sgRNA体外转录和筛选酶试剂盒Takara Clontech

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sgRNA体外转录和筛选
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech 632635 Guide-it sgRNA In Vitro Transcription Kit 50 Rxns ¥9,377
¥7502
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Clontech 632636 Guide-it Complete sgRNA Screening System 50 Rxns ¥12,203
¥9152
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Clontech 632639 Guide-it sgRNA Screening Kit 50 Rxns ¥5,143
¥4114
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Clontech 632638 Guide-it IVT RNA Clean-Up Kit 50 Rxns ¥4,747 sgRNA体外转录和筛选 sgRNA体外转录和筛选 sgRNA体外转录和筛选

*红字为促销价格,促销时间: 2024年3月1日-2024年4月30日

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sgRNA的体外转录和筛选试剂盒
In Vitro Transcription and Screening Kits for sgRNA
我们的Guide-it in vitro transcription and screening kits for sgRNA 包括四个试剂盒,用于CRISPR/Cas9 研究中单链向导RNAs(single guide RNAs ,sgRNAs)的简单制备、清理和评价。每个试剂盒提供足够 50次反应的材料。
· Guide-it sgRNA In Vitro Transcription Kit (Code No. 632635) 被用于通过体外转录制备大量的 sgRNAs。这个试剂盒同样包括Guide-it IVT RNA Clean-Up Kit (Code No. 632638), 被用于快速纯化参与体外转录(vitro transcription,IVT) 反应的sgRNA。从这个试剂盒纯化后的 sgRNA 可以直接被用于转染、电穿孔以及体外剪切实验。
· Guide-it sgRNA Screening Kit (Code No. 632639) 可以在Cas9介导的基因编辑相关研究前,先在体外检测不同sgRNAs的效率,这样就不必浪费时间将无效的sgRNAs转入您的细胞了。使用这个试剂盒,首先通过PCR产生包含sgRNA靶点的模板,随后再与您想测试的sgRNA以及重组Cas9核酸酶结合。Cas9 核酸酶剪切模板的效率可以通过使用琼脂糖凝胶电泳检测。
· Guide-it Complete sgRNA Screening System (Code No. 632636) 包含以上提到的全部试剂盒组分,可以被用来合成和检测sgRNAs效率。该试剂盒包含了用于体外转录和纯化sgRNAs,以及检测重组Cas9核酸酶对PCR靶向片段剪切效率的所有试剂。
 
■ 产品特点
· 共有4个试剂盒,可用于Cas9介导的基因编辑研究中sgRNA (single guide RNA)的简单制备、清洁以及效率评价。
· Lenti-X Packaging Single Shots易于产生高滴度病毒。
· 使用Guide-it sgRNA In Vitro Transcription Kit (Code No. 632635; 包括Guide-it IVT RNA Clean-Up Kit, Code No. 632638)体外转录和纯化大量sgRNA,用于转染或体外筛选。
· 使用Guide-it IVT RNA Clean-Up Kit (Code No. 632638) 对IVT 反应后sgRNA的快速纯化,直接用于转染、电穿孔以及体外剪切试验。
· Guide-it sgRNA Screening Kit (Code No. 632639)包含高质量的重组Cas9蛋白质。
· Guide-it Complete sgRNA Screening System (Code No. 632636)是Guide-it sgRNA In Vitro Transcription Kit (Code No. 632635) 和 Guide-it sgRNA Screening Kit (Code No. 632639)的组合,允许您进行sgRNA制备和对预设靶点体外剪切能力的测试。
 
■ 实验例
sgRNA体外转录和筛选
图1. Guide-it sgRNA In Vitro Transcription and Screening System试剂盒组成和操作流程
 
sgRNA体外转录和筛选
图2. 采用Guide-it试剂盒制备高产量single guide RNA (sgRNA)和重组Cas9蛋白质剪切靶位点检测sgRNA剪切效率操作步骤概要
 
sgRNA体外转录和筛选
图3. Guide-it试剂和同类产品所制备的sgRNA品质比较
采用Guide-it sgRNA In Vitro Transcription Kit制备的所有sgRNAs均为单一条带,而其他公司同类产品制备的sgRNAs均可观察到杂带,因此Guide-it试剂盒所制备的sgRNAs品质更高。
* 比较结果来自于Takara Bio USA, Inc.
 
sgRNA体外转录和筛选
图4. 以不同基因为靶标制备的sgRNA产量和品质比较
采用Guide-it Complete sgRNA Screening System以多个基因为靶基因制备sgRNA。
Panel A. 将20 μl sgRNA体外转录(IVT)反应液置于37°C孵育4 hr,采用NanoDrop分光光度计检测所制备产生的sgRNA产量。
Panel B. 采用安捷伦生物分析仪分析分析每一个sgRNA IVT反应液,检测sgRNA质量。
 
