单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit酶试剂盒Takara Clontech

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单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech R400748 SMART-Seq® HT PLUS Kit 48 Rxns ¥27,766 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
Clontech R400744 Unique Dual Index Kit – 48U 48 Rxns ¥5,542 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
Clontech 634455 SMART-Seq® HT Kit 12 Rxns ¥4,769 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
Clontech 634456 SMART-Seq® HT Kit 48 Rxns ¥17,137 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
Clontech 634436 SMART-Seq® HT Kit 480 Rxns ¥126,928 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
Clontech 634437 SMART-Seq® HT Kit 96 Rxns ¥33,001 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
Clontech 634438 SMART-Seq® HT Kit 192 Rxns ¥60,924 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
Clontech 634439 SMART-Seq® HT Lysis Components 96 Rxns ¥1,284 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
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单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 延伸     单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
         
单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
 
 
SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT Plus Kit:自动化友好型的单细胞mRNA全长分析
· 自动化友好型 - 兼容自动化工作站,更少的时间分析更多的样本
· 高灵敏度 - 可以从单细胞或10 pg总RNA起始(起始量:1-100个细胞或10 pg-1 ng总RNA)
· 高质量的RNA-Seq数据 - 保留全长基因信息,低rRNA比率,高基因检出数,有效扩增GC-rich转录本
· 单管操作流程 - SMART-Seq HT PLUS Kit包含完整的cDNA合成和文库构建流程,分别在单管中进行,减少样品损失与混淆,降低手动操作误差
· 增强的测序性能 - SMART-Seq HT PLUS Kit整合双端特殊index(UDI),即便多个文库pool后用高通量型illumina测序仪(如Novaseq)分析,也能得到正确结果
· 更高的文库产量 - 更便于使用高通量型illumina测序仪测序(如Novaseq),或保存剩余的文库用于多次测序
 
产品说明
SMART-Seq HT Kit(SS-HT)和SMART-Seq HT Plus Kit(SS-HT PLUS)均兼容自动化移液工作站,采用oligo(dT)引物,支持1-100个细胞或10 pg-1 ng总RNA起始。
SS-HT试剂盒是从第4代的SMARTer Ultra Low试剂(SMART-Seq v4)发展而来的,具有简化的操作流程,将原有的反转录和PCR扩增步骤整合为一步,且不影响性能。细胞分离或RNA提取后,仅通过一步RT-PCR扩增双链cDNA,然后进行纯化完成操作。cDNA合成可在4小时内完成,整个文库构建方案可在2天内完成。而且,SMART-Seq HT试剂盒具有与SMART-Seq v4试剂盒相同的灵敏度和可重复性。核心的SMART技术,是一种对全转录组研究,以及包括细胞内剪接位点,可变剪接研究的非常强大的工具,且可以检测全长基因。 Oligo(dT)可以从高品质总RNA(RIN> 8)或完整细胞中特异性扩增mRNA。 通过采用LNA技术,提升了模板转换的效率与基因检出数等性能。
SS-HT PLUS Kit在包含核心的cDNA合成试剂基础上,同时整合了Takara Bio Group专利性的文库构建技术(U.S. Patents 7,803,550, 8,399,199, 8,728,737, 9,598,727
,10,196,686, 10,208,337, and 11,072,823及单次使用的双端特殊index(UDI),提供完整的单细胞cDNA合成到文库构建的实验体验。建库试剂中包含片段化酶,以实现对合成cDNA的片段化,接着利用特别的茎环形接头构建高品质illumina文库。在建库阶段,单管两步操作、过程中无需纯化、2 h即可建成文库!
 
SS-HT Kit:流程缩短、性能不变!
单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
图1 SMART-Seq HT的技术流程
 
单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
图2 SMART-Seq v4和SMART-Seq HT工作流程的比较
 
SMART-Seq HT(右)是由SMART-Seq v4方法(左)经过改进而来的一个手动操作时间更短的高通量工作流程。使用FACS方法获得单细胞,SMART-Seq HT试剂盒只需3个操作步骤即可制备cDNA,而SMART-Seq v4试剂盒需要6步。SMART-Seq HT工作流程的一个重要步骤是一步RT-PCR,即使用一步RT-PCR缓冲液,进行高效的反转录和PCR扩增cDNA的过程。
 
单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
图3 使用SMART-seq v4 kit和SMART-Seq HT kit从FACS分选的293T细胞中获得的高重复性的基因表达数据
 
