透明无裙边96孔高架孔PCR板,适配MegaBase测序仪,未灭菌

透明无裙边96孔高架孔PCR板,适配MegaBase测序仪,未灭菌

货号:
PCR-96-MB-C

品牌:
Axygen

产品简介
单位
英文名称 96WellPolypropylenePCRMicroplate,NoSkirt,ElevatedWells,CompatiblewithMegaBACESequencer,Clear,Nonsterile
规格 10块/包,5包/箱

PPSQ岛津蛋白肽测序仪配套试剂/色谱柱蛋白研究-Wako富士胶片和光

PPSQ岛津蛋白肽测序仪配套试剂/色谱柱蛋白研究-Wako富士胶片和光

供货周期 一个月以上 应用领域 生物产业

PPSQ岛津蛋白肽测序仪配套试剂/色谱柱
Lysyl Endopeptidse, Mss Spectrometry Grde、rifluorocetic cid

岛津蛋白测序仪配套试剂/色谱柱PPSQ岛津蛋白肽测序仪配套试剂/色谱柱蛋白研究-Wako富士胶片和光

 

 

品牌:日本和光

产地:日本

 

产品编号

中文名称

包装

用途

125-05061

赖氨酰肽链内切酶,质谱等级

20微克×5

用于蛋白质研究

202-15951

胰蛋白酶,猪胰脏来源,质谱等级

20微克×5 

用于蛋白质研究

200-20021

12%*.胺溶液

200毫升

用于岛津蛋白肽测序

207-10761

207-20031

三氟.乙酸

40毫升

用于岛津蛋白肽测序

204-10771

018-26041

37%乙腈溶液

200​毫升

用于岛津蛋白肽测序

014-13831

033-24371

1-氯丁烷

200毫升

用于岛津蛋白肽测序

021-09851

052-09041

乙酸乙酯

200毫升

用于岛津蛋白肽测序

054-04981

084-05501

庚烷

200毫升

用于岛津蛋白肽测序

014-12471

乙腈

200毫升

用于岛津蛋白肽测序

165-27361

PTH-氨基酸混合标准品

2毫升用×4

用于岛津蛋白肽测序

163-12271

168-27351

PTH-氨基酸流动相

1升

用于岛津蛋白肽测序

161-14271

161-27341

5%异硫氰酸苯酯,正庚烷溶液

40毫升

用于岛津蛋白肽测序

168-14161

204-20041

25%三氟.乙酸溶液

40毫升

用于岛津蛋白肽测序

203-12201

072-06461

玻璃纤维盘,TFA处理

50 Plates

用于岛津蛋白肽测序

073-04171

235-63951

色谱柱

1 Column

293-57701

负凝胶染色MS试剂盒

20 tests 

用于电泳

299-58901

银染剂MS试剂盒

20 tests

用于电泳

132-18821

30%N-甲基哌啶溶液(用于梯度洗脱)

200毫升

用于岛津蛋白肽测序

202-20721

25%三氟.乙酸溶液(用于梯度洗脱)

40毫升

用于岛津蛋白肽测序

236-63981

Wakopak® Wakosil PTH-GR (S-PSQ)

(用于梯度洗脱)

1 EA

用于岛津蛋白肽测序

163-28261

PTH-氨基酸流动相 A(用于梯度洗脱)

1升

用于岛津蛋白肽测序

160-28271

PTH-氨基酸流动相 B(用于梯度洗脱)

1升

用于岛津蛋白肽测序

 

注:

产品编号125-05061质谱分析前处理时常用的蛋白质分解酶即赖氨酸肽链内切酶,该酶可以特异性切除赖氨酸基团C末端的多肽,可用于蛋白测序分析和Lys-X化合物的合成。若同时使用赖氨酸肽链内切酶和胰酶,可更好地切断赖氨酸基团的多肽,增加多肽的数量。

 