■ 产品组份
Guide-it sgRNA In Vitro Transcription Kit (Code No. 632635; 50 rxns)
· 1 each Guide-it sgRNA In Vitro Transcription Components v2 (Code No. 632637; 50 rxns; Not sold separately)
    ○ 50 μl Guide-it Scaffold Template (1 ng/μl)
    ○ 350 μl Guide-it In Vitro Transcription Buffer
    ○ 1 ml RNase Free Water
    ○ 500 μl RNase Free Water
    ○ 150 μl Guide-it T7 Polymerase Mix (33 U/μl)
    ○ 625 μl PrimeSTAR Max Premix (2X)
    ○ 100 μl Recombinant DNase I (RNase-Free) (5 U/μl)
· 1 each Guide-it IVT RNA Clean-Up Kit (Code No. 632638; 50 rxns)
    ○ 13 ml RNase Free Water
    ○ 3 ml IVT Binding Buffer
    ○ 50 IVT RNA Clean-Up Spin Columns
    ○ 2 x 6 ml IVT Wash Buffer
    ○ 50 Collection Tubes (2 ml)

Guide-it sgRNA Clean-Up Kit (Code No. 632638; 50 rxns)
· 13 ml RNase Free Water
· 3 ml IVT Binding Buffer
· 50 IVT RNA Clean-Up Spin Columns
· 2 x 6 ml IVT Wash Buffer
· 50 Collection Tubes (2 ml)

Guide-it sgRNA Screening Kit (Code No. 632639; 50 rxns)
· 25 μl Guide-it Recombinant Cas9 Nuclease (500 ng/μl)
· 50 μl 15X Cas9 Reaction Buffer
· 50 μl 15X BSA
· 5 μl Control sgRNA (50 ng/μl)
· 25 μl Control Fragment (20 ng/μl)
· 50 μl Terra PCR Direct Polymerase Mix (1.25 U/μl)
· 1.25 ml 2X Terra PCR Direct Buffer (with Mg2+, dNTP)
· 5 ml RNase Free Water
· 5 ml Extraction Buffer 1
· 0.5 ml Extraction Buffer 2

Guide-it Complete sgRNA Screening System (Code No. 632636; 50 rxns)
· Guide-it sgRNA In Vitro Transcription Kit (Code No. 632635)
· Guide-it sgRNA Screening Kit (Code No. 632639)

 
 
 
■ 关联资料
点击查看Guide-it sgRNA体外转录和筛选系统宣传页 sgRNA体外转录和筛选
 
 
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转录调控酶试剂盒Takara Clontech

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转录调控
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech 635057 A/C Heterodimerizer 500 μl ¥1,670 转录调控 转录调控 转录调控
Clontech 635056 A/C Heterodimerizer 5 × 500 μl ¥7,934 转录调控 转录调控 转录调控
Clontech 635081 iDimerize Regulated Transcription System Each ¥18,305 转录调控 转录调控 转录调控
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■ 制品说明
iDimerize技术可以通过化学诱导DNA结合结构域和转录激活结构域的二聚化来严格控制靶基因的转录激活。使用iDimerize方法用于转录调控的一个关键优势是它的低背景,因为在添加二聚体配体之前,转录激活结构域(activation domain, AD)是与DNA物理分离的。
转录因子是一种双功能蛋白质,它可以识别靶基因附近的特定DNA序列(通过DNA结合结构域),然后招募细胞的转录机制来激活转录过程(通过转录激活结构域)。虽然这两个结构域是作为单独的蛋白质表达并由A/C异源二聚体配体结合在一起的,但是它们仍然可以一起工作来激活转录过程。
 
A/C Heterodimerizer Ligand
A/C异源二聚体是一种人工合成的细胞渗透性配体,可用于诱导两种融合蛋白质的异源二聚化。例如,当与本试剂盒(Code No. 635081)一起使用时,A/C异源二聚体可诱导DmrC标记的转录AD与DmrA标记的DNA结合结构域发生二聚化反应。
 
调控转录过程
依次转染您感兴趣的细胞:
1. 表达转录激活结构域和DNA结合结构域的质粒(pHet-Act1-2)
2. 您感兴趣的基因克隆在PZI-1可诱导启动子的下游(pZFHD1-2)
DNA结合部分始终与启动子结合,但只有通过DmrA和DmrC结构域与转录激活部分相互作用,才能激活转录。当加入A/C异源二聚体时,两种组分相互作用,您感兴趣的基因就会从PZI-1启动子转录出来。
 
■ 制品特点
1. 应用iDimerize技术严格调控转录过程
2. 通过剂量依赖性小分子调控转录过程
3. 在加入二聚体配体之前,激活结构域与DNA物理分离,实现低背景
 
■ 制品应用
1. 以配体依赖的方式诱导基因表达
2. 分析促进细胞死亡、阻断细胞周期或其他有毒的基因
3. 功能基因组学研究
 
■ 保存
-20℃
 
■ 参考文献
Pomerantz, J. L., Sharp, P. A., & Pabo, C. O. Structure-based design of transcription factors. Science 267(5194), 93-96 (1995).
 
