RACE扩增试剂盒SMART 5’ RACE & 3’ RACE酶试剂盒Takara Clontech

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RACE扩增试剂盒SMART 5’ RACE & 3’ RACE
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech 634913 Marathon cDNA Amplification Kit 5 cDNA & 100 PCR Rxns ¥10,494 RACE扩增试剂盒SMART 5’ RACE & 3’ RACE RACE扩增试剂盒SMART 5’ RACE & 3’ RACE RACE扩增试剂盒SMART 5’ RACE & 3’ RACE
Clontech 634858 SMARTer RACE 5’/3’ Kit 10 Rxns ¥7,000
¥4800
RACE扩增试剂盒SMART 5’ RACE & 3’ RACE RACE扩增试剂盒SMART 5’ RACE & 3’ RACE RACE扩增试剂盒SMART 5’ RACE & 3’ RACE
Clontech 634859 SMARTer RACE 5’/3’ Kit 20 Rxns ¥13,300
¥9530
RACE扩增试剂盒SMART 5’ RACE & 3’ RACE RACE扩增试剂盒SMART 5’ RACE & 3’ RACE RACE扩增试剂盒SMART 5’ RACE & 3’ RACE
Clontech 634499 SMARTer RACE 5’/3’ Kit (no competent cells) 20 Rxns ¥10,570
¥8000
RACE扩增试剂盒SMART 5’ RACE & 3’ RACE RACE扩增试剂盒SMART 5’ RACE & 3’ RACE RACE扩增试剂盒SMART 5’ RACE & 3’ RACE
Clontech 634922 Universal Primer Mix 100 Rxns ¥1,825
¥1460
RACE扩增试剂盒SMART 5’ RACE & 3’ RACE RACE扩增试剂盒SMART 5’ RACE & 3’ RACE

*红字为促销价格,促销时间: 2024年3月1日-2024年4月30日

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由于产品升级,从即日起,您订购的SMARTer RACE试剂盒(634858/59)中的组分In-Fusion HD Cloning Kit (Code No. 639648)将陆续替换为性能更高的In-Fusion® Snap Assembly Master Mix (Code No. 638947),该组分数量保持不变,请以实际收到的产品为准。如需含HD组分的旧版说明书或产品组分列表文件,请邮件联络sales@jinpanbio.com
 
 
■ 制品说明
RACE (Rapid Amplification of cDNA Ends) 是一种获得RNA转录本全长序列的技术。利用RACE技术可以根据转录本中的一小段已知序列获得转录本的5′端 (5′RACE-PCR) 或3′端 (3′RACE-PCR) 序列。
SMARTer RACE 5’/3′ Kit(Code No. 634858/59)是优化升级的试剂盒,具有更高的灵敏、更低的背景和更高的特异性。
采用SMART技术,以poly A+ 或总RNA为起始,合成的第一链cDNA可直接进行5′和3′RACE-PCR,不需要adaptor连接等步骤,整个流程更快、更易操作。SMART RACE 还结合了强有力的抑制性PCR,显著地减少了RACE实验中的弥散现象,是获得全长cDNA的有效方法。
SMARTer RACE 5’/3′ Kit(Code No. 634858/59)包含了除基因特异性引物外的所有组分,流程更精简。使用这一个试剂盒,即可以在8小时内完成第一链cDNA合成到克隆RACE片段的流程,并在第二天就可以挑取克隆进行分析。试剂盒包含了性能优良的SeqAmp DNA Polymerase,对于长片段或高GC含量等高难度片段的扩增也适用;NucleoSpin Gel and PCR Clean-Up kit用于纯化PCR产物; 高效无缝克隆In-Fusion Snap Assembly Master Mix;高效率感受态细胞Stellar Competent Cells*
* SMARTer® RACE 5’/3′ Kit (no competent cells) (634499)为不含感受态细胞的包装形式,便于长时间存放,组分的选择空间更大,实验搭配更灵活。另有高转化效率的感受态细胞单品Stellar化学转化感受态细胞供您选择,满足多种实验需求。
SMART RACE具有以下优势:
1. 更便捷的操作
采用SMARTer RACE 技术,可以在一管内完成两步反应。只需很少的操作RNA和新合成cDNA的步骤,整个实验只需4小时。
2. 只需10 ng总RNA
SMARTer RACE 尤其适用于起始材料有限的情况,如活体组织检查样本、组织分离术样本、针吸活检样本、胚胎组织及病变组织样本等。优化的实验操作,显著地降低了非特异性扩增,这对有限的实验材料尤为重要。
3. 富集具有完整5′端序列的cDNA
专门设计的SMARTer Oligo 优先与新合成的cDNA 的5′端结合,可以富集具有完整5′端序列的cDNA,因此,可以获得全长基因序列或上游调控序列。
4. 不需要RNA预处理
SMARTer RACE方法不需要RNA预处理。可以采用总RNA,甚至是含有基因组DNA的RNA材料进行实验。
 
■ 制品特点
1. 低背景的完整RACE试剂盒
2. SMARTer技术合成完整的5′和3′端序列
3. 合成的第一链cDNA直接用于RACE PCR,无需接头连接
4. 只需10 ng总RNA
 
产品详情请点击:RACE扩增试剂盒SMART 5’ RACE & 3’ RACE
 
 

