核酸消化混合液 #M0649S 50 reactions-NEB酶试剂 New England Biolabs

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产品资料 – DNA修饰酶与克隆技术 – 核酸酶

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核酸消化混合液                                 #M0649S 50 reactions 核酸消化混合液                                 #M0649S 50 reactions

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#M0649S
50 reactions
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特性

  Convenient one-step protocol
  Digests both DNA and RNA to single nucleosides
  Low-glycerol formulation significantly reduces glycerol-induced ion suppression during MS analysis

概述

核苷消化混合液是复合酶,能一步将 DNA 或 RNA 消化成单核苷,省去了多步耗时的消化步骤,特别适用于液相色谱-质谱(LC-MS)定量分析。

反应条件

1X Nucleoside Digestion Mix Reaction Buffer.   Incubate at 37°C.

贮存温度

-20°C

注意事项

1.  Dilution of the Nucleoside Digestion mix may result in a decrease of enzymatic activity and incomplete

      digestion of substrate. Therefore, we recommend using 1 µL of the Nucleoside Digestion Mix for

      digestion of samples containing < 1 µg of DNA or RNA substrate.
2.  Samples containing a large number of modifications (particularly modifications at the ribose 2´-position)

     may benefit from overnight incubation with the Nucleoside Digestion Mix in order to achieve complete

     digestion. No signal deterioration has been observed by incubating DNA or RNA samples with the

      Nucleoside Digestion Mix for up to 24 hours at 37°C. Alternatively, the ratio of Nucleoside Digestion

      Mix:nucleic acid may be increased from 1 μl/μg substrate to 5-10 μl/μg substrate to ensure complete

      digestion.
3.  Although it is not necessary to stop the reaction prior to LC-MS, the mix can be inactivated by the

     addition of EDTA (5 mM, final concentration).
4.  In order to reduce the ion suppression effects of glycerol, the Nucleoside Digestion Mix has been

     formulated to contain very little glycerol (<1%) and therefore the mix will freeze when stored at -20°C.

     The mix is stable for >2 years when stored at -20°C and can withstand 50 freeze-thaw cycles without

     significant activity loss.
5.  As carryover of certain reaction components (e.g., EDTA, detergents, etc) from upstream steps may

     result in incomplete digestion, it is highly recommended that DNA or RNA substrates be purified

     (column purification/phenol chloroform extraction) before digestion with the Nucleoside Digestion

     Mix.

NEBNext® 文库定量 DNA 标准品 #E7642S 500 reactions-NEB酶试剂 New England Biolabs

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产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于 Illumina 测序平台/文库定量

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#E7642S
500 reactions
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相关产品

NEBNext® 文库定量试剂盒

产品特点

与 NEBNext® 文库定量试剂盒(Illumina®)中的标准样品相同,为补充试剂

基于四个或六个标准样品的 qPCR 法文库定量
 

概述

 NEBNext® 文库定量 DNA 标准品包含六个标准样品,与 NEBNext® 文库定量试剂盒(Illumina®)一起使用,可建立从 100 pM 到 0.001 pM 的标准曲线。该标准品可作为 NEB #E7630L 中所含标准曲线试剂的补充装。NEB #E7630 产品说明书中包含了使用四个或六个标准样品设置标准曲线的详细步骤说明,从而为实验流程增添了灵活性。相较于同类型文库定量试剂盒,NEBNext® 文库定量试剂盒(Illumina®)提供了更简化的操作流程,并减少了批间差。

NEBNext® 文库定量试剂盒(Illumina®)的典型扩增和标准曲线
 NEBNext® 文库定量 DNA 标准品                               #E7642S 500 reactions
 
图 A 是 NEBNext® 文库定量试剂盒(Illumina®)在 Bio-Rad CFX96 Touch 上的典型结果,图 B 是 NEBNext® 文库定量试剂盒(Illumina®)在 Applied Biosystems 7500 Fast real-time qPCR instrument 上的典型结果。图左显示的是扩增曲线,图右显示的是标准曲线。两个仪器都使用了默认设置。ABI 7500 快速分析包含 1X ROX(低浓度)和 ROX 标准化。
 

