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RNA甲基化抗体——m6A抗体

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RNA甲基化抗体——m6A抗体

m6A（N6-腺苷酸甲基化）是发生在碱基A第六位N原子上的甲基化形式，作为真核生物RNA最常见的一种RNA转录后修饰，其导致了超过80%的RNA碱基甲基化。不仅在各种物种可以观察到这种RNA修饰，它也广泛的参与到各种生理过程中，包括调节干细胞分化、DNA损伤修复、脂肪分化、学习记忆、癌症进程、生长发育和免疫等。在免疫反应中，m6A也被证明参与了宿主和病毒间的交流。

 

对于大热的m6A,RNA的m6A修饰过程主要由三类蛋白参与调控，催化在RNA上形成甲基化的酶称为“编码器（writer）”、去除在RNA上甲基化的酶被称为“消码器（eraser）”，识别RNA上甲基化的酶被称为“读码器（reader）”。因此，m6A甲基化修饰是个可逆的动态过程，分别由编码器写入，消码器消除，还可以通过读码器识别，参与并影响到一系列的生物学过程。

类别 基因 功能
Writers METTL3、METTL14、WTAP、KIAA1492 最常见的分子是METTL3和METTL14，两者可在体外和体内催化mRNA（和其他细胞核RNA）的m6A甲基化。WTAP和KIAA1492是这种甲基转移酶复合体中的另一个关键组分。
Erasers FTO、ALKBH5 将RNA上甲基去除，介导RNA的去甲基化修饰过程。FTO和ALKBH5可以去除mRNA（和其他细胞核RNA）上的m6A甲基化。
Readers YTHDF1、YTHDF2、YTHDF3、YTHDC1、YTHDC2 识别RNA甲基化修饰的信息，并参与下游RNA的翻译、降解等过程。比如，YTHDC1可与mRNA上的m6A修饰，促进mRNA出核运输与可变剪接。YTHDF1/YTHDF3识别m6A后可促进mRNA的翻译，而YTHDF2与m6A的结合则会促进mRNA的降解。

研究案例

m6A的生物学功能已备受关注，并成为生命科学热门研究领域之一，RNA m6A的研究已多次登上nature, cell, Science，cancer cell等许多著名杂志，涉及领域从RNA翻译效率到DNA损伤修复，从生长发育到肿瘤形成，m6A的影响力可见一斑。例如，Nature杂志连续发文报道了m6A在斑马鱼早期发育、果蝇性别决定以及T细胞稳态中的功能。发表于Nature的文章“m6A modulates haematopoietic stem and progenitor cell specification”首次揭示m6A mRNA甲基化修饰在脊椎动物造血干细胞命运决定中的调控机制，丰富了对m6A mRNA甲基化在正常生理状态下的生物学功能的认识，是该研究领域的重大科研突破。在Science杂志发表的文章“N6-methyladenosine RNA modification-mediated cellular metabolism rewiring inhibits viral replication”揭示了宿主细胞通过抑制m6A去甲基化酶ALKBH5的活性，降低OGDH基因表达和衣康酸的产生，从而抑制病毒复制的机制。该研究提出了宿主可不依赖天然免疫方式而抵御病毒感染的新机制，证明RNA表观遗传与细胞代谢协同抵御病毒感染，为病毒感染性疾病的干预与治疗提供潜在药物靶点。在Cancer Cell杂志发表的文章“FTO Plays an Oncogenic Role in Acute Myeloid Leukemia as aN6-Methyladenosin”结果表明FTO对急性骨髓白血病（AML）有致癌作用，且显著高表达，加重病情恶化。FTO能够诱发原癌基因介导的细胞转化从而引发白血病。尽管ASB2和RARA等靶基因的m6A修饰水平有所降低，FTO还能抑制全反式维甲酸（ATRA）引起的急性骨髓白血病细胞的分化

 

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产品名称及描述 品牌 货号
Polyclonal rabbit purified antibody Synaptic Systems 202 003