页面更新:2023-07-26 15:59:13

SMART MMLV反转录酶酶试剂盒Takara Clontech

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SMART MMLV反转录酶
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech 639522 SMART MMLV Reverse Transcriptase 2,000 Units ¥836 SMART MMLV反转录酶 SMART MMLV反转录酶 SMART MMLV反转录酶
Clontech 639523 SMART MMLV Reverse Transcriptase 8,000 Units ¥1,308 SMART MMLV反转录酶 SMART MMLV反转录酶 SMART MMLV反转录酶
Clontech 639524 SMART MMLV Reverse Transcriptase 20,000 Units ¥2,935 SMART MMLV反转录酶 SMART MMLV反转录酶 SMART MMLV反转录酶
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Code No. 产品名称
639522   SMART® MMLV Reverse Transcriptase
639523   SMART® MMLV Reverse Transcriptase
639524   SMART® MMLV Reverse Transcriptase
 
SMART MMLV Reverse Transcriptase是一种高纯度的反转录酶。来源于莫洛尼鼠白血病病毒,本酶去除RNase和其他易引入RT反应的核酸酶。
SMART MMLV RT有效防止模板RNA降解,可从大多数模板合成高质量的全长cDNA(高达11.7 kb)。
 
产品特点
· 合成高质量的全长cDNA(高达11.7 kb)
· 可扩增稀有的转录子
· 保持原始RNA的复杂性
· 稳定高纯的MMLV
 
 
产品详情请点击:SMART MMLV反转录酶
 
 

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单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit酶试剂盒Takara Clontech

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单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech R400748 SMART-Seq® HT PLUS Kit 48 Rxns ¥27,766 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
Clontech R400744 Unique Dual Index Kit – 48U 48 Rxns ¥5,542 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
Clontech 634455 SMART-Seq® HT Kit 12 Rxns ¥4,769 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
Clontech 634456 SMART-Seq® HT Kit 48 Rxns ¥17,137 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
Clontech 634436 SMART-Seq® HT Kit 480 Rxns ¥126,928 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
Clontech 634437 SMART-Seq® HT Kit 96 Rxns ¥33,001 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
Clontech 634438 SMART-Seq® HT Kit 192 Rxns ¥60,924 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
Clontech 634439 SMART-Seq® HT Lysis Components 96 Rxns ¥1,284 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
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单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 延伸     单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
         
单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
 
 
SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT Plus Kit:自动化友好型的单细胞mRNA全长分析
· 自动化友好型 - 兼容自动化工作站,更少的时间分析更多的样本
· 高灵敏度 - 可以从单细胞或10 pg总RNA起始(起始量:1-100个细胞或10 pg-1 ng总RNA)
· 高质量的RNA-Seq数据 - 保留全长基因信息,低rRNA比率,高基因检出数,有效扩增GC-rich转录本
· 单管操作流程 - SMART-Seq HT PLUS Kit包含完整的cDNA合成和文库构建流程,分别在单管中进行,减少样品损失与混淆,降低手动操作误差
· 增强的测序性能 - SMART-Seq HT PLUS Kit整合双端特殊index(UDI),即便多个文库pool后用高通量型illumina测序仪(如Novaseq)分析,也能得到正确结果
· 更高的文库产量 - 更便于使用高通量型illumina测序仪测序(如Novaseq),或保存剩余的文库用于多次测序
 
产品说明
SMART-Seq HT Kit(SS-HT)和SMART-Seq HT Plus Kit(SS-HT PLUS)均兼容自动化移液工作站,采用oligo(dT)引物,支持1-100个细胞或10 pg-1 ng总RNA起始。
SS-HT试剂盒是从第4代的SMARTer Ultra Low试剂(SMART-Seq v4)发展而来的,具有简化的操作流程,将原有的反转录和PCR扩增步骤整合为一步,且不影响性能。细胞分离或RNA提取后,仅通过一步RT-PCR扩增双链cDNA,然后进行纯化完成操作。cDNA合成可在4小时内完成,整个文库构建方案可在2天内完成。而且,SMART-Seq HT试剂盒具有与SMART-Seq v4试剂盒相同的灵敏度和可重复性。核心的SMART技术,是一种对全转录组研究,以及包括细胞内剪接位点,可变剪接研究的非常强大的工具,且可以检测全长基因。 Oligo(dT)可以从高品质总RNA(RIN> 8)或完整细胞中特异性扩增mRNA。 通过采用LNA技术,提升了模板转换的效率与基因检出数等性能。
SS-HT PLUS Kit在包含核心的cDNA合成试剂基础上,同时整合了Takara Bio Group专利性的文库构建技术(U.S. Patents 7,803,550, 8,399,199, 8,728,737, 9,598,727
,10,196,686, 10,208,337, and 11,072,823及单次使用的双端特殊index(UDI),提供完整的单细胞cDNA合成到文库构建的实验体验。建库试剂中包含片段化酶,以实现对合成cDNA的片段化,接着利用特别的茎环形接头构建高品质illumina文库。在建库阶段,单管两步操作、过程中无需纯化、2 h即可建成文库!
 
