标签归档：seq

小鼠BCR分析SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs)酶试剂盒Takara Clontech

发表于由

上海金畔生物科技有限公司代理Takara酶试剂盒全线产品，欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

小鼠BCR分析SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs)
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 634352 SMART-Seq® Mouse BCR (with UMIs) 24 Rxns ￥19,351 小鼠BCR分析SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs) 小鼠BCR分析SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs) 小鼠BCR分析SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs)
Clontech 634353 SMART-Seq® Mouse BCR (with UMIs) 96 Rxns ￥63,718 小鼠BCR分析SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs) 小鼠BCR分析SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs) 小鼠BCR分析SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs)
Clontech 634351 SMART-Seq® Mouse BCR (with UMIs) 4 x 96 Rxns ￥239,105 小鼠BCR分析SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs) 小鼠BCR分析SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs) 小鼠BCR分析SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs)
Clontech 634756 Unique Dual Index Kit (1–24) 24 Rxns ￥2,737 小鼠BCR分析SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs) 小鼠BCR分析SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs) 小鼠BCR分析SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs)
Clontech 634752 Unique Dual Index Kit (1–96) 96 Rxns ￥7,370 小鼠BCR分析SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs) 小鼠BCR分析SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs) 小鼠BCR分析SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs)
Clontech 634753 Unique Dual Index Kit (97–192) 96 Rxns ￥7,370 小鼠BCR分析SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs) 小鼠BCR分析SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs) 小鼠BCR分析SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs)
Clontech 634754 Unique Dual Index Kit (193–288) 96 Rxns ￥7,370 小鼠BCR分析SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs) 小鼠BCR分析SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs) 小鼠BCR分析SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs)
Clontech 634755 Unique Dual Index Kit (289–384) 96 Rxns ￥7,370 小鼠BCR分析SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs) 小鼠BCR分析SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs) 小鼠BCR分析SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs)
收藏产品 加入购物车

无标题文档

SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs)
· 完整的BCR分析：支持分析重链(IgG, IgM, IgA, IgD, IgE) 和轻链 (IgK, IgL)
· 灵活的样本起始条件：支持10 ng – 1 μg 小鼠脾脏、骨髓、淋巴结、全血以及PBMC来源的高质量RNA起始（RIN>7）
· 简化的操作流程：组分中的重、轻免疫球蛋白链引物以及酶均是预混形式
· 更可靠测序数据：SMARTer Oligo上引入UMI，用于校正测序错误和PCR偏差
· 灵活的测序平台选择：可自由选择V(D)J全长分析，或只分析CDR3
 
■ 产品说明
SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs)是一款小鼠BCR NGS文库构建试剂盒。该试剂盒整合SMART（Switching Mechanism at 5′ end of RNA Template）全长cDNA合成技术与5’RACE技术，可捕获重链(IgA/D/E/G/M) 和轻链 (IgK/L)基因完整的V(D)J可变区，用于后续NGS分析。
该试剂盒支持不同起始量的RNA（RIN>7）起始，均可获得高品质的测序文库。比如小鼠脾脏、骨髓或者外周血单核细胞（PBMC）纯化的10 ng-1 μg的总RNA，也支持从小鼠血液或者淋巴结中提取的RNA样本。
该试剂盒中的重、轻免疫球蛋白链引物以及酶均是预混形式，减少了试剂组分数量和操作步骤。另外该试剂盒还包括特别的分子条形码（UMI），可以消除PCR错误或duplication以及测序偏向，从而确保获得更准确和可靠的结果。此外，搭配使用的双端特殊index（UDI，Unique Dual Index），可以提供完整的从样品到文库构建的实验体验。
该试剂盒所建文库支持更多样的测序平台。既支持Miseq平台（分析V(D)J全长信息），也支持其它Illumina平台（分析CDR3区），节约成本。
 
■ 应用
· 用于分析组织和循环系统中的B细胞的克隆组织和多样性，了解它们如何影响B细胞的分化途径和功能。
· 发现具有高亲和力的BCR，以便更好地为疫苗接种或传染病治疗提供指导。
· 追踪抗原特异性B细胞在HIV以及其他疾病的小鼠模型中过继转移后的变化和迁移。
· 检查BCR序列，以研究针对新表位的自体抗体随时间的变化，以及这些变化如何与严重的自身免疫疾病相关联，如狼疮。
 
■ 建库原理
小鼠BCR分析SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs)
 
■ 不同起始量的克隆型检测数据
小鼠BCR分析SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs)
为了评价SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs)的性能，以10 ng，100 ng和1,000 ng小鼠脾脏来源RNA起始制备文库，生成150万个测序reads。
Panel A. 检测所有重链(IgA/D/G/M，除了IgE，因为它在正常小鼠样本中的表达量非常低)和轻链 (IgK/L)。结果显示，随着起始量的增加，检测到的克隆型数量也随之增加。
Panel B. 结果显示，重链和轻链的克隆型数量随着起始量的增加也随之增加。
 