岛津蛋白测序仪配套试剂/色谱柱岛津蛋白测序仪配套试剂-Wako富士胶片和光

岛津蛋白测序仪配套试剂/色谱柱岛津蛋白测序仪配套试剂-Wako富士胶片和光

供货周期 一个月以上 应用领域 化工

岛津蛋白测序仪配套试剂/色谱柱
产地:日本
注:
#125-05061质谱分析前处理时较常用的蛋白质分解酶即赖氨酸肽链内切酶,该酶可以特异性切除赖氨酸基团C末端的多肽,可用于蛋白测序分析和Lys-X化合物的合成。若同时使用赖氨酸肽链内切酶和胰酶,可更好地切断赖氨酸基团的多肽,增加多肽的数量。

岛津蛋白测序仪配套试剂/色谱柱岛津蛋白测序仪配套试剂/色谱柱岛津蛋白测序仪配套试剂-Wako富士胶片和光

 

 

品牌:日本和光

产地:日本

 

产品编号

中文名称

包装

用途

125-05061

赖氨酰肽链内切酶,质谱等级

20微克×5

用于蛋白质研究

202-15951

胰蛋白酶,猪胰脏来源,质谱等级

20微克×5 

用于蛋白质研究

200-20021

12%三甲.胺溶液

200毫升

用于岛津蛋白肽测序

207-10761

207-20031

三氟.乙酸

40毫升

用于岛津蛋白肽测序

204-10771

018-26041

37%乙腈溶液

200​毫升

用于岛津蛋白肽测序

014-13831

033-24371

1-氯丁烷

200毫升

用于岛津蛋白肽测序

021-09851

052-09041

乙酸乙酯

200毫升

用于岛津蛋白肽测序

054-04981

084-05501

庚烷

200毫升

用于岛津蛋白肽测序

014-12471

乙腈

200毫升

用于岛津蛋白肽测序

165-27361

PTH-氨基酸混合标准品

2毫升用×4

用于岛津蛋白肽测序

163-12271

168-27351

PTH-氨基酸流动相

1升

用于岛津蛋白肽测序

161-14271

161-27341

5%异硫氰酸苯酯,正庚烷溶液

40毫升

用于岛津蛋白肽测序

168-14161

204-20041

25%三氟.乙酸溶液

40毫升

用于岛津蛋白肽测序

203-12201

072-06461

玻璃纤维盘,TFA处理

50 Plates

用于岛津蛋白肽测序

073-04171

235-63951

色谱柱

1 Column

293-57701

负凝胶染色MS试剂盒

20 tests 

用于电泳

299-58901

银染剂MS试剂盒

20 tests

用于电泳

132-18821

30%N-甲基哌啶溶液(用于梯度洗脱)

200毫升

用于岛津蛋白肽测序

202-20721

25%三氟.乙酸溶液(用于梯度洗脱)

40毫升

用于岛津蛋白肽测序

236-63981

Wakopak® Wakosil PTH-GR (S-PSQ)

(用于梯度洗脱)

1 EA

用于岛津蛋白肽测序

163-28261

PTH-氨基酸流动相 A(用于梯度洗脱)

1升

用于岛津蛋白肽测序

160-28271

PTH-氨基酸流动相 B(用于梯度洗脱)

1升

用于岛津蛋白肽测序

 

注:

产品编号125-05061质谱分析前处理时常用的蛋白质分解酶即赖氨酸肽链内切酶,该酶可以特异性切除赖氨酸基团C末端的多肽,可用于蛋白测序分析和Lys-X化合物的合成。若同时使用赖氨酸肽链内切酶和胰酶,可更好地切断赖氨酸基团的多肽,增加多肽的数量。

 