SS-HT Kit:流程缩短、性能不变!
单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
图1 SMART-Seq HT的技术流程
 
单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
图2 SMART-Seq v4和SMART-Seq HT工作流程的比较
 
SMART-Seq HT(右)是由SMART-Seq v4方法(左)经过改进而来的一个手动操作时间更短的高通量工作流程。使用FACS方法获得单细胞,SMART-Seq HT试剂盒只需3个操作步骤即可制备cDNA,而SMART-Seq v4试剂盒需要6步。SMART-Seq HT工作流程的一个重要步骤是一步RT-PCR,即使用一步RT-PCR缓冲液,进行高效的反转录和PCR扩增cDNA的过程。
 
单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
图3 使用SMART-seq v4 kit和SMART-Seq HT kit从FACS分选的293T细胞中获得的高重复性的基因表达数据
 
使用SMART-Seq v4试剂盒(SSv4_1-SSv4_12)和SMART-Seq HT试剂盒( HT_1-HT_9)(上图)从21个293T细胞单细胞制备文库,并对每个细胞获得的基因表达性进行评估。层次聚类热图展示了所有细胞之间的Euclidean distances,并显示从0.74到0.97的Pearson相关性。不仅用相同试剂盒制备的细胞之间可以观察到非常高的相关性,而在两种试剂盒之间的相关性也非常高。这些数据表明,SMART-Seq HT的工作流程与SMART-Seq v4相比,在基因表达分析中没有显著的偏差。
 
SS-HT PLUS Kit:不只是一个Kit,更是完整的单细胞RNA-Seq建库体验!
为了使单细胞cDNA合成、文库构建实验“一步”到位,我们全新推出了SS-HT PLUS Kit。
单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
 
单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
 
从高灵敏度、高重复性的cDNA合成出发,构建更高品质illumina文库
 
Takara科学家从10 pg小鼠脑total RNA起始,采用SMART-Seq HT Kit完成cDNA合成。随后分别使用SS-HT Plus Kit中的SMART-Seq Library Prep Kit模块与市面上较常用的A公司试剂盒构建文库,并比较性能差异。
 
单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
(比较数据来源于Takara Bio USA, Inc.)
 
从测试数据中可以看出,SS-HT PLUS Kit所建文库的产量是A公司Kit产量的5倍,而更高的文库产量更适于高通量型Illumina测序仪,如Novaseq。
 
两种方法所建文库随后用Nextseq 500完成测序,并对TPM(Transcripts per million)≥0.1的基因数进行统计。SS-HT PLUS文库能比A公司文库多检出10%的基因,从同样的cDNA起始能“捕获”更全的信息!
 
 
产品详情请点击:单细胞mRNA全长分析SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
 
更多实验数据:
SS-HT Kit
SS-HT Plus Kit
 
延伸阅读:
单细胞NGS解决方案
 
 

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单细胞RNA测序-SMART-Seq mRNA LP & SMART-Seq mRNA酶试剂盒Takara Clontech

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单细胞RNA测序-SMART-Seq mRNA LP & SMART-Seq mRNA
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech 634768 SMART-Seq mRNA LP 24 Rxns ¥18,634 单细胞RNA测序-SMART-Seq mRNA LP & SMART-Seq mRNA 单细胞RNA测序-SMART-Seq mRNA LP & SMART-Seq mRNA 单细胞RNA测序-SMART-Seq mRNA LP & SMART-Seq mRNA
Clontech 634769 SMART-Seq mRNA LP 96 Rxns ¥63,356 单细胞RNA测序-SMART-Seq mRNA LP & SMART-Seq mRNA 单细胞RNA测序-SMART-Seq mRNA LP & SMART-Seq mRNA 单细胞RNA测序-SMART-Seq mRNA LP & SMART-Seq mRNA
Clontech 634771 SMART-Seq mRNA LP 4 x 96 Rxns ¥228,082 单细胞RNA测序-SMART-Seq mRNA LP & SMART-Seq mRNA 单细胞RNA测序-SMART-Seq mRNA LP & SMART-Seq mRNA 单细胞RNA测序-SMART-Seq mRNA LP & SMART-Seq mRNA
Clontech 634772 SMART-Seq® mRNA 24 Rxns ¥15,791 单细胞RNA测序-SMART-Seq mRNA LP & SMART-Seq mRNA 单细胞RNA测序-SMART-Seq mRNA LP & SMART-Seq mRNA 单细胞RNA测序-SMART-Seq mRNA LP & SMART-Seq mRNA
Clontech 634773 SMART-Seq® mRNA 96 Rxns ¥53,691 单细胞RNA测序-SMART-Seq mRNA LP & SMART-Seq mRNA 单细胞RNA测序-SMART-Seq mRNA LP & SMART-Seq mRNA 单细胞RNA测序-SMART-Seq mRNA LP & SMART-Seq mRNA
Clontech 634770 SMART-Seq® mRNA 4 x 96 Rxns ¥193,290 单细胞RNA测序-SMART-Seq mRNA LP & SMART-Seq mRNA 单细胞RNA测序-SMART-Seq mRNA LP & SMART-Seq mRNA 单细胞RNA测序-SMART-Seq mRNA LP & SMART-Seq mRNA
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可靠的单细胞/微量样本的mRNA全长分析
SMART-Seq mRNA LP & SMART-Seq mRNA
· 高灵敏度 — 起始量:1-1000个细胞或10 pg-100 ng总RNA
· 高质量的RNA-Seq数据 — 高基因检出数,支持分析转录本异构体、融合基因、点突变等
· 单管操作流程 — SMART-Seq mRNA LP包含完整的cDNA合成和文库构建流程,分别在单管中进行,减少样品损失与混淆,降低手动操作误差
· 增强的测序性能 — SMART-Seq mRNA LP可搭配整合双端特殊index(UDI),构建Illumina测序文库
· 完整的流程 — 搭配特别开发的Cogent™ NGS Analysis Pipeline (CogentAP) Cogent NGS Discovery Software (CogentDS)完成测序数据分析。
 
■ 产品说明:
SMART-Seq mRNA LP和SMART-Seq mRNA,这两个试剂盒是Takara经典的SMARTer Ultra low系列。它们都是使用oligo(dT)引物起始,优化用于从10 pg-100 ng的高品质total RNA(RIN≥8)或1-1000个完整细胞的全长转录组分析。