 
产品详情请点击：小鼠BCR分析SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs)
点击查看更多数据
 

页面更新：2024-01-17 16:00:45

单细胞mRNA全长分析SMART-Seq mRNA Single Cell LP & SMART-Seq mRNA Single Cell酶试剂盒Takara Clontech

发表于由

上海金畔生物科技有限公司代理Takara酶试剂盒全线产品，欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

单细胞mRNA全长分析SMART-Seq mRNA Single Cell LP & SMART-Seq mRNA Single Cell
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 634786 SMART-Seq mRNA Single Cell LP 24 Rxns ￥18,634 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq mRNA Single Cell LP & SMART-Seq mRNA Single Cell 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq mRNA Single Cell LP & SMART-Seq mRNA Single Cell 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq mRNA Single Cell LP & SMART-Seq mRNA Single Cell
Clontech 634787 SMART-Seq mRNA Single Cell LP 96 Rxns ￥63,356 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq mRNA Single Cell LP & SMART-Seq mRNA Single Cell 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq mRNA Single Cell LP & SMART-Seq mRNA Single Cell 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq mRNA Single Cell LP & SMART-Seq mRNA Single Cell
Clontech 634788 SMART-Seq mRNA Single Cell LP 4×96 Rxns ￥228,082 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq mRNA Single Cell LP & SMART-Seq mRNA Single Cell 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq mRNA Single Cell LP & SMART-Seq mRNA Single Cell 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq mRNA Single Cell LP & SMART-Seq mRNA Single Cell
Clontech 634789 SMART-Seq mRNA Single Cell 24 Rxns ￥15,791 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq mRNA Single Cell LP & SMART-Seq mRNA Single Cell 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq mRNA Single Cell LP & SMART-Seq mRNA Single Cell 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq mRNA Single Cell LP & SMART-Seq mRNA Single Cell
Clontech 634790 SMART-Seq mRNA Single Cell 96 Rxns ￥53,691 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq mRNA Single Cell LP & SMART-Seq mRNA Single Cell 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq mRNA Single Cell LP & SMART-Seq mRNA Single Cell 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq mRNA Single Cell LP & SMART-Seq mRNA Single Cell
Clontech 634785 SMART-Seq mRNA Single Cell 4×96 Rxns ￥193,290 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq mRNA Single Cell LP & SMART-Seq mRNA Single Cell 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq mRNA Single Cell LP & SMART-Seq mRNA Single Cell 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq mRNA Single Cell LP & SMART-Seq mRNA Single Cell
收藏产品 加入购物车

无标题文档

SMART-Seq mRNA Single Cell LP & SMART-Seq mRNA Single Cell
◆ 操作简便，基于Plate的工作流程 – 可直接以FACS或其他方法分选的单细胞起始
◆ 单管操作流程 – SMART-Seq mRNA Single Cell LP包含完整的cDNA合成和文库构建流程，分别在单管中进行，减少样品损失与混淆，降低手动操作误差
◆ 灵敏度高且一致性好 – 非常适用于单细胞（尤其是RNA含量非常低的细胞和细胞核）RNA-Seq的研究，可检测更多基因
◆ 可靠的全长cDNA分析 – 性能优于许多现有的单细胞全长cDNA合成方法，例如Smart-seq2
◆ 测序性能 – SMART-Seq mRNA Single Cell LP搭配Unique Dual Index kits（单独购买)，即便多个文库pool后用高通量型Illumina测序仪（如Novaseq）分析，也能得到正确结果
◆ 更高的文库产量 – 更便于使用高通量型Illumina测序仪分析（如Novaseq），或保存剩余的文库用于多次测序
◆ 高度灵活的工作流程 – 可与自动化设备兼容
    ◇ SPT Labtech mosquito HV user guide
    ◇ Formulatrix MANTIS Microfluidic Liquid Handler user guides
        · Full-volume
        · Quarter-volume