O-糖蛋白酶 #P0761S 200 reactions-NEB酶试剂 New England Biolabs

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产品资料 – 糖生物学与蛋白质工具 – 蛋白酶

O-糖蛋白酶                              收藏

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#P0761S
200 reactions
9,429.00

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产品描述

 O-糖蛋白酶是一种高度特异性的蛋白酶,用于切割糖蛋白或糖肽上的肽键,该酶特异性识别粘蛋白型 O-连接糖(无论是否唾液酸化)的丝氨酸或苏氨酸残基,在其 N端进行切割。

产品特点

 ·用于 O-糖基化位点测定和 O-糖结构测定

·有效切割糖蛋白(无论是否唾液酸化),无需神经氨酸酶处理

·为重组酶,无其它蛋白酶污染

·可在变性或非变性条件下使用

·不含甘油,便于在 HPLC MS 分析中取得最佳效果。

·以溶液形式提供;具有长达 24 个月的最佳活性和稳定性

产品说明

 O-糖蛋白酶是一种高度特异性的蛋白酶,用于切割糖蛋白或糖肽上的肽键,该酶特异性识别粘蛋白型 O-连接糖(无论是否唾液酸化)的丝氨酸或苏氨酸残基,在其 N 端进行切割。O-糖蛋白酶含有 6 × His-tag,使用镍亲和树脂可轻松从反应体系中去除

O-糖蛋白酶                               #P0761S 200 reactions

来源:

基因克隆自铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa),在 E. coli 中表达。

模板置换反转录酶混合液 #M0466L 100 reactions-NEB酶试剂 New England Biolabs

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产品资料 – RNA 试剂 – cDNA 合成

模板置换反转录酶混合液                              收藏

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#M0466L
100 reactions
4,789.00

#M0466S
20 reactions
1,199.00

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概述

 模板置换反转录酶和其相应的反应缓冲液能够在反转录反应中有效地实现模板置换。混合液中含有独特的反转录酶和小鼠 RNase 抑制剂。与竞争对手的反转录酶产品不同,NEB 的产品不需要添加任何添加剂(如 PEG 或甜菜碱)来优化性能,从而简化了反应建立流程。与模板置换寡核苷酸(TSO)搭配使用, 合成的 cDNA 3’端可以选择性地加入已知序列。由此获得的 cDNA 可进行 PCR 扩增,也可作为 5’RACE( cDNA 末端快速扩增)或第二链 cDNA 合成的模板。

特性

  以极低起始量模板(单细胞/细胞核或 2 pg 总 RNA)制备 RNA-seq 文库

以最低起始量为 10 ng 的总 RNA 进行 5’RACE
降低 RNA-seq 或 5’RACE 的背景
该酶混合液包含小鼠 RNase 抑制剂,不需要额外添加
兼容各种模板置换寡核苷酸(TSOs)、反转录引物和 DNA 聚合酶,用于扩增全长 cDNA
与其他的 RNA-seq 方法(例如:Smart-Seq)相比,操作更快捷
 
模板置换反转录酶混合液中的反转录酶(RT)在其到达 RNA 模板的 5’末端后会添加几个非模板源的核苷酸。这几个非模板源的核苷酸可以与已知序列的模板置换寡核苷酸(TSO)退火,促使反转录酶从 RNA 模板上切换到 TSO 上。得到的 cDNA 含有 3’末端添加有已知序列(TSO 的互补序列)。该特征可用于多种下游应用,例如 cDNA 扩增、5’RACE(cDNA 末端快速扩增)和第二链 cDNA 合成。说明书中有优化的实验流程。
 