SMART-Seq mRNA是基于SMART技术(Switching Mechanism at 5′ End of RNA Template)优化改良,用于微量RNA或少量细胞cDNA合成的试剂盒,提供全长转录本信息,支持分析转录本异构体、融合基因、点突变等。另外,TSO中整合了LNA(locked nucleic acid)技术,提升了模板转换效率,能获得更高的再现性、更均一的gene body覆盖度,高GC含量转录本也能得到正确分析。

SMART-Seq mRNA LP在包含核心的cDNA合成试剂基础上,采用Takara Bio Group专利性的文库构建技术(U.S. Patents 7,803,550, 8,399,199, 8,728,737, 9,598,727, 10,196,686, 10,208,337, 和11,072,823),利用特别的茎环形接头构建高品质Illumina文库。另外,搭配使用的双端特殊index(UDI),可以提供完整的从样品到cDNA合成到文库构建的实验体验。同时搭配特别开发的Cogent NGS生物信息学分析软件,能直接对下机数据进行分析(*科研及盈利机构在用该试剂盒建库后,均可免费使用Cogent NGS分析测序数据!)

如果对上述特点感兴趣,并正在使用完整的、高质量的单细胞,推荐使用SMART-Seq Single Cell PLUS Kit

如果是降解样本,选择随机引物起始,推荐使用:SMART-Seq® Stranded Kit

 
■ 流程概要:
单细胞RNA测序-SMART-Seq mRNA LP & SMART-Seq mRNA
 
注意SMART-Seq mRNA LP和SMART-Seq mRNASMART-Seq v4 PLUSSMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing的等效替代品,只有如下细微变动,本次更新并不影响这些试剂盒的流程和性能。
 
· SeqAmp CB PCR buffer替代SeqAmp PCR buffer,以改善核酸纯化过程磁珠-沉淀物形成。
· 不再包含Afa I, 10X Afa I Buffer和0.1% BSA(因为在protocol中未使用)
· 样本的起始范围从10 pg~10 ng扩展到10 pg~100 ng total RNA
· 更灵活的选择:SMART-Seq mRNA LP试剂盒中不包含index,但也可以与Unique Dual Index (UDI) kits搭配使用
 
 
产品详情请点击:单细胞RNA测序-SMART-Seq mRNA LP & SMART-Seq mRNA
 
 
 

 

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单细胞转录组分析SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System酶试剂盒Takara Clontech

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单细胞转录组分析SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech 634832 SMARTer Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System(库存销售完毕即终卖) Each ¥14,119 单细胞转录组分析SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System 单细胞转录组分析SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System 单细胞转录组分析SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System
Clontech 634833 SMARTer Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System(库存销售完毕即终卖) Each ¥50,943 单细胞转录组分析SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System 单细胞转录组分析SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System 单细胞转录组分析SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System
Clontech 635025 SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for the Fluidigm C1 System, 4 IFCs(库存销售完毕即终卖) Each ¥17,360 单细胞转录组分析SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System 单细胞转录组分析SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System 单细胞转录组分析SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System
Clontech 635026 SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for the Fluidigm C1 System, 10 IFCs(库存销售完毕即终卖) Each ¥34,829 单细胞转录组分析SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System 单细胞转录组分析SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System 单细胞转录组分析SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System
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SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System
—性能卓越的单细胞转录组分析
· 升级的SMART技术—带有LNA修饰的SMART-Seq v4 oligo 加升级的配方带来更好的性能
   (更高灵敏度,更好重复性,更多的GC-rich基因)
· 文库构建只需2天—cDNA合成约需2h,其次需要在Fluidigm C1平台中运行8小时的
  
 SMART-Seq v4 script,整个文库构建过程可以在2个工作日内完成
· 新script—支持mRNA Seq IFC 和 Open App IFC,SMART-Seq v4 script可以从
   Fluidigm Script Hub下载
 
单细胞转录组研究对于细胞群体内每个细胞的基因表达变化研究是非常重要的。Takara Clontech 开发了兼容Fluidigm IFC (integrated fluidic circuit)的强大的单细胞研究工具。高灵敏度的SMARTer技术结合高通量自动化的Fluidigm C1系统,可以对转录组进行深入细致分析。
我们提供两种版本的单细胞mRNA-Seq 试剂,用于Fluidigm C1单细胞自动制备系统。新版本SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for the Fluidigm C1 System沿袭了SMART-Seq v4的优势,结合了SMART技术和LNA修饰,称为"SMARTer-seq® chemistry"。本试剂超越了发表过的操作流程和以往版本的试剂,利用本试剂可以获得灵敏度更高,重复性更好,GC-rich、AT-rich基因代表性更好的测序数据。适用于本试剂的新script支持mRNA Seq IFC 和 Open App IFC,可以从Fluidigm Script Hub下载获得。
 
Technote:
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单细胞转录组分析SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System
 
产品详情请点击:单细胞转录组分析SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System
 
 

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SMART MMLV反转录酶酶试剂盒Takara Clontech

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SMART MMLV反转录酶
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech 639522 SMART MMLV Reverse Transcriptase 2,000 Units ¥836 SMART MMLV反转录酶 SMART MMLV反转录酶 SMART MMLV反转录酶
Clontech 639523 SMART MMLV Reverse Transcriptase 8,000 Units ¥1,308 SMART MMLV反转录酶 SMART MMLV反转录酶 SMART MMLV反转录酶
Clontech 639524 SMART MMLV Reverse Transcriptase 20,000 Units ¥2,935 SMART MMLV反转录酶 SMART MMLV反转录酶 SMART MMLV反转录酶
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Code No. 产品名称
639522   SMART® MMLV Reverse Transcriptase
639523   SMART® MMLV Reverse Transcriptase
639524   SMART® MMLV Reverse Transcriptase
 