 
■ 产品说明：
SMART-Seq mRNA Single Cell Kit (SSmRNA Single Cell) 和SMART-Seq mRNA Single Cell LP Kit (SSmRNA Single Cell LP) 是两款具有高灵敏度和高可再现性、适用于单细胞和单个细胞核的RNA-Seq分析试剂盒。试剂盒采用oligo（dT）引物，可从一些RNA含量非常低的单细胞（如PBMC、T细胞、B细胞）直接起始，合成高品质的全长cDNA。使用SSmRNA Single Cell LP kit搭配 Unique Dual Index kits （单独购买)，最多可以制备384 Illumina测序文库。SSmRNA Single Cell LP kit提供完整的单细胞RNA-Seq分析流程，包含从样本制备cDNA、文库构建以及搭配使用的生物信息学分析软件进行数据分析的流程。
SSmRNA Single Cell是基于SMART技术(Switching Mechanism at 5′ End of RNA Template)，提供全长转录本信息，支持分析转录本异构体、融合基因、点突变等，具有更高的再现性和均一的gene body覆盖度，而且高GC含量转录本也能得到正确的分析。同时，Takara科学家对这一技术进行优化改良，使得这个试剂盒更适合单细胞分析，能得到更多有效reads、更高的基因检测数，对珍贵样本的分析更加深入！
SSmRNA Single Cell LP在包含核心的cDNA合成试剂基础上，同时整合了Takara Bio Group专利性的文库构建技术（U.S. Patents 7,803,550, 8,399,199, 8,728,737, 9,598,727, 10,196,686, 10,208,337, and 11,072,823）及单次使用的双端特殊index（UDI），提供完整的单细胞cDNA合成到文库构建的实验体验。建库试剂中包含片段化酶，以实现对合成cDNA的片段化，利用特别的茎环形接头构建高品质Illumina文库。在建库阶段，单管两步操作、过程中无需纯化、2 h即可建成文库！
如果是以高品质的少量细胞(＜1,000)或者微量Total RNA起始时，推荐使用SMART-Seq mRNA LP Kit或SMART-Seq mRNA LP (with UMIs) Kit。
如果是以随机引物起始，对少量细胞或者降解的Total RNA样本进行RNA-Seq分析时，推荐使用SMART-Seq Stranded Kit。
 
■ 实验流程概要：
单细胞mRNA全长分析SMART-Seq mRNA Single Cell LP & SMART-Seq mRNA Single Cell
图1. SMART-Seq mRNA Single Cell & SMART-Seq mRNA Single Cell LP的cDNA合成流程
 
单细胞mRNA全长分析SMART-Seq mRNA Single Cell LP & SMART-Seq mRNA Single Cell
图2. SMART-Seq mRNA Single Cell LP的文库制备工作流程
 
■ 数据展示：
注：以下展示来源于SMART-Seq Single Cell Kit (SSsc) 和 SMART-Seq Single Cell PLUS (SSsc PLUS)的数据。因为两者分别是SMART-Seq mRNA Single Cell 和SMART-Seq mRNA Single Cell LP等效替换品。
 
● 灵敏度更高的单细胞全长转录组分析
单细胞mRNA全长分析SMART-Seq mRNA Single Cell LP & SMART-Seq mRNA Single Cell
图3. 与Smart-seq2法的比较
 
Takara科学家以淋巴母细胞系GM12878单细胞为样本制备文库，分别采用SMART-Seq Single Cell Kit(SSsc，18个重复)和Smart-seq2法（Smart-seq2，20个重复）合成cDNA（均进行19个PCR循环扩增），所有样本都均一化至1.75M paired-end reads，然后制备RNA-Seq文库并进行测序分析。
Panel A 根据cDNA的制备方法不同，结果也不同。相比而言，Smart-seq2结果中比对到线粒体基因组的比率较高，而检测到基因鉴别的reads数相对较少。
Panel B SMART-Seq Single Cell Kit能检测到比Smart-seq2更多的基因。
 
● SMART-Seq mRNA Single Cell LP提供完整的单细胞RNA-Seq建库体验！
单细胞mRNA全长分析SMART-Seq mRNA Single Cell LP & SMART-Seq mRNA Single Cell
图4. 与其他同类产品比较数据
 
Panel A. 以10 pg小鼠脑total RNA起始，采用SMART-Seq Single Cell Kit完成cDNA合成。随后分别采用SSsc Plus Kit中的SMART-Seq Library Prep Kit模块与市面上较常用的A公司试剂盒构建文库，并比较性能差异。
Panel B. 从测试数据中可以看出，SSsc PLUS Kit所建文库的产量是A公司Kit产量的5倍，而更高的文库产量更适于高通量型Illumina测序仪，如Novaseq。
Panel C. 两种方法所建文库随后用Nextseq 500完成测序，并对TPM(Transcripts per million)≥0.1的基因数进行统计。相较于A公司文库，SSsc PLUS文库能检出更多的基因，从同样的cDNA起始能“捕获”更全的信息！
 
 
产品详情请点击：单细胞mRNA全长分析SMART-Seq mRNA Single Cell LP & SMART-Seq mRNA Single Cell
 
 

页面更新：2024-02-01 08:20:25

EnGen® Seq1 Cas9 核酸酶 #M0668T 500 pmol-NEB酶试剂 New England Biolabs

发表于由

上海金畔生物科技有限公司代理New England Biolabs（NEB）酶试剂全线产品，欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

产品资料 – 基因编辑 – 应用于CRISPR工作流程中的NEB特色产品

EnGen® Seq1 Cas9 核酸酶                              收藏

货 号
规 格
价 格(元)
北京库存
上海库存
广州库存
成都库存
苏州库存
武汉库存

#M0668T
500 pmol
1,899.00
有
无
无
无
无
无

Download:       

  • isoschizomers     |
  • compatible ends     | 
  • single letter code

产品特点：

• PAM 序列（5´- NAGA- 3´）允许靶向额外的基因组区域
• 是直接导入 Cas9/sgRNA 复合物进行基因编辑的理想选择
• 与 EnGen 突变检测试剂盒（NEB #E3321S）兼容
• 体外应用时，在 20°C至 45°C范围内具有活性
 