 
产品详情请点击:转录调控
 
 

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自动化高通量的单细胞全长转录组分析酶试剂盒Takara Clontech

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自动化高通量的单细胞全长转录组分析
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech 640222 SMART-Seq® ICELL8® cx Application Kit – 1 Chip 1 Rxn 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640019 ICELL8® 350v Chip 1 Chip 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640212 ICELL8® Collection Kit – L 1 Pkg 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640206 ICELL8® Loading Kit – B 1 Pkg 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640205 SMART-Seq® ICELL8® Indexing Primer Set – A 1 Chip 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640218 SMART-Seq® ICELL8® Indexing Primer Set – B 1 Chip 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640202 SMART-Seq® ICELL8® Reagent Kit 1 Chip 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640203 SMART-Seq® ICELL8® Reagent Kit 3 Chip 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640204 SMART-Seq® ICELL8® Reagent Kit 5 Chip 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640192 ICELL8® 384-Well Source Plate and Seal (5/pack) Each 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
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自动化高通量的单细胞全长转录组分析 延伸 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
 
  自动化高通量的单细胞全长转录组分析
 
 
高通量、高品质、更便捷的单细胞全长转录组分析解决方案
· 高通量单细胞分析:同时生成上千单细胞测序数据
· 样品灵活性高:一次试验可同时对8个不同样品进行单细胞分析
· 更少样品处理:自动完成文库构建前的细胞分离、挑选及样品收集,偏差更小
· 兼容Illumina测序平台:构建的文库支持Illumina平台测序
 
■ 应用领域
· 适用于Illumina平台的高通量、全长单细胞RNA-Seq文库的制备
 
■ 产品说明
转录本全长序列可以提供基因差异表达、基因融合以及可变剪切等高灵敏度分析。Takara的高通量单细胞全长转录组解决方案整合了SMART-Seq试剂,灵敏度更高。经过ICELL8 cx Single-Cell System(Code No. 640188)进行单细胞分选后,可获得>1,000个单细胞全长转录组信息。该实验流程支持在ICELL8芯片上直接进行cDNA扩增,同时引入Illumina特异接头序列,获得含Index的文库可直接用于Illumina平台测序。
ICELL8 cx Single-Cell System(Code No. 640188)能够将细胞分注到含5,184个纳米孔的空白ICELL8 350v芯片(Code No. 640019)中,完成单细胞的分离。使用CellSelect软件鉴定出含有“活的单细胞”的微孔。接着,SMART RT-PCR试剂被分注到选中的“活的单细胞”微孔中,然后将芯片转移至ICELL8 Chip Cycler中进行反应。在单次反应中,通过一步法RT-PCR完成cDNA第一链的合成与扩增。得到的全长cDNA直接在芯片上使用TED1(Illumina Tagment DNA Enzyme)进行片段化处理,片段化的cDNA 再通过正向和反向的Index引物(Code No. 640205、640218)进行扩增。包含了全长信息的扩增产物从芯片中混合收集,经纯化、扩增后即可获得测序用文库。
 
■ 产品组分
完整的工作流程需要下列Takara Bio产品。请参考对应的User Manual得到一份完整的试剂耗材清单:
用于ICELL8 cx Single-Cell System
· SMART-Seq ICELL8 cx Application Kit-1 Chip (Code No. 640222)*
· ICELL8 384-Well Source Plate and seal (5/pack) (Code No. 640192)
User Manual:SMART-Seq® ICELL8® cx Application Kit User Manual
* SMART-Seq ICELL8 cx Application Kit-1 Chip 包含以下五种制品,640019、640212、640206、640202、640205。640222包装量对应1张芯片用量。如实验中需要使用多张芯片,各制品可单独加购
· ICELL8 350v Chip (Code No. 640019)
· ICELL8 Collection Kit-L (Code No. 640212)
· ICELL8 Loading Kit-B (Code No. 640206)
· SMART-Seq ICELL8 Reagent Kit(Code No. 640202)
· SMART-Seq ICELL8 Indexing Primer Set-A (Code No. 640205)
自动化高通量的单细胞全长转录组分析
 
图1 ICELL8 cx单细胞全长转录组测序文库制备工作流程
 
自动化高通量的单细胞全长转录组分析
图2. 代表性样品的转录本覆盖度评价将人类基因组编码的不同转录本进行长度均一化。选取两个分选的K562细胞,将两个细胞中,比对到的reads覆盖度情况沿均一化后的转录本方向(5’→3’)绘制成曲线图(均一化转录本上5’→3’的位置信息由X轴上的百分数表示)。Y轴上,沿均一化转录本方向,将覆盖度相对于观察到的最大覆盖度进行均一化,由0-1范围表示。
 
自动化高通量的单细胞全长转录组分析
图3. 基因表达检测的重复性评价 为评价使用ICELL8单细胞分选系统制备全长转录组文库的测序数据重复性,对鉴定到的所有转录本进行基因表达检测。所有单细胞文库基因表达检测结果的Pearson相关性如热图所示。
 
Technote:
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自动化高通量的单细胞全长转录组分析
 
 
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自动化高通量的单细胞全长转录组分析酶试剂盒Takara Clontech

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自动化高通量的单细胞全长转录组分析
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech 640219 SMART-Seq® ICELL8® Application Kit – 1 Chip 1 Rxn 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640183 ICELL8® 250v Chip 1 Chip 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640202 SMART-Seq® ICELL8® Reagent Kit 1 Chip 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640203 SMART-Seq® ICELL8® Reagent Kit 3 Chips 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640204 SMART-Seq® ICELL8® Reagent Kit 5 Chips 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640205 SMART-Seq® ICELL8® Indexing Primer Set – A 1 Chip 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640218 SMART-Seq® ICELL8® Indexing Primer Set – B 1 Chip 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640212 ICELL8® Collection Kit – L 1 Pkg 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640206 ICELL8® Loading Kit – B 1 Pkg 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640048 ICELL8® Collection Kit 1 Pkg 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640192 ICELL8® 384-Well Source Plate and Seal (5/pack) Each 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
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自动化高通量的单细胞全长转录组分析 延伸 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
 