反应种属：

人、大鼠、小鼠、真核生物、原核生物。

 

应用类型：

WB, ELISA（sandwich-ELISA）, IHC-P/FFPE, ICC, IP

详情请联系Synaptic Systems全国代理–上海金畔生物科技

NEBNext 酶学转化法甲基化建库多样本接头引物（双端检索引物） #E7140L 96 reactions-NEB酶试剂 New England Biolabs

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产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于Illumina测序平台: 模块和酶

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NEBNext 甲基化建库酶学转化法模块

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NEBNext 酶学转化法甲基化建库多样本接头引物（双端检索引物）

概述

虽然重亚硫酸盐测序是研究 DNA 甲基化的金标准，但这种转化方式会对DNA 造成损伤，导致 DNA 断裂、丢失和 GC 偏嗜。NEBNext 酶学转化法甲基化建库试剂盒 (EM-seq™) 提供了一种酶学方法代替全基因组重亚硫酸盐处理 DNA (WGBS) 的方法，并结合高效流程化的建库步骤，适用于 Illumina 平台测序。高效的 EM-Seq 酶促转化可最大程度地减少对DNA的损伤，结合提供的 NEBNext Ultra II 文库制备流程，最终产生的高质量文库可以从有限的测序数据中更灵敏的检测到 5-mC 和 5-hmC。

优势

更卓越的 5-mC 和 5-hmC 检测灵敏度

更高的比对率

更均一的 GC 覆盖度

能从有限的测序数据检测到更多的 CpG 位点

更均一的二核苷酸分布

更长的文库插入片段

更高效的建库流程

提供转化模块

NEBNext 酶学转化法甲基化建库多样本接头引物（双端检索引物） #E7140L 96 reactions

产品特点

 NEBNext 酶学转化法甲基化建库多样本接头引物（双端检索引物） #E7140L 96 reactions

EM-Seq 能得到更高的文库产量。采用Covaris S2 仪器将 10 ng、50 ng 和 200 ng 不同起始量的人 NA12878 基因组 DNA 打断至 300 bp，同时作为 EM-Seq 和 WGBS 建库的起始样本。对于 WGBS 方法，使用 NEBNext Ultra II DNA 进行建库，随后采用 Zymo Research EZ DNA Methylation-Gold 试剂盒进行重亚硫酸盐转化。上述所有起始量，EM-Seq 都能使用更少的 PCR 循环得到更高的文库产量，表明 EM-Seq 显著减少了 WGBS 方法中的 DNA 损失。误差条表示标准差。

NEBNext 酶学转化法甲基化建库多样本接头引物（双端检索引物） #E7140L 96 reactions

NEBNext 酶学转化法甲基化文库可获得更长的插入片段 。采用Covaris® S2 仪器将 50 ng 人 NA12878 基因组 DNA 打断至 300 bp，同时作为 EM-Seq 和 WGBS 建库的起始样本。对于 WGBS 方法，使用 NEBNext Ultra II DNA 进行建库，随后采用 Zymo Research EZ DNA Methylation-Gold™ 试剂盒进行重亚硫酸盐转化。两个文库均使用 Illumina MiSeq (2 X 76 bases) 测序，片段大小采用 Picard 2.18.14 测定。图中绘制了每个插入片段出现的频率标准化后的数据，结果如图：EM-Seq 建库后的插入片段比 WGBS 方法得到的插入片段更长，说明：酶学转化法不会对 DNA 造成损伤，而重亚硫酸盐处理的 DNA 有严重损伤。

 

NEBNext 酶学转化法甲基化建库多样本接头引物（双端检索引物） #E7140L 96 reactions

 

 