使用SMART-Seq v4试剂盒(SSv4_1-SSv4_12)和SMART-Seq HT试剂盒( HT_1-HT_9)(上图)从21个293T细胞单细胞制备文库,并对每个细胞获得的基因表达性进行评估。层次聚类热图展示了所有细胞之间的Euclidean distances,并显示从0.74到0.97的Pearson相关性。不仅用相同试剂盒制备的细胞之间可以观察到非常高的相关性,而在两种试剂盒之间的相关性也非常高。这些数据表明,SMART-Seq HT的工作流程与SMART-Seq v4相比,在基因表达分析中没有显著的偏差。
 
SS-HT PLUS Kit:不只是一个Kit,更是完整的单细胞RNA-Seq建库体验!
为了使单细胞cDNA合成、文库构建实验“一步”到位,我们全新推出了SS-HT PLUS Kit。
单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
 
单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
 
从高灵敏度、高重复性的cDNA合成出发,构建更高品质illumina文库
 
Takara科学家从10 pg小鼠脑total RNA起始,采用SMART-Seq HT Kit完成cDNA合成。随后分别使用SS-HT Plus Kit中的SMART-Seq Library Prep Kit模块与市面上较常用的A公司试剂盒构建文库,并比较性能差异。
 
单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
(比较数据来源于Takara Bio USA, Inc.)
 
从测试数据中可以看出,SS-HT PLUS Kit所建文库的产量是A公司Kit产量的5倍,而更高的文库产量更适于高通量型Illumina测序仪,如Novaseq。
 
两种方法所建文库随后用Nextseq 500完成测序,并对TPM(Transcripts per million)≥0.1的基因数进行统计。SS-HT PLUS文库能比A公司文库多检出10%的基因,从同样的cDNA起始能“捕获”更全的信息!
 
 
产品详情请点击:单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
 
更多实验数据:
SS-HT Kit
SS-HT Plus Kit
 
延伸阅读:
单细胞NGS解决方案
 
 

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文库构建试剂盒SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)酶试剂盒Takara Clontech

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文库构建试剂盒SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech 634762 SMART-Seq® mRNA LP (with UMIs) 24 Rxns ¥20,124 文库构建试剂盒SMART-Seq mRNA LP (with UMIs) 文库构建试剂盒SMART-Seq mRNA LP (with UMIs) 文库构建试剂盒SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)
Clontech 634765 SMART-Seq® mRNA LP (with UMIs) 96 Rxns ¥68,425 文库构建试剂盒SMART-Seq mRNA LP (with UMIs) 文库构建试剂盒SMART-Seq mRNA LP (with UMIs) 文库构建试剂盒SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)
Clontech 634766 SMART-Seq® mRNA LP (with UMIs) 4×96 Rxns ¥246,329 文库构建试剂盒SMART-Seq mRNA LP (with UMIs) 文库构建试剂盒SMART-Seq mRNA LP (with UMIs) 文库构建试剂盒SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)
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整合UMI的单细胞/微量样本的mRNA全长分析
SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)
· 更可靠的数据 — 添加UMI,可以获得更高准确性的基因或转录本检测数;
· 高灵敏度 — 可用于10 pg-100 ng的总RNA或1-1000个细胞起始;
· 单管操作流程 — 包含完整的cDNA合成和文库构建流程,分别在单管中进行,减少样品损失的同时降低手动操作误差;
· 无缝衔接Illumina测序 — 本试剂盒不含index,可搭配使用Unique Dual Index (UDI) kits(单独销售)
· 完整的流程搭配特别开发Cogent™ NGS Analysis Pipeline (CogentAP)Cogent NGS Discovery Software (CogentDS)可以完成测序数据分析。
 
■ 产品说明:

SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)是一款mRNA-Seq文库构建试剂盒。该试剂盒使用高灵敏度的SMART-Seq技术,并添加了UMI(unique molecular identifier),可以进行高准确性的Ultra low RNA全长转录组分析。它优化用于从10 pg-100 ng的高品质total RNA(RIN≥8)或1-1000个完整细胞起始生成高质量的测序文库。

该试剂盒使用oligo(dT)引物起始,并在TSO上添加UMI来校正PCR错误和扩增偏差,从而获得更高准确性的基因或转录本检测数。该试剂盒基于SMART技术(Switching Mechanism at 5′ End of RNA Template)优化改良,提供全长转录本信息,支持分析转录本异构体、融合基因、点突变等。另外,TSO中整合了LNA(locked nucleic acid)技术,提升了模板转换效率。相比较其他方法,有更高灵敏度和更高的基因检测数。

该试剂盒采用Takara Bio Group专利性的文库构建技术(U.S. Patents 7,803,550, 8,399,199, 8,728,737, 9,598,727, 10,196,686, 10,208,337, 和11,072,823),利用特别的茎环形接头构建高品质Illumina文库。另外,搭配使用的双端特殊index(UDI),可以提供完整的从样品到cDNA合成到文库构建的实验体验。同时搭配特别开发的Cogent NGS生物信息学分析软件,能直接对下机数据进行分析(*科研及盈利机构在用该试剂盒建库后,均可免费使用Cogent NGS分析测序数据!)

