沉淀物比原来PCR buffer（左）中的沉淀物更紧密。紧密的沉淀物比松散的沉淀物更容易干燥，易于重悬。
 
困难样本建库-SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian
图4. SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian 提升了灵敏度和重复再现性。上图为以1 ng和10 ng人肺FFPE来源的总RNA起始，分别采用Pico v1和Pico v2构建文库，NextSeq 500测序数据。Panel A. 以1 ng和10 ng样品起始，分别采用Pico v1和v2构建文库的测序数据。Panel B. 不同样品起始量之间，转录本表达水平的比较分析。
 
Technote：
点击图片查看
困难样本建库-SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian
困难样本RNA-Seq建库策略
困难样本建库-SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian
 
 
延伸阅读
病原微生物NGS解决方案来了，您准备好项目了吗？
Takara真香推荐—简便准确好用的液态活检解决方案之游离RNA篇
『石以砥焉，化钝为利！』Takara匠心打磨FFPE样本分析利器
 
产品详情请点击：困难样本建库-SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian
 
 

页面更新：2023-11-14 14:11:56

降解样品NGS用 cDNA文库构建SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing酶试剂盒Takara Clontech

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降解样品NGS用 cDNA文库构建SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 634938 SMARTer® Universal Low Input RNA Kit for Sequencing 10 Rxns ￥14,109 降解样品NGS用 cDNA文库构建SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing 降解样品NGS用 cDNA文库构建SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing 降解样品NGS用 cDNA文库构建SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing
Clontech 634940 SMARTer® Universal Low Input RNA Kit for Sequencing 25 Rxns ￥30,216 降解样品NGS用 cDNA文库构建SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing 降解样品NGS用 cDNA文库构建SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing 降解样品NGS用 cDNA文库构建SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing
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SMARTer Universal Low Input RNA Kit—
降解样品NGS用 cDNA文库构建
· 灵敏度高，适用微量样品—适用于200 pg 去除rRNA的RNA样品（来自于2-100 ng总RNA）99%
· 从低品质样品中获得有效结果—FFPE样品的理想解决方案
· 高质量RNA-seq数据—在起始量范围内获得一致的 RNA-seq 数据 (200 pg-10 ng)
    ○ 简便-起始到结束不到4小时
    ○ 重复再现性 > 0.98
    ○ ERCC 相关性 > 0.99
    ○ 基因数 > 15,000
· 包括RT和PCR酶的完整试剂盒
· 请参考下表选择合适试剂：
 
cDNA 合成试剂 RNA-Seq 文库制备
SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing (Code Nos. 634938, 634940)   Ion Torrent 或 Illumina 试剂 (不包含)
 
SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing为微量低品质样品，如低RIN值或不含Poly A的mRNA样品提供了一种简便、高效的构建cDNA用于RNA-seq的解决方案，起始量可以低至200 pg去除rRNA的RNA（来自2-100 ng总RNA）。SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing设计专用FFPE或激光捕获样品的RNA-seq，在转录本覆盖度，重复性，比对率和ERCC相关性方面都优于现有方法。采用本试剂制备的cDNA兼容Illumina 和Ion Torrent微量文库制备试剂盒。
对于10-100 ng 总RNA中的rRNA去除，推荐使用 RiboGone – Mammalian kit。
 
其他样品起始量解决方案：
· 250 pg-10 ng总RNA，推荐使用 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2- Pico Input Mammalian
· 100 ng-1 μg总RNA，推荐使用 SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian
 
产品详情请点击：降解样品NGS用 cDNA文库构建SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing
 
 

页面更新：2024-02-01 08:24:37

T细胞受体分析SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit酶试剂盒Takara Clontech