概述：

 该酶克隆自马链球菌（Streptococcus equinus），是一种由 RNA 引导的核酸内切酶，可在靶向位点特异切割双链 DNA。靶向切割需要由 Cas9 和 116 nt sgRNA 组成的核糖核蛋白复合物。sgRNA 编码一个 20 核苷酸序列，与非靶链上 5´–NAGA–3´ 原间隔区相邻序列（PAM）上游的 DNA 靶向互补。EnGen Seq1 Cas9 在 PAM 上游的第 3 个碱基外进行 DNA 双链切割。EnGen Seq1 Cas9 在其蛋白质的 N 端和 C 端带有 SV40（Simian virus 40）T 抗原核定位序列（NLS）。

 
sgRNA 引导 S. equinus Cas9 核酸酶切割靶标 DNA 示意图
 
EnGen® Seq1 Cas9 核酸酶 #M0668T 500 pmol
 
上图中，S. equinus Cas9（Seq1 Cas9）蛋白以米色显示，sgRNA 以蓝色显示，DNA 以灰色、绿色和红色显示。DNA 靶标以及前间隔序列以绿色显示，图中 R-loop 区域展示了靶标序列与向导 RNA 互补配对。Cas9 与 DNA 结合所需的 PAM 序列（protospacer adjacent motif）以红色显示，黑色三角标注 DNA 的切割位置。
 

NEBNext ChIP-Seq 文库制备试剂盒（停产） #E6200L 60 次反应-NEB酶试剂 New England Biolabs

发表于由

上海金畔生物科技有限公司代理New England Biolabs（NEB）酶试剂全线产品，欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于 Illumina 测序平台/Ultra II DNA & RNA

NEBNext ChIP-Seq 文库制备试剂盒（停产）                              收藏

货 号
规 格
价 格(元)
北京库存
上海库存
广州库存
成都库存
苏州库存
武汉库存

#E6200L
60 次反应
19,689.00
无
无
无
无
无
无

#E6200S
12 次反应
4,929.00
无
无
无
无
无
无

Download:       

  • isoschizomers     |
  • compatible ends     | 
  • single letter code

概述

该产品已停产，推荐替代产品为  NEBNext ChIP-Seq  文库制备预混液试剂盒（NEB#6240） 或  NEBNext Ultra II DNA 文库制备试剂盒（NEB#7645）。

 

请联系我们。 NEBNextSelector.neb.com 可以使用在线产品选择工具进行产品选择。

高性能单细胞差异表达分析SMART-Seq v4 3’DE Kit酶试剂盒Takara Clontech

发表于由

上海金畔生物科技有限公司代理Takara酶试剂盒全线产品，欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

高性能单细胞差异表达分析SMART-Seq v4 3’DE Kit
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 635040 SMART-Seq v4 3’ DE Kit 96 Rxns ￥50,508 高性能单细胞差异表达分析SMART-Seq v4 3’DE Kit 高性能单细胞差异表达分析SMART-Seq v4 3’DE Kit 高性能单细胞差异表达分析SMART-Seq v4 3’DE Kit
Clontech 635041 SMART-Seq v4 3’ DE Kit 192 Rxns ￥93,693 高性能单细胞差异表达分析SMART-Seq v4 3’DE Kit 高性能单细胞差异表达分析SMART-Seq v4 3’DE Kit 高性能单细胞差异表达分析SMART-Seq v4 3’DE Kit
收藏产品 加入购物车

无标题文档

SMART-Seq v4 3’DE Kit—简便的高性能单细胞差异表达分析
· 升级的SMART技术—带有LNA修饰的SMART-Seq v4 oligo 加升级的配方带来更好的性能
   (灵敏度高，更好重复性，更多的GC-rich基因)
· 末端捕获流程—大部分reads集中于3’端，同时维持出色的灵敏度，缩减了差异表达分析需要
   的reads数
· 高达12个样品pool—内嵌的indexes作为细胞barcode，可以实现在每个测序lane中高达12个样品
   的pool，进一步缩短时间，降低成本
 
单细胞转录组研究对于研究细胞群内不同单细胞表达情况非常重要。Takara Clontech 研发了单细胞mRNA转录本末端捕获技术，该技术侧重于3’端的末端捕获，使您可以用更少的测序reads获得高品质测序数据。本试剂同样采用了领先的SMART-Seq v4 技术，结合了SMART (Switching Mechanism at 5’ End of RNA Template) 技术和LNA (Locked Nucleic Acid) 技术。
本试剂除了侧重于mRNA转录本3’端外，还包含了内嵌的indexes作为Read2的细胞barcode，可以实现在每个测序lane中高达12个样品的pool，进一步缩减了时间和研究成本。本试剂可以1–10.5 μl体系起始，依赖于Illumina Nextera® XT DNA Library Preparation Kit。本试剂设计并经验证可以用于以下测序平台的cDNA文库和测序文库制备：HiSeq®,NextSeq®,MiSeq®和MiniSeq®。
 