该试剂盒也可以与小型高通量的自动化液体工作站兼容。

如果是降解样本,选择随机引物起始,推荐使用: SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian

 
■ 流程概要:
文库构建试剂盒SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)
 
 
产品详情请点击:文库构建试剂盒SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)
 
 
 

 

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单细胞/微量样本mRNA全长分析SMART-Seq mRNA HT LP & SMART-Seq mRNA HT酶试剂盒Takara Clontech

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单细胞/微量样本mRNA全长分析SMART-Seq mRNA HT LP & SMART-Seq mRNA HT
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech 634792 SMART-Seq® mRNA HT LP 24 Rxns ¥9,799 单细胞/微量样本mRNA全长分析SMART-Seq mRNA HT LP  & SMART-Seq mRNA HT 单细胞/微量样本mRNA全长分析SMART-Seq mRNA HT LP  & SMART-Seq mRNA HT 单细胞/微量样本mRNA全长分析SMART-Seq mRNA HT LP  & SMART-Seq mRNA HT
Clontech 634793 SMART-Seq® mRNA HT LP 96 Rxns ¥39,031 单细胞/微量样本mRNA全长分析SMART-Seq mRNA HT LP  & SMART-Seq mRNA HT 单细胞/微量样本mRNA全长分析SMART-Seq mRNA HT LP  & SMART-Seq mRNA HT 单细胞/微量样本mRNA全长分析SMART-Seq mRNA HT LP  & SMART-Seq mRNA HT
Clontech 634794 SMART-Seq® mRNA HT LP 4×96 Rxns ¥145,460 单细胞/微量样本mRNA全长分析SMART-Seq mRNA HT LP  & SMART-Seq mRNA HT 单细胞/微量样本mRNA全长分析SMART-Seq mRNA HT LP  & SMART-Seq mRNA HT 单细胞/微量样本mRNA全长分析SMART-Seq mRNA HT LP  & SMART-Seq mRNA HT
Clontech 634795 SMART-Seq® mRNA HT 24 Rxns ¥8,007 单细胞/微量样本mRNA全长分析SMART-Seq mRNA HT LP  & SMART-Seq mRNA HT 单细胞/微量样本mRNA全长分析SMART-Seq mRNA HT LP  & SMART-Seq mRNA HT 单细胞/微量样本mRNA全长分析SMART-Seq mRNA HT LP  & SMART-Seq mRNA HT
Clontech 634796 SMART-Seq® mRNA HT 96 Rxns ¥30,839 单细胞/微量样本mRNA全长分析SMART-Seq mRNA HT LP  & SMART-Seq mRNA HT 单细胞/微量样本mRNA全长分析SMART-Seq mRNA HT LP  & SMART-Seq mRNA HT 单细胞/微量样本mRNA全长分析SMART-Seq mRNA HT LP  & SMART-Seq mRNA HT
Clontech 634791 SMART-Seq® mRNA HT 4×96 Rxns ¥112,682 单细胞/微量样本mRNA全长分析SMART-Seq mRNA HT LP  & SMART-Seq mRNA HT 单细胞/微量样本mRNA全长分析SMART-Seq mRNA HT LP  & SMART-Seq mRNA HT 单细胞/微量样本mRNA全长分析SMART-Seq mRNA HT LP  & SMART-Seq mRNA HT
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SMART-Seq mRNA HT LP & SMART-Seq mRNA HT
◆ 自动化友好型 – 兼容自动化工作站,更少的时间分析更多的样本
◆ 高灵敏度 – 可以从单细胞或10 pg总RNA起始(起始量:1-100个细胞或10 pg-1 ng总RNA)
◆ 高质量的RNA-Seq数据 – 保留全长基因信息,低rRNA比率,高基因检出数,有效扩增GC-rich转录本
◆ 单管操作流程 – SMART-Seq mRNA HT包含完整的cDNA合成和文库构建流程,分别在单管中进行,减少样品损失与混淆,降低手动操作误差
◆ 增强的测序性能 – SMART-Seq mRNA HT搭配使用整合双端特殊index(UDI),即便多个文库pool后用高通量型Illumina测序仪(如Novaseq)分析,也能得到正确结果
◆ 更高的文库产量 – 更便于使用高通量型Illumina测序仪测序(如Novaseq),或保存剩余的文库用于多次测序