君意JY-CX1B型测序电泳槽

君意JY-CX1B型测序电泳槽

君意JY-CX1B型测序电泳槽

  • 商品品牌: 君意
    商品编号:JY-CX1B
  • 商品价格: 请与我们联系
  • 君意JY-CX1B型测序电泳槽-君意-JY-CX1B

    • 类别:测序
    • 缓冲液总容量:0-900ml
    • 品牌属性:国产
    生命科学仪器|||电泳成像|||电泳仪|||君意JY-CX1B型测序电泳槽
    JY-CX1B型测序电泳槽

    君意JY-CX1B型测序电泳槽功能特点:

    1、适合于AELP, SSR, SSCP, HA, DNA Footprinting, RNase, JJS1Nucleas 实验。

    2、经特殊处理的超平弹性散热铝板,与凝胶玻璃紧密接触,使玻璃板温度分布均匀,

     利用整个板面散发热量,将产生条带扭曲现象的可能性降至最低。

    3、可拆卸的缓冲液底槽,容易清洗。

    4、操作简单!只需4个紧固旋扭。

    5、更少的缓冲液,无漏胶,漏液。

    6、获得清淅,笔直的电泳条带。

    7、方便制多块胶, 适用于批量实验 。

    8、开盖断电功能,带安全护套的导线。


    商品属性

    • 类别:测序
    • 缓冲液总容量:0-900ml
    • 品牌属性:国产
    商品属性
    商品名称 君意JY-CX1B型测序电泳槽-JY-CX1B-君意
    型号 JY-CX1B
    类别 生命科学仪器|||电泳成像|||电泳仪|||君意JY-CX1B型测序电泳槽
    品牌 君意
    品牌简介 君意
    关键字 JY-CX1B型测序电泳槽,电泳槽,缓冲液,条带,可拆卸,护套,功能

    君意JY-CX1B型测序电泳槽

    君意JY-CX3B型测序电泳槽

    君意JY-CX3B型测序电泳槽

    君意JY-CX3B型测序电泳槽

  • 商品品牌: 君意
    商品编号:JY-CX3B
  • 商品价格: 请与我们联系
  • 君意JY-CX3B型测序电泳槽-君意-JY-CX3B

    • 类别:测序
    • 缓冲液总容量:0-900ml
    • 品牌属性:国产
    生命科学仪器|||电泳成像|||电泳仪|||君意JY-CX3B型测序电泳槽
    JY-CX3B型测序电泳槽

    君意JY-CX3B型测序电泳槽 功能特点:

    1、与同类产品相比,可节省尽50%的电泳缓冲液。

    2、独特的开盖断电结构,使实验过程安全可靠。

    3、优质的鲨鱼齿加样梳易于观察加样,不易串样。

     4、操作简单,只需4个紧固旋钮。

     5、采用特殊工艺铝板控温装置,使整个胶板温度均匀,

       将产生条带扭曲现象的可能性降只至最低。

     6、上层缓冲液配有排放管,下层缓冲液槽可以方便取下,倾倒缓冲液。


    商品属性

    • 类别:测序
    • 缓冲液总容量:0-900ml
    • 品牌属性:国产
    商品属性
    商品名称 君意JY-CX3B型测序电泳槽-JY-CX3B-君意
    型号 JY-CX3B
    类别 生命科学仪器|||电泳成像|||电泳仪|||君意JY-CX3B型测序电泳槽
    品牌 君意
    品牌简介 君意
    关键字 JY-CX3B型测序电泳槽,电泳槽,缓冲液,条带,旋钮,电泳,下层

    君意JY-CX3B型测序电泳槽

    质谱级赖氨酰肽链内切酶岛津蛋白测序仪配套试剂-Wako富士胶片和光

    质谱级赖氨酰肽链内切酶岛津蛋白测序仪配套试剂-Wako富士胶片和光

    供货周期 一个月以上 应用领域 生物产业

    质谱级赖氨酰肽链内切酶
    本产品是质谱分析前处理时常用的蛋白分解酶即赖氨酰肽链内切酶,该酶可以特异性切除赖氨酸基团C末端的多肽,可用于蛋白测序分析和Lys-X化合物的酶合成。若同时使用赖氨酰肽链内切酶和胰酶,可更好地切断赖氨酸 基团的多肽,增加多肽的数量。产品已按照使用习惯做成小包装,是方便使用的冷冻干燥品。