相较于 WGBS，EM-Seq 在更低的测序深度情况下能检测到更多的 CpG 位点，并能实现更卓越的 GC 均一覆盖度。采用Covaris S2 仪器将 10 ng, 50 ng, 200 ng 不同起始量的人 NA12878 基因组 DNA 打断至 300 bp，同时作为 EM-Seq 和 WGBS 建库的起始样本。对于 WGBS 方法，使用 NEBNext Ultra II DNA 进行建库，随后采用 Zymo Research EZ DNA Methylation-Gold™ 试剂盒进行重亚硫酸盐转化。两个文库均使用 Illumina NovaSeq® 6000 (2 X 100 bases) 测序，使用 bwa-meth 0.2.2 将 测序数据 与 hg38 进行比对。

A: CpG 位点检测：通过分析 3.24 亿双端数据得到 EM-Seq 和 WGBS 文库的 CpG 位点覆盖度，其中每条链都独立计数，最终得到最多 5600 万个可能的 CpG 位点。结果显示：EM-Seq 在更低测序深度能检测到更多的 CpG 位点。

B: GC 覆盖度：使用 Picard 2.17.2 计算 GC 覆盖度，图中显示不同 GC 含量时 (0-100%)，标准化后覆盖度的分布情况。结果显示：EM-Seq 文库显著提高 GC 覆盖度的均一性，无 AT 过度测序，也无 GC 测序不足，后两项都是 WGBS 文库的典型缺陷。

NEBNext 酶学转化法甲基化建库多样本接头引物（双端检索引物） #E7140L 96 reactions

 

 

相较于 WGBS，EM-Seq 在更低的测序深度情况下能检测到更多的 CpG 位点。采用 Covaris S2 仪器将 10 ng、50 ng 和 200 ng 不同起始量的人 NA12878 基因组 DNA 打断至 300 bp，同时作为 EM-Seq 和 WGBS 建库的起始样本。对于 WGBS 方法，使用 NEBNext Ultra II DNA 进行建库，随后采用 Zymo Research EZ DNA Methylation-Gold™ 试剂盒进行重亚硫酸盐转化。两个文库均使用 Illumina NovaSeq® 6000（2 X 100 bases）测序，使用 bwa-meth 0.2.2 将测序数据与 hg38 进行比对。通过分析 3.24 亿双端数据得到 EM-Seq 和 WGBS 文库的 CpG 位点覆盖度。

图中显示了 EM-Seq 和 WGBS 两种方法在不同起始量，至少 1X 和 8X 测序深度下检测到的独有和共有的 CpG 位点。EM-Seq 在至少 1X 测序深度下比 WGBS 多检测到 20% 以上的 CpG 位点。而在至少 8X 测序深度下，CpG 位点覆盖度差异增加至 2 倍。

 

甲基化DNA富集酶试剂盒Takara Clontech

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上海金畔生物科技有限公司代理Takara酶试剂盒全线产品，欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

甲基化DNA富集
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 631962 EpiXplore™ Methylated DNA Enrichment Kit 20 Rxns ￥5,444 甲基化DNA富集 甲基化DNA富集 甲基化DNA富集
Clontech 631963 EpiXplore™ Methylated DNA Enrichment Kit 10 Rxns ￥2,758 甲基化DNA富集 甲基化DNA富集 甲基化DNA富集
Clontech 631964 Magnetic Stand 2 × 1.5 ml ￥667 甲基化DNA富集 甲基化DNA富集
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EpiXplore™ Methylated DNA Enrichment Kit
甲基化DNA富集
· 使用MBD2蛋白质 /磁珠轻松浓缩甲基化DNA
· 保留95％以上的甲基化DNA
· 富集的DNA可直接用于下游测序分析
· 可从基因组中分级富集低度、中度、高度甲基化DNA片段
 
产品详情请点击：甲基化DNA富集
 
 