 

■ 产品说明:
SMART-Seq mRNA HTSMART-Seq mRNA HT LP均兼容自动化移液工作站,采用oligo(dT)引物,支持1-100个细胞或10 pg-1 ng总RNA起始,合成高品质的全长cDNA。SMART-Seq mRNA HT包含核心cDNA合成试剂,SMART-Seq mRNA HT LP在此基础上,同时包含文库构建试剂,并且搭配Unique Dual Index kits(单独购买)使用,最多可以制备384个Illumina测序文库。
SMART-Seq mRNA HT具有简化的操作流程,可用于FACS下游,并且由于引入了一步RT-PCR扩增步骤,从而减少了手动操作时间。本试剂的核心技术-SMART技术(Switching Mechanism at 5′ End of RNA Template),是一种对全转录组研究,以及包括细胞内剪接位点、可变剪接研究的强大的工具,并且可以检测全长基因。Oligo(dT)可用于从高品质总RNA(RIN> 8)或完整细胞中特异性扩增mRNA。通过采用LNA技术,提升了模板转换的效率与基因检出数等性能。
SMART-Seq mRNA HT LP在包含核心的cDNA合成试剂基础上,同时整合了文库构建技术,提供完整的单细胞cDNA合成到文库构建的实验体验。建库试剂中包含片段化酶,以实现对合成cDNA的片段化,接着利用特别的茎环形接头构建高品质Illumina文库。在建库阶段,单管两步操作、过程中无需纯化、2 h即可建成文库!
如果是以随机引物起始,对少量细胞或者降解的Total RNA样本进行RNA-Seq分析时,推荐使用SMART-Seq Stranded Kit。
 
■ 实验流程概要:
单细胞/微量样本mRNA全长分析SMART-Seq mRNA HT LP  & SMART-Seq mRNA HT
图1. SMART-Seq mRNA HT LP的技术流程
 
■ 数据展示:
注:SMART-Seq mRNA HT LP和SMART-Seq mRNA HT是SMART-Seq HT PLUS Kit和SMART-Seq HT Kit的等效替代品。
以下展示来源于SMART-Seq HT Kit和 SMART-Seq HT PLUS Kit的数据。
 
SMART-Seq HT有更简洁的操作流程
单细胞/微量样本mRNA全长分析SMART-Seq mRNA HT LP  & SMART-Seq mRNA HT
图2. SMART-Seq v4和SMART-Seq HT工作流程的比较
 
SMART-Seq HT(右)是由SMART-Seq v4方法(左)改进而来的一个手动操作时间更短的高通量工作流程。使用FACS方法获得单细胞,SMART-Seq HT试剂盒只需3个操作步骤即可制备cDNA,而SMART-Seq v4试剂盒需要6步。SMART-Seq HT工作流程的一个重要步骤是一步RT-PCR,即使用一步RT-PCR缓冲液,进行高效的反转录和PCR扩增cDNA的过程。
 
SMART-Seq HT和SMART-Seq v4之间的基因表达分析比较
  Sequencing metrics comparing SMART-Seq v4 and SMART-Seq HT kits
  RNA source 10 pg Mouse Brain Total RNA
  cDNA synthesis SMART-Seq v4 SMART-Seq HT
  Replicate A B C A B C
  Yield (ng) 7.3 8.5 9.4 9.5 9.9 9.2
  Number of
  transcripts
14,168 13,934 14,147 14,510 14,650 14,553
11,455 11,267 11,349 11,582 11,670 11,454
  Number of
  transcripts
14,168 13,934 14,147 14,510 14,650 14,553
  Average
  Pearson/Spearman
0.97/0.67 0.97/0.68
0.96/0.66
  Proportion of reads mapped (%)
  rRNA 0.7 0.6 0.5 1.1 1.1 1.1
  Mitochondria 2.8 4.2 4.1 3.7 3.8 4.2
  Genome 92.3 90.8 86.6 89.1 89.0 87.8
  Exons 74.8 72.5 69.0 67.3 67.1 65.3
  Introns 13.3 14.1 13.3 16.9 16.9 17.4
  Intergenic regions 4.2 4.2 4.4 4.9 5.0 5.2
 
分别使用SMART-Seq v4和SMART-Seq HT从10 pg小鼠脑总RNA制备cDNA后,使用Illumina的Nextera XT DNA Sample Prep Kit制备文库,之后在NextSeq上进行测序(2 x 75 bp)。结果显示,使用SMART-Seq v4和SMART-Seq HT试剂盒鉴定的转录本高度重叠。
 
从高灵敏度、高重复性的cDNA合成出发,构建更高品质Illumina文库
单细胞/微量样本mRNA全长分析SMART-Seq mRNA HT LP  & SMART-Seq mRNA HT
(比较数据来源于Takara Bio USA, Inc.)
 