高性能单细胞差异表达分析SMART-Seq v4 3’DE Kit
图1. 末端捕获方法简介
 
高性能单细胞差异表达分析SMART-Seq v4 3’DE Kit
表1. K562单细胞pool文库主要测序数据
 
高性能单细胞差异表达分析SMART-Seq v4 3’DE Kit
图2. 从K562单细胞中检测到的基因数
 
Technote：
点击图片查看		 高性能单细胞差异表达分析SMART-Seq v4 3’DE Kit
 
产品详情请点击：高性能单细胞差异表达分析SMART-Seq v4 3’DE Kit
 
 

页面更新：2024-02-01 08:21:31

甲基化DNA-Seq酶试剂盒Takara Clontech

发表于由

上海金畔生物科技有限公司代理Takara酶试剂盒全线产品，欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

甲基化DNA-Seq
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 635023 EpiXplore Meth-Seq DNA Enrichment Kit 12 Rxns ￥15,242 甲基化DNA-Seq 甲基化DNA-Seq 甲基化DNA-Seq
收藏产品 加入购物车

无标题文档

EpiXplore Meth-Seq DNA Enrichment Kit—甲基化DNA下一代测序
· 快速，用户友好的分离甲基化和非甲基化DNA片段操作流程
· 无需接头连接即可构建测序文库
· 25 ng-1 μg的剪切基因组DNA起始
· 约4 h即可以富集的DNA构建Illumina-ready测序文库
 
EpiXplore Meth-Seq DNA Enrichment Kit 是可以从剪切的基因组DNA中分离甲基化和非甲基化片段，并以富集的DNA片段构建Illumina测序文库的完整系统。富集过程采用目前EpiXplore Methylated DNA Enrichment Kit采用的his-tagged MBD2蛋白质和Capturem Nanoprep Columns进行，约2 h即可分离甲基化、非甲基化片段。接下来，采DNA SMART技术，可以甲基化（或非甲基化，若需要）DNA片段构建Illumina测序文库。
文库构建过程中，DNA SMART技术可以不通过接头连接的方法在DNA片段末端添加Illumina测序接头。这种高灵敏度的技术可以微量DNA样品构建高效测序文库，并且操作时间短，只需4 h。
 
甲基化DNA-Seq
图1. DNA SMART技术流程
 
甲基化DNA-Seq
图2. 甲基化、非甲基化DNA片段分离流程
 
Technote：
点击图片查看		 甲基化DNA-Seq
 
产品详情请点击：甲基化DNA-Seq
 
 

页面更新：2019-11-06 10:36:41

自动化高通量的单细胞全长转录组分析(SMART-Seq Pro)酶试剂盒Takara Clontech

发表于由

上海金畔生物科技有限公司代理Takara酶试剂盒全线产品，欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

自动化高通量的单细胞全长转录组分析(SMART-Seq Pro)
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 640257 SMART-Seq Pro Application Kit 2 Chips 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析(SMART-Seq Pro) 自动化高通量的单细胞全长转录组分析(SMART-Seq Pro) 自动化高通量的单细胞全长转录组分析(SMART-Seq Pro)
Clontech 640192 ICELL8® 384-Well Source Plate and Seal Each 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析(SMART-Seq Pro) 自动化高通量的单细胞全长转录组分析(SMART-Seq Pro)
Clontech 640018 MSND 384-Well Source Plate and Seal 20/Pack 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析(SMART-Seq Pro) 自动化高通量的单细胞全长转录组分析(SMART-Seq Pro)
收藏产品 加入购物车

无标题文档

 
自动化高通量的单细胞全长转录组分析(SMART-Seq Pro) 延伸 自动化高通量的单细胞全长转录组分析(SMART-Seq Pro) → 自动化高通量的单细胞全长转录组分析(SMART-Seq Pro) → 自动化高通量的单细胞全长转录组分析(SMART-Seq Pro)
←  
  自动化高通量的单细胞全长转录组分析(SMART-Seq Pro)
 
SMART-Seq技术助力ICELL8 cx系统单细胞全长转录组分析方案
 
全长序列覆盖可以实现对整个转录的差异表达分析，并且可以对基因融合、剪接体这类生物标志物进行检测。高灵敏度的SMART-Seq Pro可以胜任以上分析需求。
SMART-Seq Pro Application Kit将SMART-Seq试剂与ICELL8 cx Single-Cell System（Cat No. 640188）相结合，并整合了生物信息学工具，提供一套端到端的单细胞全长转录组分析流程，一次实验可以对1,200~1,500个分离的单细胞进行高效的全长转录组分析。
通过ICELL8 cx系统将细胞分注到ICELL8 350v Chip（Cat No. 640019）空白微孔芯片中。使用ICELL8 cx CellSelect Software鉴定出含单个细胞的微孔，文库构建试剂只被分注到这些选中的微孔中。经过一系列分注和扩增步骤后，获得无偏倚的全长cDNA，并通过Illumina Bead-Linked Transposome（BLT）完成酶切片段化。在这一扩展性的工作流程中，cDNA扩增阶段引入了Illumina特异性接头序列，生成的文库已连接index接头，可直接用于Illumina测序平台。测序过程结束后，获得的测序数据可直接导入Cogent NGS软件工具进行生物信息学分析，解释测序结果。
 