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T细胞受体分析SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 635016 SMARTer® Human TCR a/b Profiling Kit(库存销售完毕即终卖) 96 Rxns ￥65,464 T细胞受体分析SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit T细胞受体分析SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit T细胞受体分析SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit
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SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit—
获得TCR-α和TCR-β链V(D)J可变区全长序列
· 完整的 V(D)J序列信息—获得TCR mRNA转录本可变区全长序列
· TCR-alpha 和 TCR-beta—分析TCR2个亚基的多样性，无论是同一实验还是单独实验
· 起始样品灵活—可以10 ng-3 μg 外周血RNA或50-10,000个纯化T细胞起始
· 无需多重PCR—每次反应利用一对引物扩增相应的TCR亚基
· Illumina-ready 测序文库—无需接头连接即可添加Illumina接头和index序列
· 灵敏度高—即使是测序深度很低的情况下也可检测低丰度TCR序列
· 出色的重复性—在不同起始量情况下可以获得一致性很好的结果
 
SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit给需要开展T细胞受体（TCR）NGS分析的研究者提供了一种新的强大的解决方案。试剂盒采用类似于5’RACE的方法，可以人血液RNA(10 ng-3 μg)或完整淋巴细胞(50-10,000 个纯化T细胞)起始，捕获TCR V(D)J完整可变区域。顾名思义，本试剂可以在同一实验或单独实验中获得TCR-alpha和TCR-beta链多样性数据。与采用多重PCR方法研究TCR多样性不同，每轮文库扩增只使用针对不同TCR亚基的一个引物对扩增。构建的文库添加了index序列可用于Illumina®测序平台测序。
试剂采用了SMART (Switching Mechanism at 5’ End of RNA Template)技术和LNA技术，可以无偏扩增TCR mRNA序列，并具有很高的灵敏度。
 
T细胞受体分析SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit
图1. SMARTer 法文库构建流程及TCR多样性分析PCR策略
 
 
Technote：
点击图片查看		 T细胞受体分析SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit SMART human TCR-Seq：
点击图片下载		 T细胞受体分析SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit
 
产品详情请点击：T细胞受体分析SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit
 
 

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人单细胞TCR profiling分析SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit酶试剂盒Takara Clontech

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人单细胞TCR profiling分析SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 634431 SMARTer® Human scTCR a/b Profiling Kit 96 Rxns ￥50,363 人单细胞TCR profiling分析SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit 人单细胞TCR profiling分析SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit 人单细胞TCR profiling分析SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit
Clontech 634432 SMARTer® Human scTCR a/b Profiling Kit 480 Rxns ￥155,860 人单细胞TCR profiling分析SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit 人单细胞TCR profiling分析SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit 人单细胞TCR profiling分析SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit
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SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit—
阐明单细胞中T细胞受体Alpha-Beta 链配对
· 工作流程灵活—可以利用FACS（流式细胞术）或手动分选细胞构建 Illumina测序文库
· 易于使用—优化的index允许将96个细胞混合制成12个文库，
   并可以进一步混合在一个flow-cell lane中测序
· 灵敏度高—基于RACE方法可以检测低丰度TCR变异体
· 特异性好—完整reads，大部分reads可以比对到目标区域，提供准确链配对信息
 
尽管批量T细胞测序有助于进一步了解T细胞受体库（TCR）多样性，但是批量测序不能确定T细胞群内特定的alpha-beta 受体链配对信息。由于特定的TCR alpha-beta链配对介导抗原特异性，获得配对信息对于深入了解抗原识别，靶向免疫治疗TCR的有效设计至关重要，也有助于确立T细胞群的祖先关系。单个T细胞测序可以确定特定细胞的配对信息，但是价格可能非常昂贵并涉及复杂的分析，因为大部分方法需要对大量的细胞测序。
 
使用SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit可以解决这些问题，在SMART cDNA Synthesis中通过采用一系列indexed oligo可以将手动或FACS分选的96个样品制成12个测序pool，并且这12个pool可以进一步混合，这样所有的96个样品可以在一个flow-cell lane 中测序。与用于大量样品测序的SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit 一样，试剂采用了SMART cDNA synthesis和RACE方法，通过进一步的TCR基因特异性PCR完整捕获和扩增TCR-alpha 和TCR-beta可变区构建Illumina测序文库，为TCR测序提供了一种高灵敏度的方法。
 