SMART MMLV Reverse Transcriptase是一种高纯度的反转录酶。来源于莫洛尼鼠白血病病毒,本酶去除RNase和其他易引入RT反应的核酸酶。
SMART MMLV RT有效防止模板RNA降解,可从大多数模板合成高质量的全长cDNA(高达11.7 kb)。
 
产品特点
· 合成高质量的全长cDNA(高达11.7 kb)
· 可扩增稀有的转录子
· 保持原始RNA的复杂性
· 稳定高纯的MMLV
 
 
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RACE扩增试剂盒SMART 5’ RACE & 3’ RACE酶试剂盒Takara Clontech

上海金畔生物科技有限公司代理Takara酶试剂盒全线产品,欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

RACE扩增试剂盒SMART 5’ RACE & 3’ RACE
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech 634913 Marathon cDNA Amplification Kit 5 cDNA & 100 PCR Rxns ¥10,494 RACE扩增试剂盒SMART 5’ RACE & 3’ RACE RACE扩增试剂盒SMART 5’ RACE & 3’ RACE RACE扩增试剂盒SMART 5’ RACE & 3’ RACE
Clontech 634858 SMARTer RACE 5’/3’ Kit 10 Rxns ¥7,000
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RACE扩增试剂盒SMART 5’ RACE & 3’ RACE RACE扩增试剂盒SMART 5’ RACE & 3’ RACE RACE扩增试剂盒SMART 5’ RACE & 3’ RACE
Clontech 634859 SMARTer RACE 5’/3’ Kit 20 Rxns ¥13,300
¥9530
RACE扩增试剂盒SMART 5’ RACE & 3’ RACE RACE扩增试剂盒SMART 5’ RACE & 3’ RACE RACE扩增试剂盒SMART 5’ RACE & 3’ RACE
Clontech 634499 SMARTer RACE 5’/3’ Kit (no competent cells) 20 Rxns ¥10,570
¥8000
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Clontech 634922 Universal Primer Mix 100 Rxns ¥1,825
¥1460
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由于产品升级,从即日起,您订购的SMARTer RACE试剂盒(634858/59)中的组分In-Fusion HD Cloning Kit (Code No. 639648)将陆续替换为性能更高的In-Fusion® Snap Assembly Master Mix (Code No. 638947),该组分数量保持不变,请以实际收到的产品为准。如需含HD组分的旧版说明书或产品组分列表文件,请邮件联络sales@jinpanbio.com
 
 
■ 制品说明
RACE (Rapid Amplification of cDNA Ends) 是一种获得RNA转录本全长序列的技术。利用RACE技术可以根据转录本中的一小段已知序列获得转录本的5′端 (5′RACE-PCR) 或3′端 (3′RACE-PCR) 序列。
SMARTer RACE 5’/3′ Kit(Code No. 634858/59)是优化升级的试剂盒,具有更高的灵敏、更低的背景和更高的特异性。
采用SMART技术,以poly A+ 或总RNA为起始,合成的第一链cDNA可直接进行5′和3′RACE-PCR,不需要adaptor连接等步骤,整个流程更快、更易操作。SMART RACE 还结合了强有力的抑制性PCR,显著地减少了RACE实验中的弥散现象,是获得全长cDNA的有效方法。
SMARTer RACE 5’/3′ Kit(Code No. 634858/59)包含了除基因特异性引物外的所有组分,流程更精简。使用这一个试剂盒,即可以在8小时内完成第一链cDNA合成到克隆RACE片段的流程,并在第二天就可以挑取克隆进行分析。试剂盒包含了性能优良的SeqAmp DNA Polymerase,对于长片段或高GC含量等高难度片段的扩增也适用;NucleoSpin Gel and PCR Clean-Up kit用于纯化PCR产物; 高效无缝克隆In-Fusion Snap Assembly Master Mix;高效率感受态细胞Stellar Competent Cells*
* SMARTer® RACE 5’/3′ Kit (no competent cells) (634499)为不含感受态细胞的包装形式,便于长时间存放,组分的选择空间更大,实验搭配更灵活。另有高转化效率的感受态细胞单品Stellar化学转化感受态细胞供您选择,满足多种实验需求。
SMART RACE具有以下优势:
1. 更便捷的操作
采用SMARTer RACE 技术,可以在一管内完成两步反应。只需很少的操作RNA和新合成cDNA的步骤,整个实验只需4小时。
2. 只需10 ng总RNA
SMARTer RACE 尤其适用于起始材料有限的情况,如活体组织检查样本、组织分离术样本、针吸活检样本、胚胎组织及病变组织样本等。优化的实验操作,显著地降低了非特异性扩增,这对有限的实验材料尤为重要。
3. 富集具有完整5′端序列的cDNA
专门设计的SMARTer Oligo 优先与新合成的cDNA 的5′端结合,可以富集具有完整5′端序列的cDNA,因此,可以获得全长基因序列或上游调控序列。
4. 不需要RNA预处理
SMARTer RACE方法不需要RNA预处理。可以采用总RNA,甚至是含有基因组DNA的RNA材料进行实验。
 
■ 制品特点
1. 低背景的完整RACE试剂盒
2. SMARTer技术合成完整的5′和3′端序列
3. 合成的第一链cDNA直接用于RACE PCR,无需接头连接
4. 只需10 ng总RNA
 