NOTE：旧版本SMART-Seq Application Kit（Cat No. 640222）依然可以购买。
 
更多孔板测序应用，请参见 单细胞RNA-Seq / DNA-Seq
 
■ 概述
· 端到端的解决方案：从文库制备到测序数据分析工具
· 覆盖全长mRNA：捕获转录组中“深藏”的关键生物标志物，如基因融合、剪接异构体
· 高通量单细胞分析：可以平行地从＞1,000个单细胞中生成测序数据
· 样品配置灵活：一次实验最多可对八种细胞样品进行分析
· 减少样品操作：减小数据波动，构建测序文库前自动鉴定并分选出感兴趣的细胞，仅对这些细胞进行试剂分注
· Illumina平台测序文库：制备的测序文库适用于Illumina全系平台
 
■应用
用于Illumina平台上高通量全长单细胞转录组测序文库制备
自动化高通量的单细胞全长转录组分析(SMART-Seq Pro)
图1. SMART-Seq Pro和Smart-seq2在PBMCs中基因检测结果比较
 
 
自动化高通量的单细胞全长转录组分析(SMART-Seq Pro)Technote：
点击图片查看
自动化高通量的单细胞全长转录组分析(SMART-Seq Pro)点击下载SMART-Seq Pro海报
 
 

页面更新：2023-02-09 11:55:02

单细胞mRNA全长分析SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit酶试剂盒Takara Clontech

发表于由

上海金畔生物科技有限公司代理Takara酶试剂盒全线产品，欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

单细胞mRNA全长分析SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech R400750 SMART-Seq® Single Cell PLUS Kit 48 Rxns ￥49,741 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
Clontech R400744 Unique Dual Index Kit – 48U 48 Rxns ￥5,542 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
Clontech 634470 SMART-Seq Single Cell Kit 12 Rxns ￥13,875 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
Clontech 634471 SMART-Seq Single Cell Kit 48 Rxns ￥39,269 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
Clontech 634472 SMART-Seq Single Cell Kit 96 Rxns ￥68,325 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
收藏产品 加入购物车

无标题文档

 
 
单细胞mRNA全长分析SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit 延伸     单细胞mRNA全长分析SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit ↘ 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
← 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit → 单细胞mRNA全长分析SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
         
单细胞mRNA全长分析SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit ↗
 
 
SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell Plus Kit：更胜一筹的单细胞mRNA全长分析
· 简便，基于Plate的工作流程 - 可直接以FACS或其他方法分选的单细胞起始
· 单管操作流程 - SMART-Seq Single Cell PLUS Kit包含完整的cDNA合成和文库构建流程，分别在单管中进行，减少样品损失与混淆，降低手动操作误差
· 灵敏度高和一致性好 - 非常适用于单细胞（尤其是RNA含量非常低的细胞和细胞核）RNA-Seq的研究，可检测更多基因
· 可靠的全长cDNA分析 - 性能优于许多现有的单细胞全长cDNA合成方法，例如Smart-seq2
· 增强的测序性能 - SMART-Seq Single Cell PLUS Kit整合双端特殊index（UDI），即便多个文库pool后用高通量型Illumina测序仪（如Novaseq）分析，也能得到正确结果
· 高度灵活的工作流程 - 可与自动化设备兼容
· 更高的文库产量 - 更便于使用高通量型Illumina测序仪分析（如Novaseq），或保存剩余的文库用于多次测序
 
■ 产品说明
SMART-Seq Single Cell Kit (SSsc) 和SMART-Seq Single Cell PLUS Kit (SSsc PLUS) 是Takara科学家专门研发推出的两款具有高灵敏度和高可再现性的试剂盒，适用于单细胞和单个细胞核的RNA-Seq分析。试剂盒采用oligo（dT）引物，可从一些RNA含量非常低的单细胞（如PBMC, T细胞，B细胞）直接起始，并完成全长cDNA的捕获。
 
SMART-Seq Single Cell Kit是基于经典的SMART技术优化改良而来的单细胞cDNA合成试剂盒，可以提供全长转录本的信息，支持分析转录本异构体、融合基因、点突变等广受科研人员关注的研究内容，具有更高的灵敏度和再现性。此外，该试剂盒还能提供均一的gene body覆盖度，高GC含量转录本也能得到正确分析。这些改进使得SSsc更适合单细胞分析，能得到更多有效reads、更高的基因检测数，对珍贵样本的理解更透彻！这些特点使SSsc远远超过许多现有的单细胞全长cDNA合成方法，例如SMART-Seq2！
 