1:模板置换流程概览
 
 模板置换反转录酶混合液                               #M0466L 100 reactions
 
当到达 RNA 模板的 5’端时,反转录酶会在 cDNA 的 3’端添加几个非模板源的核苷酸。这些非模板源的核苷酸可以与包含已知序列的模板置换引物退火,从而促使反转录酶从 RNA 模板上切换到 TSO 上。所得到的 cDNA 在 3′ 端包含一个通用序列(TSO 的互补序列)
 
图 2:在单细胞 RNA-seq 实验中,模板置换反转录酶混合液相对于 Smart-seq2 方法的优势
 
模板置换反转录酶混合液                               #M0466L 100 reactions
 
gA.模板置换介导的 cDNA 扩增概述。反转录引物含有 5’接头,它与 TSO 一起在 cDNA 的 5’和 3’末端添加接头。之后可用识别接头序列的引物 PCR 扩增全部反转录产物。

B-D.使用 NEB 模板置换反转录酶混合液或 Smart-seq2 方法(Picelli, S. et al.(2014). Nat. Protoc. 9, 171-81),用 10 μg Universal Human Reference(UHR) RNA (Agilent)与 ERCC RNA Spike-In Mix I(Thermo Fisher Scientific)生成 cDNA 文库。然后使用 NEBNext® Ultra™ II FS DNA 文库制备试剂盒(NEB#E7805)将每个 cDNA 文库制成 Illumina 文库,并在 Nextseq 500 上使用 2 x 75 个循环测序。将测序采样 2 x 1.2 M 个 reads(除非另有说明),去掉接头 reads,并且使用 Prinseq 过滤。B.显示的是样品总 reads(Total reads)、去掉接头的 reads(Trimmed reads)和通过 Prinseq 过滤的 reads(Filtered reads)。插图列举了每种方法制备的 cDNA 文库的 Agilent Bioanalyzer 2100 结果。虚线框标注了非特异片段。C.使用 Salmon 将过滤的 reads 与 GENCODE 28 和 ERCC 转录物比对。图中的点表示从每个文库检测到的 TPM(每百万转录数)≥1 的转录物的数量作为测序深度。 D.使用 Hisat 2.0.7 将过滤的读数与 hg19 人参考基因组比对,并使用 Picard SAM / BAM RNA Seq Metrics 工具计算 RNA-seq 指标。该图显示了分布于外显子(红色),rRNA(橙色),内含子(绿色),基因间区域(蓝色)的匹配 reads 和不匹配 reads(灰色)的百分比。
 
 图 3:模板置换反转录酶混合液在 5’RACE 的实验中操作简单,性能优异
 
模板置换反转录酶混合液                               #M0466L 100 reactions

A.模板置换介导的 5’RACE 概述。在模板置换反转录反应后,用反向基因特异性引物和正向 TSO 特异性引物进行 5’RACE PCR。
B.使用 NEB 模板置换反转录酶混合液 5’RACE 方案(左)或 Clontech SMARTer 5’/3’RACE 试剂盒(右)对多种 RNA 靶标的 5’RACE 产物进行琼脂糖凝胶分析。加入 1 μg 的 Jurkat 总 RNA,10 pg 的 8 kb 合成 RNA 和 10 ng 的 ERCC RNA Mix 1,用于评估作为转录物长度和拷贝数的性能。在 NEB 的反应中,反转录引物为 oligo (dT)40 VN,TSO 为 GCTAATCATTGCAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACATrGrGrG,TSO 中特异性 PCR 引物用下划线标注。两种方法使用相同的基因特异性 PCR 引物。靶标名称和预期片段长度如图所示。
 
图 4:模板置换反转录酶混合液在第二链 cDNA 合成中操作简单,且可捕获完整的 5’末端转录产物
 

模板置换反转录酶混合液                               #M0466L 100 reactions
A.模板置换介导的第二链 cDNA 合成概述。在反转录反应后,RNA 模板水解,使用 TSO 作为引物延伸合成第二链 cDNA。
 