如果您需要软件对采用本试剂盒构建文库测序获得的数据进行demultiplex分析，请登录SMARTer Human scTCR Demultiplexer。
 
人单细胞TCR profiling分析SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit
图1. 在单细胞水平进行T细胞研究的优势。
 
Panel A. T细胞受体alpha链 (TCR-α) 和beta链组成示意图。 Panel B. 示意了难以从批量细胞测序数据中获得alpha链 (TCR-α) 和beta链配对信息。针对稀有克隆型可以分析部分细胞中的配对信息（橙色克隆型），但是对于高表达的克隆型(TCRA V2J1, TCRA V2J2, TCRB V3D1J1, TCRB V2D1J2)可能有4种配对组合。
 
人单细胞TCR profiling分析SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit
图2. SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit技术流程及pooling策略。
 
Panel A. 第一链cDNA合成由dT引物（RT引物）起始，MMLV型逆转录酶（RT）会在mRNA 5’端添加几个非模板核苷酸。SMART-Seq Indexed Oligos与这几个非模板核苷酸互补结合作为模板，通过RT在第一链cDNA末端添加额外核苷酸序列（也就是模板转换步骤）。试剂盒中提供8种不同的SMART-Seq Indexed Oligo，每一个SMART-Seq Indexed Oligo中内嵌唯一的六碱基index作为细胞barcode，用于下游pooling细胞的识别。通过RT添加到cDNA末端的额外序列-被称为“SMART sequence”-作为接下来几轮PCR扩增的引物结合位点，确保只有来自于全长cDNA的序列才能被扩增。经过pool（Panel B所示）和纯化后，通过连续两轮基因特异性PCR扩增来自于TCR-α 和/或 TCR-β可变区的cDNA序列。第一轮PCR采用扩增过的双链cDNA为模板，正向引物与SMART sequence互补，同时包含Illumina Read 2序列（TCR Primer 1），反向引物与TCR-α和TCR-β的恒定区（即不变区）互补（TCR a/b Human Primer 1）。第二轮PCR以第一轮PCR产物为模板，采用的正向引物与第一轮PCR添加的Read 2 序列互补。反向引物与恒定区结合，位于PCR1 primers内侧 (TCR a/b Human Primer 2 Reverse HT Index)，扩增TCR-α和TCR-β cDNA的完整可变区及部分恒定区。正向引物和反向引物包含适用于Illumina测序平台的接头序列和index，可以将多达96个样品混合用于在一个flow-cell lane中测序。Panel B. 按列混合样品，这样每个pool中包含8个细胞，每个细胞带有不同index的SMART-Seq Indexed Oligo 。在PCR 2中通过正向和反向HT indexes的不同组合使用，可以将多样品进一步混合在一个flow-cell lane 中测序（更多信息参见User Manual）。
 
人单细胞TCR profiling分析SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit
图3. 96孔板中混合细胞群的分析。
 
Panel A. 基于鉴别每孔的克隆型确定细胞种类。遗漏的7个细胞没能通过对高于阈值的TCR-α 或TCR-β的reads数分析确定克隆型。Panel B. 配对信息分析。分析获得了平板中34个细胞的TCR-αβ配对克隆型。Panel C. 以百分比展示了分析细胞的alpha，beta，或alpha-beta配对信息。遗漏的细胞没有包括在分析数据中。
 
 
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视频资料：在单细胞水平对人T细胞受体库分析的解决方案
人单细胞TCR profiling分析SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit
Takara Bio USA公司Dr. Ankita Das和Dr. Sarah Taylor探讨可以实现分析每个细胞中的TCRα和TCRβ链的可变区全长序列，构建测序文库的SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit。
 

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小鼠T细胞受体分析SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit酶试剂盒Takara Clontech

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上海金畔生物科技有限公司代理Takara酶试剂盒全线产品，欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