页面更新：2020-09-16 09:09:29

Zebularine；泽布拉林

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Zebularine；泽布拉林

货号：
IZ0090

品牌：
Jinpan

Zebularine；泽布拉林

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产品简介
MDL MFCD04973699
EC EINECS 2017-001-1
别名 4-Deoxyuridine
英文名称 Zebularine
CAS 3690-10-6
分子式 C9H12N2O5
分子量 228.2
纯度 HPLC≥98%
单位 瓶
生物活性 Zebularine 是DNA甲基转移酶抑制剂；也是胞苷脱氨酶抑制剂，Ki值为0.95 μM。Zebularine通过稳定DNMT与DNA的结合，阻碍甲基化和减少解离来发挥其去甲基化活性，从而捕获酶并防止甚至在其他部位的转换。 [1-4]
In Vitro zebularine可增强肿瘤细胞的化学和放射敏感性，并具有抗病毒和血管抑制活性[1]。 Zebularine抑制DNA甲基化并重新激活先前被甲基化沉默的基因。 Zebularine在10T1/2细胞中诱导肌原性表型，这是DNA甲基化抑制剂特有的现象。 Zebularine重新激活沉默的p16基因并使其在T24膀胱癌细胞中的启动子区域去甲基化[2]。 Zebularine处理以剂量和时间依赖性方式抑制细胞生长，在暴露96小时时分别在MDA-MB-231和MCF-7细胞中IC50为~100μM和150μM。在高剂量时，zebularine以细胞系特异性方式诱导凋亡蛋白的变化，表现为caspase-3，Bax，Bcl2和PARP裂解的改变[3]。 Zebularine也是CR脱氨酶的有效竞争性抑制剂。 zebularine的Ki为0.95μM[4]。
In Vivo Zebularine对荷瘤小鼠仅有轻微的细胞毒性。与对照小鼠相比，通过腹膜内注射或口服强饲法给予高剂量zebularine治疗的小鼠肿瘤体积在统计学上显著降低[2]。 Zebularine还可以增强用5-AZA-CdR处理的L1210白血病小鼠的存活时间。用这种药物组合治疗的小鼠中约有27％的存活时间长于仅用5-AZA-CdR治疗的小鼠[4]。
SMILES O=C1N=CC=CN1[C@H]2[C@@H]([C@@H]([C@@H](CO)O2)O)O
靶点 DNA Methyltransferase
动物实验 将悬浮在PBS中的EJ6细胞（5×105 /注射）皮下接种到4至6周龄雄性BALB/c nu/nu小鼠的右侧和左侧（沿着腋中线）。小鼠（n = 30）随机分为6组（腹膜内对照，口服对照，500mg/kg腹腔注射zebularine，500mg/kg口服zebularine，1000mg/kg腹腔注射zebularine，1000mg/kg口服zebularine）公斤）。每组由5只小鼠组成（每组至少6只肿瘤;每组1或2只小鼠随机杀死，在较早的时间点建立表达的时间过程）。 2-3周后，在形成肉眼可见的肿瘤（50-200mm 3）后，开始使用zebularine或对照治疗。剂量为500mg/kg或1000mg/kg的Zebularine每天通过腹膜内注射或口服管饲法在0.45％盐水溶液中施用18天[2]。
细胞实验 对于甲基化分析，用各种浓度的zebularine处理10T1/2细胞和T24细胞。对于10T1/2细胞，在初始药物处理后24小时更换培养基，而对于T24细胞，在初始药物处理后24小时或48小时更换培养基。在初始药物处理后72小时从10T1/2细胞收获DNA和RNA，并在初始药物处理后96小时从T24细胞收获DNA和RNA。所示DNA区域的甲基化状态在两个独立且独立的实验中测量，两者均一式两份进行[2]。
数据来源文献 [1]. Champion C, et al. Mechanistic insights on the inhibition of c5 DNA methyltransferases by zebularine. PLoS One. 2010 Aug 24;5(8):e12388.
[2]. Cheng JC, et al. Inhibition of DNA methylation and reactivation of silenced genes by zebularine. J Natl Cancer Inst. 2003 Mar 5;95(5):399-409.
[3]. Billam M, et al. Effects of a novel DNA methyltransferase inhibitor zebularine on human breast cancer cells. Breast Cancer Res Treat. 2010 Apr;120(3):581-92.
[4]. Lemaire M, et al. Inhibition of cytidine deaminase by zebularine enhances the antineoplastic action of 5-aza-2′-deoxycytidine. Cancer Chemother Pharmacol. 2009 Feb;63(3):411-6
规格 10mg 25mg 50mg