产品详情请点击:RACE扩增试剂盒SMART 5’ RACE & 3’ RACE
 
 

页面更新:2023-07-26 15:59:13

Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit酶试剂盒Takara Clontech

上海金畔生物科技有限公司代理Takara酶试剂盒全线产品,欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech R400752 SMART-Seq® v4 PLUS Kit(库存销售完毕即终卖) 48 Rxns ¥49,837 Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit
Clontech R400744 Unique Dual Index Kit – 48U 48 Rxns ¥5,542 Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit
Clontech 634888 SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing(库存销售完毕即终卖) 12 Rxns ¥14,525 Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit
Clontech 634889 SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing(库存销售完毕即终卖) 24 Rxns ¥24,600 Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit
Clontech 634890 SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing(库存销售完毕即终卖) 48 Rxns ¥39,366 Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit
Clontech 634891 SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing(库存销售完毕即终卖) 96 Rxns ¥69,513 Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit
Clontech 634892 SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing(库存销售完毕即终卖) 192 Rxns ¥121,445 Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit
Clontech 634893 SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing(库存销售完毕即终卖) 480 Rxns ¥241,367 Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit
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Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit 延伸 Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit
 
  Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit
 
 
SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 Plus Kit:性能卓越的Ultra low mRNA全长分析
· 高灵敏度 - 可以从10 pg总RNA起始(起始量:1-1000个细胞或10 pg-10 ng总RNA)
· 高质量的RNA-Seq数据 - 保留全长基因信息,低rRNA比率,高基因检出数,有效扩增GC-rich转录本
· 单管操作流程 - SMART-Seq v4 PLUS Kit包含完整的cDNA合成和文库构建流程,分别在单管中进行,减少样品损失与混淆,降低手动操作误差
·增强的测序性能 - SMART-Seq v4 PLUS Kit整合双端特殊index(UDI),即便多个文库pool后用高通量型Illumina测序仪(如Novaseq)分析,也能得到正确结果
·更高的文库产量 - 更便于使用高通量型Illumina测序仪(如Novaseq)测序,或保存剩余的文库用于多次测序
 
产品说明
SMART-Seq v4 Kit(SSv4)和SMART-Seq v4 PLUS Kit是第4代SMARTer Ultra low系统,能正确分析低至10 pg的Ultra low RNA,具有高灵敏度、高再现性的特点。
SMART-Seq v4 Kit是基于经典的SMART技术优化改良而来的,用于Ultra low RNA或少量细胞cDNA合成的试剂盒,提供全长转录本的信息,支持分析转录本异构体、融合基因、点突变等广受科研人员关注的内容,具有更高的灵敏度和再现性。SMART-Seq v4的Oligo中整合锁核酸(Locked Nucleic Acid, LNA)技术,提升了SSv4模板转换效率,能获得更高的再现性、更均一的gene body覆盖度,高GC含量转录本也能得到正确分析。
SMART-Seq v4 PLUS Kit在包含核心的cDNA合成试剂基础上,同时整合了Takara Bio Group专利性的文库构建技术(U.S. Patents 7,803,550, 8,399,199, 8,728,737, 9,598,727, 10,196,686, 10,208,337, and 11,072,823)及单次使用的双端特殊index(UDI),提供完整的Ultra low RNA或少量细胞由cDNA合成到文库构建的实验体验。建库试剂中包含片段化酶,以实现对合成cDNA的片段化,接着利用特别的茎环形接头构建高品质Illumina文库。在建库阶段,单管两步操作、过程中无需纯化、2 h即可建成文库!
 
SSv4 Kit:更受客户认可的经典技术!
 
Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit
图1. SMART-Seq v4 模板转换机制
 
Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit
表1. 1、100、1000个Hela细胞主要mRNA-Seq数据 (Illumina® MiSeq® platform)
 
Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit
表2. 10 pg-10 ng的人脑总RNA的mRNA-Seq (Illumina® MiSeq® platform)
 
SSv4 PLUS Kit:不只是一个Kit,更是完整的Ultra low RNA-Seq建库体验
为了使Ultra low RNA或少量细胞cDNA合成、文库构建实验“一步”到位,我们全新推出了SSv4 PLUS Kit,从此您无需再单独购买建库模块,也不用“忍受”不同厂家不同步的供货周期。
 
Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit
 
Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit
 
从高灵敏度、高重复性的cDNA合成出发,构建更高品质Illumina文库
Takara科学家从10 pg小鼠脑total RNA起始,采用SMART-Seq v4 Kit完成cDNA合成。随后分别使用SSv4 Plus Kit中的SMART-Seq Library Prep Kit模块与市面上较常用的A公司试剂盒构建文库,并比较性能差异。
 
Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit
比较数据来源于Takara Bio USA, Inc.
 
从测试数据中可以看出,SSv4 PLUS Kit所建文库的产量高于A公司Kit产量,而更高的文库产量更适于高通量型Illumina测序仪,如Novaseq。
 
两种方法所建文库随后用Nextseq 500完成测序,并对TPM(Transcripts per million)≥0.1的基因数进行统计。SSv4 PLUS文库能比A公司文库检出更多基因,从同样的cDNA起始能“捕获”更全的信息!
 