小鼠T细胞受体分析SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 634402 SMARTer® Mouse TCR a/b Profiling Kit(库存销售完毕即终卖) 12 Rxns ￥13,172 小鼠T细胞受体分析SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit 小鼠T细胞受体分析SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit 小鼠T细胞受体分析SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit
Clontech 634403 SMARTer® Mouse TCR a/b Profiling Kit 48 Rxns ￥43,804 小鼠T细胞受体分析SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit 小鼠T细胞受体分析SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit 小鼠T细胞受体分析SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit
Clontech 634404 SMARTer® Mouse TCR a/b Profiling Kit 96 Rxns ￥69,022 小鼠T细胞受体分析SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit 小鼠T细胞受体分析SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit 小鼠T细胞受体分析SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit
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SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit—
获得TCR-α和β链 V(D)J可变区全长序列
· 完整的V(D)J序列信息—获得TCR mRNA转录本可变区的全长序列
· TCR-α和β链—同时或单独分析TCR两个亚基的多样性
· 无需多重PCR—每次反应利用一对引物扩增相应的TCR亚基
· Illumina-ready测序文库—无需接头连接即可添加Illumina接头和index序列
 
SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit 为那些寻求对T细胞受体（TCR）库进行NGS分析的研究者提供了一种强大的新的解决方案。试剂基于5’-RACE 方法可以捕获TCR转录本完整V(D)J 可变区，可以低至10 ng 至500 ng的来源于小鼠脾脏、胸腺或PBMCs的总RNA起始，也可以1,000 至 10,000个纯化的T细胞起始。顾名思义，本试剂可以在同一实验或单独实验中获得α和β链链多样性数据。
与采用多重PCR方法研究TCR多样性不同，每轮文库扩增只使用针对不同TCR亚基的一对引物扩增，提高了效率，减少了引物二聚体形成的可能性。基于多重PCR的分析方法，众所周知容易形成与引物相关的序列特异性偏差；这些偏差在我们基于RACE的方法中不会存在，因为所有的可变区都由相同的恒定区序列引发。采用本试剂~4 h即可构建indexed文库用于Illumina平台测序。
试剂采用了SMART (Switching Mechanism at 5’ End of RNA Template) 技术和LNA技术，可以无偏扩增TCR mRNA序列，并具有很高的灵敏度。
 
小鼠T细胞受体分析SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit
图1. SMARTer 法文库构建流程及TCR多样性分析PCR策略
 
 
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B细胞受体分析SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit酶试剂盒Takara Clontech

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B细胞受体分析SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 634466 SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit 12 Rxns ￥15,150 B细胞受体分析SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit B细胞受体分析SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit B细胞受体分析SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit
Clontech 634467 SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit 48 Rxns ￥43,997 B细胞受体分析SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit B细胞受体分析SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit B细胞受体分析SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit
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SMARTer® Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit
捕获人的BCR转录本完整V(D)J 可变区
· 起始样品量: 从外周血单核细胞（PBMC）纯化的10 ng-1μg的总RNA或从B细胞纯化的1-100 ng的总RNA
· 通过添加UMI，校正来自PCR错误、重复序列以及序列错误的读取
· cDNA文库构建经过优化，可以灵敏、特异地检测克隆型
· 可准确扩增并通过测序鉴别人IgG亚类
· 经过优化的PCR pooling策略，可以高灵敏度地从同一样品中检测不同链
· 灵活的pooling策略适用于不同的实验需求，以比对、识别原始链序列
· 可以使用Cogent NGS Immune Profiler Software进行序列数据分析的完整工作流程
 