  自动化高通量的单细胞全长转录组分析
 
SMART-Seq技术助力ICELL8 cx系统单细胞全长转录组分析方案
 
全长序列覆盖可以实现对整个转录的差异表达分析,并且可以对基因融合、剪接体这类生物标志物进行检测。高灵敏度的SMART-Seq Pro可以胜任以上分析需求。
SMART-Seq Pro Application Kit将SMART-Seq试剂与ICELL8 cx Single-Cell System(Cat No. 640188)相结合,并整合了生物信息学工具,提供一套端到端的单细胞全长转录组分析流程,一次实验可以对1,200~1,500个分离的单细胞进行高效的全长转录组分析。
通过ICELL8 cx系统将细胞分注到ICELL8 350v Chip(Cat No. 640019)空白微孔芯片中。使用ICELL8 cx CellSelect Software鉴定出含单个细胞的微孔,文库构建试剂只被分注到这些选中的微孔中。经过一系列分注和扩增步骤后,获得无偏倚的全长cDNA,并通过Illumina Bead-Linked Transposome(BLT)完成酶切片段化。在这一扩展性的工作流程中,cDNA扩增阶段引入了Illumina特异性接头序列,生成的文库已连接index接头,可直接用于Illumina测序平台。测序过程结束后,获得的测序数据可直接导入Cogent NGS软件工具进行生物信息学分析,解释测序结果。
 
NOTE:旧版本SMART-Seq Application Kit(Cat No. 640222)依然可以购买。
 
更多孔板测序应用,请参见 单细胞RNA-Seq / DNA-Seq
 
■ 概述
· 端到端的解决方案:从文库制备到测序数据分析工具
· 覆盖全长mRNA:捕获转录组中“深藏”的关键生物标志物,如基因融合、剪接异构体
· 高通量单细胞分析:可以平行地从>1,000个单细胞中生成测序数据
· 样品配置灵活:一次实验最多可对八种细胞样品进行分析
· 减少样品操作:减小数据波动,构建测序文库前自动鉴定并分选出感兴趣的细胞,仅对这些细胞进行试剂分注
· Illumina平台测序文库:制备的测序文库适用于Illumina全系平台
 
■应用
用于Illumina平台上高通量全长单细胞转录组测序文库制备
自动化高通量的单细胞全长转录组分析
图1. SMART-Seq Pro和Smart-seq2在PBMCs中基因检测结果比较
 
 
Technote:
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自动化高通量的单细胞全长转录组分析酶试剂盒Takara Clontech

上海金畔生物科技有限公司代理Takara酶试剂盒全线产品,欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

自动化高通量的单细胞全长转录组分析
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech 640222 SMART-Seq® ICELL8® cx Application Kit – 1 Chip 1 Rxn 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640019 ICELL8® 350v Chip 1 Chip 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640212 ICELL8® Collection Kit – L 1 Pkg 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640206 ICELL8® Loading Kit – B 1 Pkg 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640205 SMART-Seq® ICELL8® Indexing Primer Set – A 1 Chip 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640218 SMART-Seq® ICELL8® Indexing Primer Set – B 1 Chip 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640202 SMART-Seq® ICELL8®Reagent Kit 1 Chip 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640203 SMART-Seq® ICELL8® Reagent Kit 3 Chip 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640204 SMART-Seq® ICELL8® Reagent Kit 5 Chip 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640192 ICELL8® 384-Well Source Plate and Seal (5/pack) Each 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
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自动化高通量的单细胞全长转录组分析 延伸 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
 
  自动化高通量的单细胞全长转录组分析
 
SMART-Seq技术助力ICELL8 cx系统单细胞全长转录组分析方案
 
全长序列覆盖可以实现对整个转录的差异表达分析,并且可以对基因融合、剪接体这类生物标志物进行检测。高灵敏度的SMART-Seq Pro可以胜任以上分析需求。
SMART-Seq Pro Application Kit将SMART-Seq试剂与ICELL8 cx Single-Cell System(Cat No. 640188)相结合,并整合了生物信息学工具,提供一套端到端的单细胞全长转录组分析流程,一次实验可以对1,200~1,500个分离的单细胞进行高效的全长转录组分析。
通过ICELL8 cx系统将细胞分注到ICELL8 350v Chip(Cat No. 640019)空白微孔芯片中。使用ICELL8 cx CellSelect Software鉴定出含单个细胞的微孔,文库构建试剂只被分注到这些选中的微孔中。经过一系列分注和扩增步骤后,获得无偏倚的全长cDNA,并通过Illumina Bead-Linked Transposome(BLT)完成酶切片段化。在这一扩展性的工作流程中,cDNA扩增阶段引入了Illumina特异性接头序列,生成的文库已连接index接头,可直接用于Illumina测序平台。测序过程结束后,获得的测序数据可直接导入Cogent NGS软件工具进行生物信息学分析,解释测序结果。
 