B.使用 1 kb 的合成 RNA 作为模板,使用 poly(dT)40 VN 作为第一链 cDNA 合成的反转录引物。使用模板置换介导的方法或 Gubler 在文献中描述的方法—R and Hoffman,BJ.(1983) Gene,25,263-269,对第二链 cDNA 合成进行三个平行实验。所得到的双链 cDNA 产物使用反向引物用 Sanger 法对第二链 cDNA 进行测序。结果显示模板含有转录起始位点(TSS),并标注出了匹配序列。 添加到 cDNA 末端的 TSO 序列用灰色标注。未通过 Gubler 和 Hoffman 方法检测到的序列用蓝色标注。不可信读序区用黄色标注。
随产品提供的试剂
 
 
 

储存温度()

浓度

模板置换反转录缓冲液

-20

4 X

 
 
产品类别:
cDNA合成和反转录产品
PCR,qPCR 和 扩增技术产品
 
应用
cDNA 合成
RNA 分析
 
储存温度
-20°C 
 

 

Authenticase® 切割错配核酸酶 #M0689L 125 reactions-NEB酶试剂 New England Biolabs

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Authenticase® 切割错配核酸酶                              收藏

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#M0689L
125 reactions
7,199.00

#M0689S
25 reactions
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产品特点

 
能够识别错配和插入/缺失(indel),并在其外侧酶切的结构特异性核酸酶混合物
 ·识别插入/缺失(indel)以及单碱基错配:C/C、T/C、A/C、T/G、G/G、T/T 和 A/A
 ·应用:
       ·  在寡核苷酸合成过程中进行错误修正
       ·  错配检测分析

产品描述

 Authenticase 切割错配核酸酶是一种专有的结构特异性核酸酶混合物,能够识别双链 DNA 上范围为 1-10 bp的错配和插入/缺失(indel)区域,并在其外侧进行切割。该配方可以限制对 DNA 同源双链区域的非特异性切割活性。Authenticase 切割错配核酸酶可作为一种在寡核苷酸的 PCR 基因组装过程中的修正试剂,在最后复性和扩增步骤之前,通过酶法去除错误(即去除由寡核苷酸合成引起的错配和插入/缺失(indel)错误)。另外,Authenticase 切割错配核酸酶可替代 T7 核酸内切酶 I 进行错配检测分析,用于评估基因组编辑效率。

 

 产品应用特色

 

 · 减少需要筛选的菌落数,从而节省时间

 ·  替代 T7 核酸内切酶 I 用于错配检测

 

 Authenticase 切割错配核酸酶的作用机理

Authenticase® 切割错配核酸酶                               #M0689L 125 reactions

Authenticase 切割错配核酸酶可以切割携带错配或插入/缺失(indel)的双链 DNA,留下 3′ 或 5′ 突出末端。
 
图 2:Authenticase 切割错配核酸酶的应用
Authenticase® 切割错配核酸酶                               #M0689L 125 reactions
 
Authenticase 切割错配核酸酶是一种专有的结构特异性核酸酶混合物,能够识别双链 DNA 上范围为 1-10 bp的错配和插入/缺失(indel)区域,并在其外侧进行切割。该配方可以限制对 DNA 同源双链区域的非特异性切割活性。Authenticase 切割错配核酸酶可作为一种在寡核苷酸的 PCR 基因组装过程中的修正试剂,在最后复性和扩增步骤之前,通过酶法去除“错误”(即去除由寡核苷酸合成引起的错配和插入/缺失(indel)错误)。另外,Authenticase 切割错配核酸酶可替代 T7 核酸内切酶 I 进行错配检测分析,用于评估基因组编辑效率(其中 S1 是起始物质,P1 和 P2 是 Authenticase 切割错配核酸酶消化所得的产物)。
 