 
产品详情请点击:Ultra low mRNA全长分析试剂盒SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit
 
更多实验数据:
SSv4 Kit
SS v4 Plus Kit
 
延伸阅读:
单细胞NGS解决方案
 
 
 

页面更新:2024-01-25 14:45:05

小鼠TCR分析SMART-Seq Mouse TCR (with UMIs)酶试剂盒Takara Clontech

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小鼠TCR分析SMART-Seq Mouse TCR (with UMIs)
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech 634815 SMART-Seq® Mouse TCR (with UMIs) 24 Rxns ¥19,351 小鼠TCR分析SMART-Seq Mouse TCR (with UMIs) 小鼠TCR分析SMART-Seq Mouse TCR (with UMIs) 小鼠TCR分析SMART-Seq Mouse TCR (with UMIs)
Clontech 634816 SMART-Seq® Mouse TCR (with UMIs) 96 Rxns ¥63,718 小鼠TCR分析SMART-Seq Mouse TCR (with UMIs) 小鼠TCR分析SMART-Seq Mouse TCR (with UMIs) 小鼠TCR分析SMART-Seq Mouse TCR (with UMIs)
Clontech 634814 SMART-Seq® Mouse TCR (with UMIs) 4×96 Rxns ¥239,105 小鼠TCR分析SMART-Seq Mouse TCR (with UMIs) 小鼠TCR分析SMART-Seq Mouse TCR (with UMIs) 小鼠TCR分析SMART-Seq Mouse TCR (with UMIs)
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SMART-Seq Mouse TCR (with UMIs)
· 适合不同起始量的样本:支持1 ng-1 μg小鼠脾脏或T细胞来源的total RNA,或者10 ng -1 μg 小鼠全血、骨髓或者胸腺来源的total RNA,或者纯化后完整的小鼠T细胞(100-10,000个)起始
· 无需多对引物:每次反应仅需一对引物扩增相应的TCR亚基
· 添加UMI校正偏差:引入UMI建库,校正PCR偏差及测序错误产生的reads
· 更可靠的样本-数据拆析结果:搭配使用UDI index建库,在高通量型Illumina测序仪上有更好的样本拆析与测序可靠性
· 更灵活的测序选择:可自由选择分析V(D)J 全长信息,或是分析CDR3区
 
■ 产品说明
SMART-Seq Mouse TCR (with UMIs)是一款具有高灵敏度和低偏差的小鼠TCR NGS文库构建试剂盒。该试剂盒整合SMART(Switching Mechanism at 5′ end of RNA Template)全长cDNA合成技术与5’RACE技术,可捕获TRA和TRB基因完整的V(D)J可变区,用于后续NGS分析。
该试剂盒支持使用不同input量的RNA(RIN>7)或细胞起始,均可获得高品质的测序文库,如小鼠脾脏或T细胞来源 total RNA(1 ng-1 μg),以及全血、骨髓、胸腺来源total RNA(10 ng -1 μg),或纯化后完整的T细胞(100-10,000个)。
文库中可同时包含α链和β链的多样性信息。
同时,该试剂盒包含UMI(Unique Molecular Identifier),用以去除PCR偏差及测序错误所产生的reads,提供更正确和可靠的结果。
搭配使用UDI(Unique Dual Indexs),最多可支持384个样本同时测序。
 
■ 建库原理
小鼠TCR分析SMART-Seq Mouse TCR (with UMIs)
 
 
■ 不同起始量和不同样本类型的克隆型检测数据
小鼠TCR分析SMART-Seq Mouse TCR (with UMIs)
图1 评估试剂盒在不同样本起始量和样本类型中的性能表现
 
Panel A 分别对10,100,250,500和1,000 ng小鼠脾脏来源 RNA使用SMART-Seq Mouse TCR (with UMIs)制备了TRA (蓝色) 和TRB (紫色) 文库,然后在Illumina NextSeq测序(PE 150),测序reads downsampled至1.5×107。结果显示,随着起始量的增加,检测到的克隆型数量也随之增加。
Panel B 分别对四种不同样品类型的小鼠RNA(200 ng RNA)使用SMART-Seq Mouse TCR制备文库。然后在Illumina NextSeq测序(PE 150),测序reads downsampled至2.5×107。测序结果表明,TCR序列在这些样品类型中都被灵敏地检测到,这表明该试剂盒非常适合用于小鼠TCR的分析。
 
 
■ 再现性和准确度测试数据
小鼠TCR分析SMART-Seq Mouse TCR (with UMIs)
图2 使用UMIs校正PCR重复和测序错误
 
Panel A. 对10 ng小鼠脾脏来源 RNA使用SMART-Seq Mouse TCR (with UMIs)制备TRA和TRB文库。其中蓝线和紫线分别是指经过UMI修正误差和和没有经过UMI修正误差的数据。
Panel B. 为了评估SMART-Seq Mouse TCR (with UMIs)的再现性,使用该试剂盒分别对10 ng和100 ng小鼠脾RNA起始样本构建TCR文库。然后在Illumina MiSeq测序。维恩图显示分别使用300 cycles和600 cycles测序时,两者之间至少有87%的克隆型重叠,表明该试剂盒卓越的再现性。
 
 
■ 更灵活的测序选择
小鼠TCR分析SMART-Seq Mouse TCR (with UMIs)
图3 评估试剂盒的测序灵活性
 
为了评估该试剂盒是否支持全长V (D) J或CDR3序列,使用该试剂盒分别对10 ng和100 ng小鼠脾脏RNA起始样本构建TCR文库。然后在Illumina MiSeq测序平台使用300 cycles和600 cycles进行测序。测序read downsampled 至1×106。使用Takara Bio Cogent NGS Immune Profiler软件处理数据。
 
产品详情请点击:小鼠TCR分析SMART-Seq Mouse TCR (with UMIs)
 