NOTE:旧版本SMART-Seq Application Kit(Cat No. 640222)依然可以购买。
 
更多孔板测序应用,请参见 单细胞RNA-Seq / DNA-Seq
 
■ 概述
· 端到端的解决方案:从文库制备到测序数据分析工具
· 覆盖全长mRNA:捕获转录组中“深藏”的关键生物标志物,如基因融合、剪接异构体
· 高通量单细胞分析:可以平行地从>1,000个单细胞中生成测序数据
· 样品配置灵活:一次实验最多可对八种细胞样品进行分析
· 减少样品操作:减小数据波动,构建测序文库前自动鉴定并分选出感兴趣的细胞,仅对这些细胞进行试剂分注
· Illumina平台测序文库:制备的测序文库适用于Illumina全系平台
 
■应用
用于Illumina平台上高通量全长单细胞转录组测序文库制备
自动化高通量的单细胞全长转录组分析
图1. SMART-Seq Pro和Smart-seq2在PBMCs中基因检测结果比较
 
 
Technote:
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自动化高通量的单细胞全长转录组分析
 
 

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sgRNA体外转录和筛选酶试剂盒Takara Clontech

上海金畔生物科技有限公司代理Takara酶试剂盒全线产品,欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

sgRNA体外转录和筛选
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech 632635 Guide-it sgRNA In Vitro Transcription Kit 50 Rxns ¥9,377
¥7502
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Clontech 632636 Guide-it Complete sgRNA Screening System 50 Rxns ¥12,203
¥9152
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Clontech 632639 Guide-it sgRNA Screening Kit 50 Rxns ¥5,143
¥4114
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Clontech 632638 Guide-it IVT RNA Clean-Up Kit 50 Rxns ¥4,747 sgRNA体外转录和筛选 sgRNA体外转录和筛选 sgRNA体外转录和筛选

*红字为促销价格,促销时间: 2024年3月1日-2024年4月30日

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sgRNA的体外转录和筛选试剂盒
In Vitro Transcription and Screening Kits for sgRNA
我们的Guide-it in vitro transcription and screening kits for sgRNA 包括四个试剂盒,用于CRISPR/Cas9 研究中单链向导RNAs(single guide RNAs ,sgRNAs)的简单制备、清理和评价。每个试剂盒提供足够 50次反应的材料。
· Guide-it sgRNA In Vitro Transcription Kit (Code No. 632635) 被用于通过体外转录制备大量的 sgRNAs。这个试剂盒同样包括Guide-it IVT RNA Clean-Up Kit (Code No. 632638), 被用于快速纯化参与体外转录(vitro transcription,IVT) 反应的sgRNA。从这个试剂盒纯化后的 sgRNA 可以直接被用于转染、电穿孔以及体外剪切实验。
· Guide-it sgRNA Screening Kit (Code No. 632639) 可以在Cas9介导的基因编辑相关研究前,先在体外检测不同sgRNAs的效率,这样就不必浪费时间将无效的sgRNAs转入您的细胞了。使用这个试剂盒,首先通过PCR产生包含sgRNA靶点的模板,随后再与您想测试的sgRNA以及重组Cas9核酸酶结合。Cas9 核酸酶剪切模板的效率可以通过使用琼脂糖凝胶电泳检测。
· Guide-it Complete sgRNA Screening System (Code No. 632636) 包含以上提到的全部试剂盒组分,可以被用来合成和检测sgRNAs效率。该试剂盒包含了用于体外转录和纯化sgRNAs,以及检测重组Cas9核酸酶对PCR靶向片段剪切效率的所有试剂。
 
■ 产品特点
· 共有4个试剂盒,可用于Cas9介导的基因编辑研究中sgRNA (single guide RNA)的简单制备、清洁以及效率评价。
· Lenti-X Packaging Single Shots易于产生高滴度病毒。
· 使用Guide-it sgRNA In Vitro Transcription Kit (Code No. 632635; 包括Guide-it IVT RNA Clean-Up Kit, Code No. 632638)体外转录和纯化大量sgRNA,用于转染或体外筛选。
· 使用Guide-it IVT RNA Clean-Up Kit (Code No. 632638) 对IVT 反应后sgRNA的快速纯化,直接用于转染、电穿孔以及体外剪切试验。
· Guide-it sgRNA Screening Kit (Code No. 632639)包含高质量的重组Cas9蛋白质。
· Guide-it Complete sgRNA Screening System (Code No. 632636)是Guide-it sgRNA In Vitro Transcription Kit (Code No. 632635) 和 Guide-it sgRNA Screening Kit (Code No. 632639)的组合,允许您进行sgRNA制备和对预设靶点体外剪切能力的测试。
 
■ 实验例
sgRNA体外转录和筛选
图1. Guide-it sgRNA In Vitro Transcription and Screening System试剂盒组成和操作流程
 
sgRNA体外转录和筛选
图2. 采用Guide-it试剂盒制备高产量single guide RNA (sgRNA)和重组Cas9蛋白质剪切靶位点检测sgRNA剪切效率操作步骤概要
 
sgRNA体外转录和筛选
图3. Guide-it试剂和同类产品所制备的sgRNA品质比较
采用Guide-it sgRNA In Vitro Transcription Kit制备的所有sgRNAs均为单一条带,而其他公司同类产品制备的sgRNAs均可观察到杂带,因此Guide-it试剂盒所制备的sgRNAs品质更高。
* 比较结果来自于Takara Bio USA, Inc.
 