Zebularine 是DNA甲基转移酶抑制剂; 也是胞苷脱氨酶抑制剂。

EpiMark 甲基化 DNA 富集试剂盒 #E2600S 25 次反应-NEB酶试剂 New England Biolabs

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产品资料 – 表观遗传学 – 表观遗传学

EpiMark 甲基化 DNA 富集试剂盒                              收藏

EpiMark 甲基化 DNA 富集试剂盒 #E2600S 25 次反应

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特性

 高亲和性以确保最佳灵敏度
 小体积洗脱，简化下游应用
 简单明了的实验步骤，2 小时内完成富集
 富集的甲基化 DNA 易与双链接头连接，进行高通量测序
 较宽泛的样品起始 DNA 浓度，均可得到高纯度富集产物

概述

EpiMark 甲基化 DNA 富集试剂盒可有效的富集基于 CpG 密度的双链 CpG 甲基化 DNA。该试剂盒利用人 MBD2a 蛋白的甲基-CpG 结合域作为捕获诱饵，并将该结合域与人 IgG1 的 Fc 尾部融合表达形成 MBD2a-Fc 复合蛋白，再偶联上 ProteinA 磁珠形成 MBD2a-Fc/Protein A 磁珠复合物。这个稳定的复合物可以选择性的结合 CpG 甲基化的双链 DNA。高亲和性的磁珠与优化的试剂相配合，极大的提高了灵敏度和精确性。试剂盒提供所有所需试剂，2 小时内就能完成 4 步富集反应。
EpiMark 甲基化 DNA 富集试剂盒 #E2600S 25 次反应

 

EpiMark 甲基化 DNA 富集试剂盒包括

– MBD2-Fc 蛋白
– Protein A 磁珠
– 结合/洗涤缓冲液
– 高盐洗脱缓冲液
– 片段化 HeLa DNA
– Line element 引物（作为甲基化基因座对照）
– RPL30 引物（作为非甲基化基因座对照）
– MirA 基因座对照引物

参考文献

有关该产品性质和应用的参考文献请联系我们。 www.jinpanbio.com，www.jinpanbio.cn。

新型氟甲基化剂一般化学试剂-Wako富士胶片和光

发表于由

新型氟甲基化剂一般化学试剂-Wako富士胶片和光

供货周期 一个月以上 应用领域 化工

新型氟甲基化剂​
氟对甲苯磺酸（FMTS）
本产品使用K2CO3和Cs2CO3等盐，可以在温和的条件下进行乙醇、铵、硫醇的氟甲基化的新型氟甲基化剂。可以用于医药品、农药、功能性材料等的新型候补化合物的制造中。

新型氟甲基化剂新型氟甲基化剂一般化学试剂-Wako富士胶片和光​

氟对甲苯磺酸（FMTS）

 

      本产品使用K2CO3和Cs2CO3等盐，可以在温和的条件下进行乙醇、铵、硫醇的氟甲基化的新型氟甲基化剂。可以用于医药品、农药、功能性材料等的新型候补化合物的制造中。

新型氟甲基化剂一般化学试剂-Wako富士胶片和光

 

◆产品列表

产品编号 产品名称 规格
067-06471

对甲基苯磺酸氟甲酯

 1 g
063-06473 5 g

 

新型氟甲基化剂新型氟甲基化剂一般化学试剂-Wako富士胶片和光​

氟对甲苯磺酸（FMTS）

 

      本产品使用K2CO3和Cs2CO3等盐，可以在温和的条件下进行乙醇、铵、硫醇的氟甲基化的新型氟甲基化剂。可以用于医药品、农药、功能性材料等的新型候补化合物的制造中。