SMART-Seq Single Cell PLUS Kit在包含核心的cDNA合成试剂基础上，同时整合了Takara Bio Group专利性的文库构建技术（U.S. Patents 7,803,550, 8,399,199, 8,728,737, 9,598,727, 10,196,686, 10,208,337, and 11,072,823）及单次使用的双端特殊index（UDI），提供完整的单细胞cDNA合成到文库构建的实验体验。建库试剂中包含片段化酶，以实现对合成cDNA的片段化，接着利用特别的茎环形接头构建高品质Illumina文库。在建库阶段，单管两步操作、过程中无需纯化、2 h即可建成文库！
 
 
■ SSsc：更胜一筹的单细胞全长转录组分析！
 
单细胞mRNA全长分析SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
The SMART-Seq Single Cell Kit outperforms Smart-seq2
图1. 与Smart-seq2法的比较
 
Takara科学家以淋巴母细胞系GM12878单细胞为样本制备文库，分别采用SMART-Seq Single Cell Kit(SSsc,18个重复)和Smart-seq2法（Smart-seq2，20个重复）合成cDNA（均进行19个PCR循环扩增），所有样本都均一化至1.75M paired-end reads，然后制备RNA-Seq文库并进行测序分析。
 
Panel A 根据cDNA的制备方法不同，结果也不同。相比而言，Smart-seq2结果中比对到线粒体基因组的比率较高，而检测到基因鉴别的reads数相对较少。
Panel B SMART-Seq Single Cell Kit能检测到比Smart-seq2更多的基因。
 
■ SSsc PLUS Kit：不只是一个Kit，更是完整且更胜一筹的单细胞RNA-Seq建库体验！
 
为了使单细胞cDNA合成、文库构建实验“一步”到位，我们全新推出了SSsc PLUS Kit，从此您无需再单独购买建库模块，也不用“忍受”不同厂家不同步的供货周期。
 
单细胞mRNA全长分析SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
 
单细胞mRNA全长分析SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
 
从高灵敏度、高重复性的cDNA合成出发，构建更高品质Illumina文库
 
Takara科学家以10 pg小鼠脑total RNA起始，采用SMART-Seq Single Cell Kit完成cDNA合成。随后分别采用SSsc Plus Kit中的SMART-Seq Library Prep Kit模块与市面上较常用的A公司试剂盒构建文库，并比较性能差异。
 
单细胞mRNA全长分析SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
 
从测试数据中可以看出，SSsc PLUS Kit所建文库的产量是A公司Kit产量的5倍，而更高的文库产量更适于高通量型Illumina测序仪，如Novaseq。
 
单细胞mRNA全长分析SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
 
两种方法所建文库随后用Nextseq 500完成测序，并对TPM(Transcripts per million)≥0.1的基因数进行统计。相较于A公司文库，SSsc PLUS文库能检出更多的基因，从同样的cDNA起始能“捕获”更全的信息！
 
单细胞mRNA全长分析SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
 
比较数据来源于Takara Bio USA, Inc.
 
单细胞mRNA全长分析SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS KitSSsc点击图片下载
 
 
产品详情请点击：单细胞mRNA全长分析SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
 
更多实验数据：
SSsc Kit
SSsc PLUS Kit
 
延伸阅读：
单细胞NGS解决方案
 
 
 

页面更新：2024-02-01 08:20:39

单细胞链特异RNA-Seq分析SMART-Seq Stranded Kit酶试剂盒Takara Clontech

发表于由

上海金畔生物科技有限公司代理Takara酶试剂盒全线产品，欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

单细胞链特异RNA-Seq分析SMART-Seq Stranded Kit
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 634442 SMART-Seq® Stranded Kit 12 Rxns ￥13,136 单细胞链特异RNA-Seq分析SMART-Seq Stranded Kit 单细胞链特异RNA-Seq分析SMART-Seq Stranded Kit 单细胞链特异RNA-Seq分析SMART-Seq Stranded Kit
Clontech 634443 SMART-Seq® Stranded Kit 48 Rxns ￥43,617 单细胞链特异RNA-Seq分析SMART-Seq Stranded Kit 单细胞链特异RNA-Seq分析SMART-Seq Stranded Kit 单细胞链特异RNA-Seq分析SMART-Seq Stranded Kit
Clontech 634444 SMART-Seq® Stranded Kit 96 Rxns ￥57,771 单细胞链特异RNA-Seq分析SMART-Seq Stranded Kit 单细胞链特异RNA-Seq分析SMART-Seq Stranded Kit 单细胞链特异RNA-Seq分析SMART-Seq Stranded Kit
收藏产品 加入购物车
SMART-Seq® Stranded Kit
SMART-Seq® Stranded Kit：以单细胞起始，构建高质量的链特异性RNA-seq文库
· 操作简便：以1–1,000个细胞 或10 pg-10 ng的总RNA起始，仅需7h即可完成文库制备；
· 高灵敏度：可以单细胞起始，保留链特异性，最终获得全长总RNA序列信息；
· 高再现性：准确检测包含编码和非编码RNA在内的全部转录组；
· 用途广泛：适用于降解的样本；
· 适用对象：人、小鼠、大鼠。
 