sgRNA体外转录和筛选
图4. 以不同基因为靶标制备的sgRNA产量和品质比较
采用Guide-it Complete sgRNA Screening System以多个基因为靶基因制备sgRNA。
Panel A. 将20 μl sgRNA体外转录(IVT)反应液置于37°C孵育4 hr,采用NanoDrop分光光度计检测所制备产生的sgRNA产量。
Panel B. 采用安捷伦生物分析仪分析分析每一个sgRNA IVT反应液,检测sgRNA质量。
 
■ 产品组份
Guide-it sgRNA In Vitro Transcription Kit (Code No. 632635; 50 rxns)
· 1 each Guide-it sgRNA In Vitro Transcription Components v2 (Code No. 632637; 50 rxns; Not sold separately)
    ○ 50 μl Guide-it Scaffold Template (1 ng/μl)
    ○ 350 μl Guide-it In Vitro Transcription Buffer
    ○ 1 ml RNase Free Water
    ○ 500 μl RNase Free Water
    ○ 150 μl Guide-it T7 Polymerase Mix (33 U/μl)
    ○ 625 μl PrimeSTAR Max Premix (2X)
    ○ 100 μl Recombinant DNase I (RNase-Free) (5 U/μl)
· 1 each Guide-it IVT RNA Clean-Up Kit (Code No. 632638; 50 rxns)
    ○ 13 ml RNase Free Water
    ○ 3 ml IVT Binding Buffer
    ○ 50 IVT RNA Clean-Up Spin Columns
    ○ 2 x 6 ml IVT Wash Buffer
    ○ 50 Collection Tubes (2 ml)

Guide-it sgRNA Clean-Up Kit (Code No. 632638; 50 rxns)
· 13 ml RNase Free Water
· 3 ml IVT Binding Buffer
· 50 IVT RNA Clean-Up Spin Columns
· 2 x 6 ml IVT Wash Buffer
· 50 Collection Tubes (2 ml)

Guide-it sgRNA Screening Kit (Code No. 632639; 50 rxns)
· 25 μl Guide-it Recombinant Cas9 Nuclease (500 ng/μl)
· 50 μl 15X Cas9 Reaction Buffer
· 50 μl 15X BSA
· 5 μl Control sgRNA (50 ng/μl)
· 25 μl Control Fragment (20 ng/μl)
· 50 μl Terra PCR Direct Polymerase Mix (1.25 U/μl)
· 1.25 ml 2X Terra PCR Direct Buffer (with Mg2+, dNTP)
· 5 ml RNase Free Water
· 5 ml Extraction Buffer 1
· 0.5 ml Extraction Buffer 2

Guide-it Complete sgRNA Screening System (Code No. 632636; 50 rxns)
· Guide-it sgRNA In Vitro Transcription Kit (Code No. 632635)
· Guide-it sgRNA Screening Kit (Code No. 632639)

 
 
 
■ 关联资料
点击查看Guide-it sgRNA体外转录和筛选系统宣传页 sgRNA体外转录和筛选
 
 
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自动化高通量的单细胞全长转录组分析酶试剂盒Takara Clontech

上海金畔生物科技有限公司代理Takara酶试剂盒全线产品,欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

自动化高通量的单细胞全长转录组分析
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech 640222 SMART-Seq® ICELL8® cx Application Kit – 1 Chip 1 Rxn 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640019 ICELL8® 350v Chip 1 Chip 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640212 ICELL8® Collection Kit – L 1 Pkg 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640206 ICELL8® Loading Kit – B 1 Pkg 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640205 SMART-Seq® ICELL8® Indexing Primer Set – A 1 Chip 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640218 SMART-Seq® ICELL8® Indexing Primer Set – B 1 Chip 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640202 SMART-Seq® ICELL8® Reagent Kit 1 Chip 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640203 SMART-Seq® ICELL8® Reagent Kit 3 Chip 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640204 SMART-Seq® ICELL8® Reagent Kit 5 Chip 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
Clontech 640192 ICELL8® 384-Well Source Plate and Seal (5/pack) Each 询价 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
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自动化高通量的单细胞全长转录组分析 延伸 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析 自动化高通量的单细胞全长转录组分析
 
  自动化高通量的单细胞全长转录组分析
 
 
高通量、高品质、更便捷的单细胞全长转录组分析解决方案
· 高通量单细胞分析:同时生成上千单细胞测序数据
· 样品灵活性高:一次试验可同时对8个不同样品进行单细胞分析
· 更少样品处理:自动完成文库构建前的细胞分离、挑选及样品收集,偏差更小
· 兼容Illumina测序平台:构建的文库支持Illumina平台测序
 