新型氟甲基化剂一般化学试剂-Wako富士胶片和光

 

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对甲基苯磺酸氟甲酯

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NEBNext® 5hmC 甲基化建库酶学转化法模块 #E3365L 96 次反应-NEB酶试剂 New England Biolabs

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产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于Illumina测序平台: 模块和酶

NEBNext® 5hmC 甲基化建库酶学转化法模块                              收藏

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相关产品：

 NEBNext® 酶学转化法 5hmC 甲基化建库试剂盒

#E3350L       96 次反应
#E3350S       24 次反应
 
NEBNext® 表观遗传建库多样本引物试剂盒 2B（Unique 双端 Index 引物）
#E3392S       24 次反应
 
NEBNext 表观遗传建库多样本引物试剂盒 3（Unique 双端 Index 引物）
#E3404S       96 次反应
 

产品特点

• 卓越的 5hmC 检测灵敏度

• 起始量范围广：0.1 – 200 ng
• 转化效率高
• 最大限度地减少对 DNA 的损伤
• 可单独购买包含文库制备试剂的 NEBNext® 酶学转化法 5hmC 甲基化建库试剂盒（NEB #E3350）
 

产品概述：

 NEBNext® 酶学转化法 5hmC 甲基化建库试剂盒（E5hmC-seq™）是一种在单碱基水平上特异性检测 5hmC 位点的新方法。使用酶学转化法能最大限度地减少对 DNA 的损伤，并可区分 5hmC 与 5mC 和胞嘧啶。

NEBNext® 5hmC 甲基化建库酶学转化法模块使用高效的酶学转化法，实现在单碱基水平上特异性检测 5hmC 位点。在 E5hmC-seq 两步酶法转化过程中，T4-BGT 对 5hmC 进行糖基化，使得 5hmC 在下一步 APOBEC 脱氨基反应中被保护了起来。T4-BGT 不保护 5mC 和未甲基化的胞嘧啶，它们被 APOBEC 脱氨基为尿嘧啶。
在针对 Illumina® 测序平台制备 E5hmC-seq 文库时,推荐您使用 NEBNext® 酶学转化法 5hmC 甲基化建库试剂盒（NEB #E3350），而不是使用该转化模块。试剂盒中包含 E5hmC-seq 接头和 NEBNext Ultra™ II 文库制备试剂，而该转化模块中并不含有。
 
 
E5hmC-seq 转化原理
NEBNext® 5hmC 甲基化建库酶学转化法模块 #E3365L 96 次反应
 
为了实现特异性的 5hmC 检测，首先使用 T4-BGT 对 5hmC 进行糖基化。然后，5mC 和未修饰的胞嘧啶在 APOBEC 的作用下，分别脱氨基生成胸腺嘧啶和尿嘧啶，而受保护的 5hmC 则未被转化。
 

NEBNext 甲基化建库酶学转化法模块 #E7125L 96 reactions-NEB酶试剂 New England Biolabs

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#E7125L
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更卓越的 5-mC 和 5-hmC 检测灵敏度

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NEBNext 甲基化建库酶学转化法模块 #E7125L 96 reactions

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 NEBNext 甲基化建库酶学转化法模块 #E7125L 96 reactions

EM-Seq 能得到更高的文库产量。采用Covaris S2 仪器将 10 ng、50 ng 和 200 ng 不同起始量的人 NA12878 基因组 DNA 打断至 300 bp，同时作为 EM-Seq 和 WGBS 建库的起始样本。对于 WGBS 方法，使用 NEBNext Ultra II DNA 进行建库，随后采用 Zymo Research EZ DNA Methylation-Gold 试剂盒进行重亚硫酸盐转化。上述所有起始量，EM-Seq 都能使用更少的 PCR 循环得到更高的文库产量，表明 EM-Seq 显著减少了 WGBS 方法中的 DNA 损失。误差条表示标准差。