SMART-Seq® Stranded Kit能够直接从1-1,000个完整细胞（或10 pg-10 ng总RNA）起始，制备链特异性Illumina测序文库。本试剂采用随机引物法可以制备完整的转录组文库，并适用于部分降解及低品质的RNA。此外，本试剂采用专有的ZapR技术，在文库制备过程中去除核糖体cDNA。
 
如果是以oligo-dT引物起始对微量高品质的RNA进行cDNA合成时，推荐使用 SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing 或SMART-Seq HT Kit试剂盒。
 
单细胞链特异RNA-Seq分析SMART-Seq Stranded Kit
图1. SMART-Seq Stranded Kit的技术流程
 
单细胞链特异RNA-Seq分析SMART-Seq Stranded Kit
图2. 使用SMART-Seq Stranded Kit制备文库的结构特征
 
接头序列包含：通过PCR 1反应添加的可以与Illumina流动池结合生成簇的P7、P5序列（P7以淡蓝色表示，P5以红色表示），用于区分单个lane上多个样本的Index序列（Index 1 [i 7] 序列连接在P7端，Index 2 [i 5]连接在P5端）。并且还包括识别测序引物区域的Read 2（紫色）和 Read 1（绿色）。通过Read 1起始得到的原始RNA的反义链序列，Read 2起始获得的是原始RNA的正义链序列。其中，通过Read 2起始时，前3个碱基（XXX）是SMART-Seq Stranded Adapter衍生的序列。因此在双端测序时，需要在mapping前去掉这3个碱基。
 
单细胞链特异RNA-Seq分析SMART-Seq Stranded Kit
表1.不同样本起始量的分析结果
 
以人脑总RNA 10 pg至10 ng不同量起始，使用SMART-Seq Stranded Kit制备RNA-Seq文库。该表中所显示的数据是三次重复的平均值，且重复之间相关性系数非常高（Pearson/Spearman表示）。即使起始量为10 pg时，也具有非常高的重现性。
 
单细胞链特异RNA-Seq分析SMART-Seq Stranded Kit
图3. 在低起始量时，SMART-Seq Stranded Kit和Pico v2的比较
 
Panel A.以人脑总RNA (50 pg-10 ng)起始，分别使用SMART- Seq Stranded Kit和SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 -Pico Input Mammalian (Pico v2)制备RNA-Seq文库（均做三次重复）。从测序数据随机抽取250万paired-end reads进行生物学信息分析。
 
Panel B.比较这两个试剂盒在总RNA以 50 pg起始制备文库的转录表达水平 (见Panel A)， SMART-Seq Stranded Kit (Pearson =0.97)的再现性高于Pico v2 (pearson =0.92)。
 
单细胞链特异RNA-Seq分析SMART-Seq Stranded Kit
 
单细胞链特异RNA-Seq分析SMART-Seq Stranded Kit
图4. 不同起始量样本的高重现性
 
利用FACS分离出A375细胞，分别以1-1,000个细胞起始使用SMART-Seq Stranded Kit制备测序文库。其中，以5-1,000个细胞起始时，均做两个重复；以单个细胞起始时，做12个重复。为了作比较，同时使用从两种1,000个细胞中纯化的总RNA制备文库。
 
Panel A.：1-1,000个细胞起始的分析结果；
 
Panel B.：通过聚类热图展示了Panel A.中所示的所有样本的Euclidea距离，以及Pearson相关系数（范围为0.85至0.99）。其中单细胞样本标记为Cell1-Cell12，其他样本分别标记为a-b。
 
Technote：单细胞链特异RNA-Seq分析SMART-Seq Stranded Kit
 
产品详情请点击：单细胞链特异RNA-Seq分析SMART-Seq Stranded Kit
 
 

页面更新：2024-02-01 08:21:07

原始的单细胞RNA-Seq (dT Primed)酶试剂盒Takara Clontech

发表于由

上海金畔生物科技有限公司代理Takara酶试剂盒全线产品，欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

原始的单细胞RNA-Seq (dT Primed)
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 634936 SMARTer® Ultra® Low RNA Kit for Illumina® Sequencing(库存销售完毕即终卖) 100 Rxns ￥108,452 原始的单细胞RNA-Seq (dT Primed) 原始的单细胞RNA-Seq (dT Primed) 原始的单细胞RNA-Seq (dT Primed)
收藏产品 加入购物车

无标题文档

原始的单细胞RNA-Seq (dT Primed)
我们提供多代单细胞转录组分析试剂盒。这些试剂盒的核心技术-SMART技术(Switching Mechanism at 5’ End of RNA Template)提供了全长转录信息，使分析剪切异构体、基因融合、点突变等成为可能。
 
产品详情请点击：原始的单细胞RNA-Seq (dT Primed)
 
 

页面更新：2020-09-16 09:09:53