图3:相比 CorrectASE 酶,Authenticase 切割错配核酸酶在降低错误率方面的表现更优
 
Authenticase® 切割错配核酸酶                               #M0689L 125 reactions
由 IDT® 公司合成 16 种寡核苷酸(大小范围为 50-60 nt),用于扩增 MBD 基因(645 bp)。按照说明书建议,进一步处理 PCR 扩增子以降低片段中的错误率。使用 NEBuilder® 高保真 DNA 组装克隆试剂盒 (NEB #E5520) 将经过错误修正的片段克隆到载体中,并利用筛选平板 (LB +amp) 分离菌落。每组实验均选取出 12 个 E. coli 菌落进行 DNA 质粒提取:1) 无酶处理; 2) 用 Authenticase 切割错配核酸酶处理;3) 用 CorrectASE 处理,然后进行 Sanger DNA 测序。Authenticase 切割错配核酸酶将错误率从 645 bp 中 1 个错误降低到 1935 bp 中 1 个错误,而使用 CorrectASE 的错误率为 1,419 bp中 1 个错误。
 
图 4:突变检测:Authenticase 切割错配核酸酶 vs T7 核酸内切酶 I
 
Authenticase® 切割错配核酸酶                               #M0689L 125 reactions
比较使用 Authenticase 切割错配核酸酶和 T7 核酸内切酶 I 进行错配检测的效果。通过混合序列确定的 PCR 扩增子,然后加热并重新退火,人工创建含有各种错配或插入缺失(例如 A/C 错配、T/T 错配、2-bp 插入缺失等)的异源双链 DNA 库。这样就为每种测试的变体制备了具有预设突变率(约 21-25% 突变体和 75-79% 野生型)的异源双链底物。通过 Authenticase 切割错配核酸酶或 T7 Endo I 进行错配切割,并在 Agilent® Bioanalyzer® 上分析反应产物。根据观察到的切割产物和起始底物的摩尔浓度计算大约的突变率(切割百分比),然后绘制表示预期突变率的黑色实线参考线。Authenticase 切割错配核酸酶的性能与 T7 核酸内切酶 I 相当或更好。如果突变类型是单碱基或 2 bp 突变,Authenticase 切割错配核酸酶的检测效果优于 T7 核酸内切酶 I。如果突变类型是 indel(插入/删除)或超过 3 bp 的突变,Authenticase 切割错配核酸酶的检测效果与 T7 核酸内切酶 I 相当。
 

 

 

 

 

KLD 酶混合液 #M0554S 25 reactions-NEB酶试剂 New England Biolabs

上海金畔生物科技有限公司代理New England Biolabs(NEB)酶试剂全线产品,欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

产品资料 – DNA修饰酶与克隆技术 – 克隆 & 合成生物学

KLD 酶混合液                              收藏

KLD 酶混合液                                #M0554S 25 reactions

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#M0554S
25 reactions
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相关产品:

NEB PCR 克隆试剂盒
#E1202S 20 次反应 . . . . . .¥3,299
NEB PCR 克隆试剂盒(不含感受态细胞)
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KLD 酶混合液
#M0554S 25次反应 . . . . . .¥3,599

特性:

 KLD 酶混合液                                #M0554S 25 reactions

概述

 概述:Q5 定点突变试剂盒可以在 2 小时内快速对双链质粒 DNA 进行定点突变,该试剂盒使用稳定的 Q5 热启动超保真 DNA 聚合酶,结合客户自行设计的引物,在各种质粒中引入替换、缺失和插入突变。为保证效率,将产物转入试剂盒提供的高效级 NEB 5-alpha E. coli 感受态细胞,质粒长度可达 14.3 kb。

应用:

 • 在质粒 DNA 上产生替换、插入、缺失突变

Q5 定点突变试剂盒包含:

 – Q5 热启动超保真预混液(2X)

– KLD 酶混合液(10X)和反应缓冲液(2X)
– 对照引物混合液(各 10 μM)和 DNA 模板
(5 ng/μl)
– NEB 5-alpha E. coli 感受态细胞(高效级)
– pUC19 转化对照质粒(5 pg/μl)
– SOC Outgrowth 培养基

质保声明:

 Q5 定点突变试剂盒经过严格的质控检测,确保该产品具有最高的活性和纯度。详情请联系我们。

实验流程:

 KLD 酶混合液                                #M0554S 25 reactions