NEBNext 甲基化建库酶学转化法模块 #E7125L 96 reactions

NEBNext 酶学转化法甲基化文库可获得更长的插入片段 。采用Covaris® S2 仪器将 50 ng 人 NA12878 基因组 DNA 打断至 300 bp，同时作为 EM-Seq 和 WGBS 建库的起始样本。对于 WGBS 方法，使用 NEBNext Ultra II DNA 进行建库，随后采用 Zymo Research EZ DNA Methylation-Gold™ 试剂盒进行重亚硫酸盐转化。两个文库均使用 Illumina MiSeq (2 X 76 bases) 测序，片段大小采用 Picard 2.18.14 测定。图中绘制了每个插入片段出现的频率标准化后的数据，结果如图：EM-Seq 建库后的插入片段比 WGBS 方法得到的插入片段更长，说明：酶学转化法不会对 DNA 造成损伤，而重亚硫酸盐处理的 DNA 有严重损伤。

 

NEBNext 甲基化建库酶学转化法模块 #E7125L 96 reactions

 

 

相较于 WGBS，EM-Seq 在更低的测序深度情况下能检测到更多的 CpG 位点，并能实现更卓越的 GC 均一覆盖度。采用Covaris S2 仪器将 10 ng, 50 ng, 200 ng 不同起始量的人 NA12878 基因组 DNA 打断至 300 bp，同时作为 EM-Seq 和 WGBS 建库的起始样本。对于 WGBS 方法，使用 NEBNext Ultra II DNA 进行建库，随后采用 Zymo Research EZ DNA Methylation-Gold™ 试剂盒进行重亚硫酸盐转化。两个文库均使用 Illumina NovaSeq® 6000 (2 X 100 bases) 测序，使用 bwa-meth 0.2.2 将 测序数据 与 hg38 进行比对。

A: CpG 位点检测：通过分析 3.24 亿双端数据得到 EM-Seq 和 WGBS 文库的 CpG 位点覆盖度，其中每条链都独立计数，最终得到最多 5600 万个可能的 CpG 位点。结果显示：EM-Seq 在更低测序深度能检测到更多的 CpG 位点。

B: GC 覆盖度：使用 Picard 2.17.2 计算 GC 覆盖度，图中显示不同 GC 含量时 (0-100%)，标准化后覆盖度的分布情况。结果显示：EM-Seq 文库显著提高 GC 覆盖度的均一性，无 AT 过度测序，也无 GC 测序不足，后两项都是 WGBS 文库的典型缺陷。

NEBNext 甲基化建库酶学转化法模块 #E7125L 96 reactions

 

 

相较于 WGBS，EM-Seq 在更低的测序深度情况下能检测到更多的 CpG 位点。采用 Covaris S2 仪器将 10 ng、50 ng 和 200 ng 不同起始量的人 NA12878 基因组 DNA 打断至 300 bp，同时作为 EM-Seq 和 WGBS 建库的起始样本。对于 WGBS 方法，使用 NEBNext Ultra II DNA 进行建库，随后采用 Zymo Research EZ DNA Methylation-Gold™ 试剂盒进行重亚硫酸盐转化。两个文库均使用 Illumina NovaSeq® 6000（2 X 100 bases）测序，使用 bwa-meth 0.2.2 将测序数据与 hg38 进行比对。通过分析 3.24 亿双端数据得到 EM-Seq 和 WGBS 文库的 CpG 位点覆盖度。

图中显示了 EM-Seq 和 WGBS 两种方法在不同起始量，至少 1X 和 8X 测序深度下检测到的独有和共有的 CpG 位点。EM-Seq 在至少 1X 测序深度下比 WGBS 多检测到 20% 以上的 CpG 位点。而在至少 8X 测序深度下，CpG 位点覆盖度差异增加至 2 倍。

 