■ 应用领域
· 适用于Illumina平台的高通量、全长单细胞RNA-Seq文库的制备
 
■ 产品说明
转录本全长序列可以提供基因差异表达、基因融合以及可变剪切等高灵敏度分析。Takara的高通量单细胞全长转录组解决方案整合了SMART-Seq试剂,灵敏度更高。经过ICELL8 cx Single-Cell System(Code No. 640188)进行单细胞分选后,可获得>1,000个单细胞全长转录组信息。该实验流程支持在ICELL8芯片上直接进行cDNA扩增,同时引入Illumina特异接头序列,获得含Index的文库可直接用于Illumina平台测序。
ICELL8 cx Single-Cell System(Code No. 640188)能够将细胞分注到含5,184个纳米孔的空白ICELL8 350v芯片(Code No. 640019)中,完成单细胞的分离。使用CellSelect软件鉴定出含有“活的单细胞”的微孔。接着,SMART RT-PCR试剂被分注到选中的“活的单细胞”微孔中,然后将芯片转移至ICELL8 Chip Cycler中进行反应。在单次反应中,通过一步法RT-PCR完成cDNA第一链的合成与扩增。得到的全长cDNA直接在芯片上使用TED1(Illumina Tagment DNA Enzyme)进行片段化处理,片段化的cDNA 再通过正向和反向的Index引物(Code No. 640205、640218)进行扩增。包含了全长信息的扩增产物从芯片中混合收集,经纯化、扩增后即可获得测序用文库。
 
■ 产品组分
完整的工作流程需要下列Takara Bio产品。请参考对应的User Manual得到一份完整的试剂耗材清单:
用于ICELL8 cx Single-Cell System
· SMART-Seq ICELL8 cx Application Kit-1 Chip (Code No. 640222)*
· ICELL8 384-Well Source Plate and seal (5/pack) (Code No. 640192)
User Manual:SMART-Seq® ICELL8® cx Application Kit User Manual
* SMART-Seq ICELL8 cx Application Kit-1 Chip 包含以下五种制品,640019、640212、640206、640202、640205。640222包装量对应1张芯片用量。如实验中需要使用多张芯片,各制品可单独加购
· ICELL8 350v Chip (Code No. 640019)
· ICELL8 Collection Kit-L (Code No. 640212)
· ICELL8 Loading Kit-B (Code No. 640206)
· SMART-Seq ICELL8 Reagent Kit(Code No. 640202)
· SMART-Seq ICELL8 Indexing Primer Set-A (Code No. 640205)
自动化高通量的单细胞全长转录组分析
 
图1 ICELL8 cx单细胞全长转录组测序文库制备工作流程
 
自动化高通量的单细胞全长转录组分析
图2. 代表性样品的转录本覆盖度评价将人类基因组编码的不同转录本进行长度均一化。选取两个分选的K562细胞,将两个细胞中,比对到的reads覆盖度情况沿均一化后的转录本方向(5’→3’)绘制成曲线图(均一化转录本上5’→3’的位置信息由X轴上的百分数表示)。Y轴上,沿均一化转录本方向,将覆盖度相对于观察到的最大覆盖度进行均一化,由0-1范围表示。
 
自动化高通量的单细胞全长转录组分析
图3. 基因表达检测的重复性评价 为评价使用ICELL8单细胞分选系统制备全长转录组文库的测序数据重复性,对鉴定到的所有转录本进行基因表达检测。所有单细胞文库基因表达检测结果的Pearson相关性如热图所示。
 
Technote:
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反转录试剂盒(含热敏双链DNA酶)

反转录试剂盒(含热敏双链DNA酶)

货号:BL696A

规格: 100T

品牌:biosharp

商品详情:

Reverse Transcription Kit (with dsDNase)

反转录试剂盒(含热敏双链DNA酶)

产品编号

产品名称

规格

BL696A

反转录试剂盒(含热敏双链DNA酶)

100T

 

产品简介

本产品是一种高效、稳定、快速并可以去除基因组 DNA 污染的反转录系统,只需加入模板 RNA 和水即可进行反应,合成的第一链cDNA可广泛用于文库构建、第二链合成、杂交、PCR扩增、RT-qPCR检测等。5×Reaction Mix包含反转录反应所需的缓冲液,dNTPs及优化的反转录引物,Enzyme Mix包含Reverse Transcriptase, Ribonuclease Inhibitor和dsDNase,简化了加样步骤。试剂盒采用的反转录酶去除了RNase H活性,且热稳定性更强,可耐受55℃反应,提高复杂RNA模板的反转录效率。该反转录酶产物得率更高,获得的cDNA片段更长,模板使用范围更广。

dsDNase为新型热敏双链特异性核酸酶,可在反转录过程中直接降解去除RNA样品中残留的基因组DNA(gDNA)污染,而不消化RNA样品、反转录引物及合成的cDNA。并且该酶具有热敏感性,可在55℃快速不可逆失活,实现去除基因组污染与反转录反应的同步进行。

 

产品组成:

组分

100T

5× Reaction Mix

400 μl

Enzyme Mix

300 μl

DEPC-treated Water

2×1 ml

 

使用方法:

1、将模板RNA和试剂在冰上解冻,使用前将每种溶液轻弹或者轻微涡旋振荡混匀,简短离心以收集残留在管壁的液体到管底。

2、在RNase free管中冰上配制以下反应体系:

组分

体积

Total RNA/mRNA

As Required*

DEPC-treated Water

Up to 13 μl

5× Reaction Mix

4 μl

Enzyme Mix

3 μl

 

*:Total RNA建议用量为10 pg-5 μg,mRNA建议用量为10 pg-500 ng,为保证反转录成功,请使用高质量RNA模板。

 

温度

时间

说明

25℃

10min

随机引物与RNA模板配对,去除基因组DNA

55℃

15min

反转录反应及dsDNase快速灭活

85℃

5min

反转录酶灭活

3、移液器轻轻吹打混匀,运行如下程序

 

4、得到的cDNA产物可立即用于PCR或qPCR反应,或在-20℃保存,并在半年内使用;长期存放建议分装后在-80℃保存。cDNA应避免反复冻融。

注意事项:

1、避免RNase污染。

2、为保证反转录成功建议使用高质量的RNA样品。

3、5× Reaction Mix及Enzyme Mix易吸附在管壁和吸头外导致损失,用前请瞬时离心,并避免吸头外壁沾附损失。

4、为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

 

保存方法:

避免反复冻融,-20 ℃保存2年。

货号 BL696A
规格 100T
品牌 biosharp

AMV Reverse Transcriptase (Promega原装).

AMV Reverse Transcriptase (Promega原装).

货号:
M5101

品牌:
Promega

产品简介
别名 反转录酶
英文名称 AMV Reverse Transcriptase
储存条件 -20℃
单位
规格 300u(10U/ul)
AMV 反转录酶 5×反应缓冲液(M515A):与 AMV 反转录酶一起提供的 5×反应缓冲液的组成为:250mM Tris-HCl(pH8.3 ,25℃),250mM KCl,50mM MgCl2,2.5mM 亚精胺和 50mM DTT。
酶储存液:AMV 反转录酶(AMV-RT)

储存液组成为:200mM 磷酸钾(pH7.2 ,4℃),0.2% Triton X®-100,2mM DTT 和 50% 甘油。
来源:酶纯化于禽成髓细胞瘤病毒颗粒。
储存条件:保存于-20℃。避免反复冻融,切忌暴露于温度频繁变化的环境。请注意查看产品标签上的 过期日期。
活力单位定义:在 37℃下,10 分内催化转化 1nmol 脱氧核苷酸为酸性可沉淀物质所需的酶量即一个活 力单位。反应条件为:50mM Tris-HCl(pH8.3),40mM KCl,8.75mM MgCl2, 10mM DTT,0.1mg/ml 乙酸化的 BSA ,1mM 放射性标记的 dTTP 和 0.25mM poly(A):oligo(dT)。请注意查看产品标签上的活力单位浓度。
注意:

1. AMV 反转录酶 5×缓冲液仅用于 cDNA 第一链的合成,它不含有脱氧核苷酸,因此不能替换 Promega 的 RiboClone AMV RT First-Strand 5×buffer(Part # C121A),C121A 为 Universal RiboClone cDNA System(目录号 C4360)中的一个组份,含有四种 dNTP。Promega 的 Access RT-PCR System(目录 号 A1250)是使用 AMV 反转录酶和 Tfl DNA 聚合酶,把反转录和 PCR 整合为一步而无须中间操作的 试剂盒,其中的缓冲液与 AMV 反转录酶 5×反应缓冲液组份不同,所以这两种缓冲液也是不能互 相替换的。
2. AMV 反转录酶 5×缓冲液不能用于 M-MLV 反转录酶。
3. 如果你将使用Taq DNA Polymerase 于 PCR 反应,那么可以直接加入体积在 10ul 以内的本反转录反 应混合物。如果你使用的是 GoTaq® DNA Polymerase(目录号 M3001)或 PCR Master Mix(目录号 M7501)那么可以直接加入 25ul 以内的本反转录反应混合物于 50ul PCR 体系中。

通用反转录试剂盒(M-MLV,不含Taq酶)

通用反转录试剂盒(M-MLV,不含Taq酶)

货号:
RP1105

品牌:
Jinpan

产品简介
英文名称 Universal RT-PCR Kit(M-MLV, free Taq polymerase)
储存条件 -20℃,有效期1年
规格 50T 100T

产品简介:

本试剂盒适用于各种 RNA制品的反转录反应。它采用M-MLV进行反转录反应,能够获得较长的反转录产物用于后续的PCR扩增和分子克隆实验。

本试剂盒中配置的酶为进口的酶。RT酶采用进口的M-MLV,所以cDNA更长,基因的信息保留得更完整!反转录过程中特异的RNase抑制剂可有效降低由于外源RNase污染而导致实验失败的风险。本试剂盒使用方便、快捷,可广泛用于cDNA克隆及目的基因检测等分子生物学实验。

注意事项

1、 用于cDNA合成反应的相关试剂和耗材尽可能用DEPC进行处理,并在高压灭菌后使用。有些试剂不能高压灭菌时,首先用经过灭菌的器具、水等配制溶液后,再将溶液进行过滤除菌处理。

2、 试剂盒的各组分应在-20℃保存,避免反复冻融,有效期12个月。

3、 RNA样品要避免反复多次冻融,应使RNA在冰浴中处于融化状态。