Takara科学家从10 pg小鼠脑total RNA起始,采用SMART-Seq HT完成cDNA合成。随后分别使用SMART-Seq Library Prep Kit(SSlp)与市面上较常用的A公司试剂盒构建文库,并比较性能差异。
从测试数据中可以看出,SS-HT PLUS Kit所建文库的产量是A公司Kit产量的5倍,而更高的文库产量更适于高通量型Illumina测序仪,如Novaseq。
两种方法所建文库随后用Nextseq 500完成测序,并对TPM(Transcripts per million)≥0.1的基因数进行统计。SS-HT PLUS文库能比A公司文库多检出10%的基因,从同样的cDNA起始能“捕获”更全的信息!
 
产品详情请点击:单细胞/微量样本mRNA全长分析SMART-Seq mRNA HT LP  & SMART-Seq mRNA HT
 
 

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人BCR分析SMART-Seq Human BCR (with UMIs)酶试剂盒Takara Clontech

上海金畔生物科技有限公司代理Takara酶试剂盒全线产品,欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

人BCR分析SMART-Seq Human BCR (with UMIs)
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech 634777 SMART-Seq® Human BCR (with UMIs) 24 Rxns ¥19,351 人BCR分析SMART-Seq Human BCR (with UMIs) 人BCR分析SMART-Seq Human BCR (with UMIs) 人BCR分析SMART-Seq Human BCR (with UMIs)
Clontech 634778 SMART-Seq® Human BCR (with UMIs) 96 Rxns ¥63,718 人BCR分析SMART-Seq Human BCR (with UMIs) 人BCR分析SMART-Seq Human BCR (with UMIs) 人BCR分析SMART-Seq Human BCR (with UMIs)
Clontech 634776 SMART-Seq® Human BCR (with UMIs) 4 x 96 Rxns ¥239,105 人BCR分析SMART-Seq Human BCR (with UMIs) 人BCR分析SMART-Seq Human BCR (with UMIs) 人BCR分析SMART-Seq Human BCR (with UMIs)
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捕获人的BCR转录本完整V(D)J 可变区
SMART-Seq Human BCR (with UMIs)
· 完整的BCR分析—支持分析重链(IgG, IgM, IgA, IgD, IgE) 和轻链 (IgK, IgL)
· 灵活的样本起始条件—支持PBMCs (10 ng – 1 μg)、B细胞(1-100 ng)、脾脏或骨髓(10 ng),全血(100 ng)来源的RNA起始
· 添加UMI建库,获得更可靠测序数据—SMARTer Oligo上引入UMI,用于校正测序错误和PCR偏差
· 灵活的测序平台选择—可自由选择V(D)J全长分析,或只分析CDR3
 
■ 产品说明
SMART-Seq Human BCR (with UMIs) 提供了一种灵敏、准确、优化的BCR NGS库分析方法。该试剂盒整合SMART(Switching Mechanism at 5′ end of RNA Template)全长cDNA合成技术与5’RACE技术,可捕获重链(IgG/M/D/A/E) 和轻链 (IgK/L)基因完整的V(D)J可变区,用于后续NGS分析。
该试剂盒支持不同起始量的RNA(RIN≥8,取决于样本类型)起始,均可获得高品质的测序文库。比如外周血单核细胞(PBMC)纯化的10 ng-1 μg的总RNA, B细胞纯化的1-100 ng的总RNA,脾脏或骨髓10 ng的总RNA,或者全血来源的100 ng的总RNA。
该试剂盒还包括特别的分子条形码(UMI),可以消除PCR错误或duplication以及测序偏向,从而确保获得更准确和可靠的结果。此外,搭配使用的双端特殊index(UDI,Unique Dual Index),可以提供完整的从样品到文库构建的实验体验。
 
■ 流程概要
人BCR分析SMART-Seq Human BCR (with UMIs)
 
■ 不同起始量克隆型检测数据
人BCR分析SMART-Seq Human BCR (with UMIs)
图1 不同的RNA起始量,均能获得高灵敏度和重复性的克隆型检测数据
 
从10 ng、100 ng和1,000 ng人PBMC细胞总RNA中,利用本试剂盒制备BCR分析IgA、IgD、IgG、IgM、IgK和IgL文库。使用Cogent NGS Immune Profiler Software分析测序数据。
 
关联产品:Unique Dual Index Kit
 
产品详情请点击:人BCR分析SMART-Seq Human BCR (with UMIs)
 
 

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