5-甲基化-dCTP #N0356S 1 μmol-NEB酶试剂 New England Biolabs

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产品资料 – DNA聚合酶与扩增技术 – 核苷酸溶液和缓冲液

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概述

dNTP 套装：
四种独立包装的超纯脱氧核苷三磷酸的溶液（dATP、dCTP、dGTP 和 dTTP）。每种的浓度为 100 mM。

dNTP 混合液：
含相同摩尔数的超纯 dATP、dCTP、dGTP 和 dTTP。每种的浓度为 10 mM。

rNTP 套装：
四种独立包装的核苷三磷酸溶液（ATP、CTP、GTP 和 UTP），pH 7.5，以钠盐形式存在。

rNTP 混合液：
含相同摩尔数的四种核苷三磷酸：rATP、rCTP、rGTP 和 rUTP。每种浓度为 25 mM（rNTP 总浓度相当于 100 mM）。

7-去氮-dGTP：
含有 5 mM 7-去氮-dGTP 的二锂盐溶液。

5-甲基-dCTP：
10 mM 溶液，pH 7.0。

dATP 溶液：

含有 100 mM dATP，pH 7.4 的钠盐溶液。

acyNTP 套装：
四种独立包装的 acyNTP （acyATP、acyCTP、acyGTP 和 acyTTP）。以干粉形式提供，加入 50 μl 蒸馏水或去离子水（Milli-Q®）后，acyNTP 的终浓度为 10 mM。

acyNTP 可作为链终止基团，因而可用于一般采用 ddNTP 的实验，如 DNA 测序和 SNP 分析。acyNTP 尤其适用于古生菌 DNA 聚合酶的反应，特别是 Therminator DNA 聚合酶。Therminator DNA 聚合酶经过基因工程改造后，拥有更强的掺入核苷酸类似物的能力，这些类似物的糖环发生了改变，如 rNTP，ddNTP，2´ 脱氧核苷酸，特别是 acy 碱基类似物。  

参考文献

  

NEBNext 多样本接头引物试剂盒 1（甲基化接头，12 种）(停产） #E7535L 96 次反应-NEB酶试剂 New England Biolabs

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产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于 Illumina 测序平台/接头 & 引物

NEBNext 多样本接头引物试剂盒 1（甲基化接头，12 种）(停产）                              收藏

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#E7535L
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停产通知

 该产品已停产，推荐替代产品为 NEBNext® Multiplex Oligos for Enzymatic Methyl-seq (Unique Dual Index Primer Pairs)（E7140）

产品特点

·提高连接效率
·极大降低接头二聚体
·增加文库产量 
·增加样品识别特异性 （双端检索）
·大量单端检索/可用检索 
·提供检索表和样本示例表

概述

NEBNext 接头是为 DNA、ChIP DNA 和 RNA（不包括 Small RNA）文库构建而设计的，能够确保接头的高效连接及文库的高产量，并且最大限度的减少接头二聚体的形成。NEBNext 接头包含一个特殊的发卡环状结构，能够更高效的和经末端修复的带 dA 尾的 DNA 结合。环状结构包含一个 U，当 U 被 USER 酶（由 UDG 和内切酶 VIII 组合而成）切掉后，环状结构打开，使它可以成为 PCR 的反应底物。检索序列通过 PCR 引入文库，从而实现了多样本的制备。NEBNext 接头引物不仅能够用于 NEBNext 产品，也可以用于其它的兼容 Illumina 标准平台的文库制备方法。

 
提供单端和双端检索引物。同时也提供用于重亚硫酸盐测序的甲基化接头。
 
NEBNext 多样本接头引物试剂盒 1（甲基化接头，12 种）(停产） #E7535L 96 次反应

功能验证

 每个试剂盒都通过对基因组 DNA、ChIP DNA 和 mRNA 进行文库构建，并在 Illumina 平台测序进行验证。

 

请联系我们。 NEBNextSelector.neb.com 可以使用在线产品选择工具进行产品选择。