新推出的SMARTer Human BCR IgG H/K/L Profiling Kit基于5’RACE和NGS技术，提供了一种灵敏，准确，优化的BCR库分析方法。通过5’RACE方法减少了变异性并且可以从BCR重链或轻链的恒定区引发扩增。该试剂盒将这些优点与基因特异性扩增相结合可以捕获BCR完整V(D)J可变区，提供了一种高灵敏度、可重复的B细胞库分析方法。
该试剂盒设计的可以从外周血单核细胞（PBMC）纯化的10 ng-1μg的总RNA或从B细胞纯化的1-100 ng的总RNA，生成Illumina文库。可以为人免疫球蛋白IgG和IgM的重链和轻链（κ和λ）生成数据。该试剂盒还包括特别的分子条形码（UMI），从而可以消除PCR错误或duplication以及测序偏向，从而确保获得更准确和可靠的结果。
测序结束后，可以使用Takara Bio Immune Profiler Software分析数据，该软件使用基于UMI的纠错功能，并可以使用MIGEC（Shugay，2014年）和MiXCR软件（Bolotin，2015年）。该软件支持高质量的BCR分析，包括克隆型计数和鉴别以及V(D)J区域的序列信息。
 
B细胞受体分析SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit
图1. SMARTer Human BCR IgG H/K/L Profiling Kit技术流程
 
Panel A 第一链cDNA合成由dT引物（RT引物）起始，MMLV衍生的SMARTScribe反转录酶会在mRNA模板5’末端添加几个非模板核苷酸。SMART UMI Oligos与这几个非模板核苷酸互补结合作为模板，通过RT在第一链cDNA末端添加额外核苷酸序列（也就是模板转换步骤）。然后第一链cDNA经过两轮基因特异性的PCR扩增（详见Panel B）。第二轮的巢式PCR扩增可以确保绝大多数的reads比对到B细胞受体的转录本上。
 
Panel B 第一轮PCR以第一链cDNA为模板，引物包括与Illumina Read Primer 2序列互补的正向引物（PCR1 Universal Forward primer），以及与BCR重链或轻链恒定区互补的反向引物（PCR1 IgG/IgM/IgK/IgL Reverse primers）。以Read Primer 2序列和恒定区起始，第一轮PCR特异性扩增了BCR重链或轻链cDNA的完整可变区及部分恒定区。第二轮PCR以第一轮PCR的产物为模板，采用半巢式引物（PCR2 IgG/IgM/IgK/IgL Reverse primers）扩增BCR重链或轻链的cDNA的完整可变区及部分恒定区。
 
B细胞受体分析SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit
图2. 从1-100 ng B细胞RNA中鉴定出的克隆型信号
 
从1 ng，10 ng和100 ng人CD19 + B细胞总RNA中，利用本试剂盒制备BCR分析IgG，IgM，IgK和IgL文库。为了进行分析，对于1 ng，10 ng和100 ng的RNA起始，分别将文库down-sampling至100,000个，400,000个和5,000,000个reads，然后利用Takara Bio Immune Profiler Software处理。
 
B细胞受体分析SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit
图3. 散点图展示了用1μg PBMC RNA生成的文库之间的一致性
 
以来自健康供体的1μg PBMC RNA起始，一式两份制备IgG，IgM，IgK和IgL文库。通过down-sampling至1300万次读取来分析该文库。该图包括来自技术重复的所有四个文库（IgG，IgM，IgK和IgL）。
 
B细胞受体分析SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit
图4. 来自不同供体的PBMC RNA的克隆型计数
 
对来自8个供体的10 ng PBMC RNA（不同颜色代表不同供体），分别使用SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit来鉴别IgG，IgM，IgK和IgL的克隆型。文库归一化为100,000 reads以进行分析。
 
B细胞受体分析SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit
图5. 10 ng PBMC RNA文库的测序饱和度评估
 
以来自单个供体的10 ng PBMC RNA起始，使用SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Kit制备BCR分析文库。
 
Panel A 显示了不同测序深度的IgG克隆型计数，其中蓝线和紫线分别是指经过UMI修正误差和没有经过UMI修正误差的数据。IgG和其他链（IgM，IgK和IgL未在图中展示）按每个文库150万个读数进行测序，然后通过down-sampling至1,000K，500K，200K，100K，50K，10K和5K reads。使用Takara Bio Immune Profiler Software分析不同测序深度的结果。
 
Panel B 维恩图显示了低测序深度（100K）和高测序深度（1,500K）的文库之间重叠的克隆型。
 
 
 
 
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SMARTer Human BCR：
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