点击查看:更多数据
 

页面更新:2024-03-12 09:09:46

人TCR分析SMART-Seq Human TCR (with UMIs)酶试剂盒Takara Clontech

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人TCR分析SMART-Seq Human TCR (with UMIs)
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech 634780 SMART-Seq® Human TCR (with UMIs) 24 Rxns ¥19,351 人TCR分析SMART-Seq Human TCR (with UMIs) 人TCR分析SMART-Seq Human TCR (with UMIs) 人TCR分析SMART-Seq Human TCR (with UMIs)
Clontech 634781 SMART-Seq® Human TCR (with UMIs) 96 Rxns ¥63,718 人TCR分析SMART-Seq Human TCR (with UMIs) 人TCR分析SMART-Seq Human TCR (with UMIs) 人TCR分析SMART-Seq Human TCR (with UMIs)
Clontech 634779 SMART-Seq® Human TCR (with UMIs) 4 x 96 Rxns ¥239,105 人TCR分析SMART-Seq Human TCR (with UMIs) 人TCR分析SMART-Seq Human TCR (with UMIs) 人TCR分析SMART-Seq Human TCR (with UMIs)
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SMART-Seq Human TCR (with UMIs)
· 适合不同起始量的样本—支持total RNA(10 ng-1 μg外周血淋巴细胞来源,或者20 ng -200 ng 全血来源,或者1 ng-100 ng T细胞来源的total RNA),或者纯化后完整的T细胞(1,000-10,000个)起始
· 无需多对引物—每次反应仅需一对引物扩增相应的TCR亚基
· 添加UMI校正偏差—引入UMI建库,校正PCR偏差及测序错误产生的reads
· 更灵敏特异的克隆型分析—优化的cDNA文库构建技术,确保克隆型的可靠分析
· 更可靠的样本-数据拆析结果—搭配使用UDI index建库,在高通量型Illumina测序仪上有更好的样本拆析与测序可靠性
· 更灵活的测序平台选择—可自由选择Miseq平台(分析V(D)J 全长信息),或是其它Illumina平台(分析CDR3区),支持最多384个样本同时测序
 
■ 产品说明
SMART-Seq Human TCR (with UMIs)是一款具有更高重复性和特异性的TCR NGS文库构建试剂盒。该试剂盒整合SMART(Switching Mechanism at 5′ end of RNA Template)全长cDNA合成技术与5’RACE技术,可捕获TRA和TRB基因完整的V(D)J可变区,用于后续NGS分析。
该试剂盒支持使用不同input量的RNA(RIN≥8,取决于样本类型)或细胞起始,均可获得高品质的测序文库,如外周血淋巴细胞total RNA(10 ng-1 μg)、全血total RNA(20 ng -200 ng)以及T细胞total RNA(1 ng-100 ng),或纯化后完整的T细胞(1,000-10,000个)。文库中可同时包含α链和β链的多样性信息。 同时,该试剂盒包含UMI(Unique Molecular Identifier),用以去除PCR偏差及测序错误所产生的reads,提供更正确和可靠的结果。
搭配使用UDI(Unique Dual Indexs),能更正确拆析采用图案化流动槽技术(Patterned flow cell)测序平台(如NovaSeqTM system)的下机数据,最多可支持384个样本同时测序。
 
■ 建库原理
人TCR分析SMART-Seq Human TCR (with UMIs)
 
■ 不同起始量克隆型检测数据
人TCR分析SMART-Seq Human TCR (with UMIs)
图1 不同的RNA或者T细胞起始量,均能获得高灵敏度和重复性的克隆型检测数据
 
Takara科学家以1、10、100 ng 人CD3+ T细胞total RNA和1,000、10,000个CD3+T细胞制备TRA和TRB文库,测序reads用Cogent NGS Immune Profiler软件分析。结果显示,无论采用RNA还是以复杂度较高的T细胞直接起始,该试剂盒所建文库均能获得良好的克隆型检测数据。
 
■ 灵敏度测试数据
人TCR分析SMART-Seq Human TCR (with UMIs)
图2 Takara科学家向100 ng PBMC RNA样本中掺入不同浓度(10%,1%,0.1%,0.01%,0.001%和0.0001%)的Jurkat T细胞RNA(包含TRBV12-3-TRBJ1-2克隆型)。采用该试剂盒扩增TRB CDR3区域并制备文库、NextSeq系统测序。测序reads downsample至 2.5M reads。灰色标记的是所混入的Jurkat RNA检出下限,结果显示,在未通过UMI数据校正时,TRBV12-3的检测极限为0.01%,但是在UMI数据校正的情况下,检测极限下探至0.001%!
 
■ 同类产品比较实验
人TCR分析SMART-Seq Human TCR (with UMIs)
图3 为了比较不同TCR分析方法(DNA based VS RNA based)的性能差异,Takara科学家分别以SMART-Seq Human TCR (with UMIs)(RNA based, 5’RACE)、Company Q(RNA based,接头连接法)、Company A (DNA based, 多重PCR)作为文库构建方案。接着分离了500万个PBMC细胞作为gDNA和RNA的提取材料,并以1.6 μg gDNA和100 ng RNA制备文库,分析TCR a/b文库的克隆型数量。从结果中可以看出,SMART-Seq Human TCR (with UMIs)文库获得TRA和TRB基因平均4.87万和16.3万个克隆型检测数据,远高于Company Q RNA方法及Company A DNA方法所获得克隆型数量!(*NT:Not Tested)
 
数据来源于Takara Bio USA, Inc.
 
关联产品:Unique Dual Index Kit
 
产品详情请点击:人TCR分析SMART-Seq Human TCR (with UMIs)
 
 

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