    质谱级赖氨酰肽链内切酶质谱级赖氨酰肽链内切酶岛津蛋白测序仪配套试剂-Wako富士胶片和光

     

      本产品是质谱分析前处理时常用的蛋白分解酶即赖氨酰肽链内切酶,该酶可以特异性切除赖氨酸基团C末端的多肽,可用于蛋白测序分析和Lys-X化合物的酶合成。若同时使用赖氨酰肽链内切酶和胰酶,可更好地切断赖氨酸 基团的多肽,增加多肽的数量。产品已按照使用习惯做成小包装,是方便使用的冷冻干燥品。

     

    来源:细菌

    外观:冻干粉(包含2 mmol/L Tris-HCl缓冲液,pH8)

    活性:0.03~0.07 AU/vial

    分子量:27,000(琼脂糖过滤),30,000(SDS-PAGE)

    溶解性:溶于水或缓冲液

    稳定性:溶解于pH值5.0-12.0的Tris缓冲液中,可在4℃稳定保存2年;在pH值6.0-11.0 30℃时能稳定保存,但温度超过50℃时不稳定。

    适pH值:9.0~9.5

    等电点:6.9~7.0 

    底物特异性:

    可水解底物——Tos-Lys-OMe,Bz-Lys-NH2,Bz-Lys-pNA,Lys-pNA

    不可水解底物——Bz-Arg-NH2,Bz-Arg-pNA,Arg-pNA

    抑制剂:DFP,PMSF,TLCK

     

    特点

    质谱级赖氨酰肽链内切酶岛津蛋白测序仪配套试剂-Wako富士胶片和光

    ● 高特异性、高蛋白质消化率、适用于蛋白质谱分析

    提高裂解效率、增加肽段数量

    根据使用量特意制备小包装,方便使用

     

    应用

     

      分别采用胰蛋白酶(Tp)、赖氨酰肽链内切酶 (Lys-C) 和Tp与Lys-C联用进行胶内酶切的效果比较。

      牛血清蛋白BSA 的条带(100ng) 通过SDS-PAGE 获得,然后分别用Tp、Lys-CLys-C+Tp进行酶切,再用MALDI-TOFMS法进行分析。

      这些蛋白酶的实验效果见下表。

     

    表 1:Tp、Lys-CLys-C+Tp的结果对照

    这些结果表明Lys-C酶解的错误裂解率低。Tp酶解时加入Lys-C后,错误裂解率有所降低,同时,可以鉴定出更多的多肽。

     

     

    Tp 

    Lys-C

    Lys-C+Tp

    裂解位点

    精氨酸和赖氨酸的C端 

    赖氨酸的C端 

    精氨酸和赖氨酸的C端

    错误裂解率

    (  错误裂解所占比例  )

    多(8%)

    很少(0%)

    少(3%) 

    鉴定出的多肽数量 

    17

    19

    22

     

    质谱级赖氨酰肽链内切酶岛津蛋白测序仪配套试剂-Wako富士胶片和光

     

    胰蛋白酶 (Tp)( 图 a) 和赖氨酰肽链内切酶 (Lys-C)+Tp ( 图 b) 酶切后的质谱结果对照图。

    Lys-C+Tp酶切后,可以在m/z=2000时得到吸收峰,而单独的Tp酶切在m/z=2000时没有吸收峰。该结果表明Lys-C可以提高测序覆盖度。

    ( 数据由大阪医疗中心和妇婴健康研究所Y. Wada博士提供 )

     

    赖氨酰肽链内切酶

      

    赖氨酰肽链内切酶,初由Masaki 等人从土壤细菌中分离得到。该酶可以特异性剪切赖氨酸残基C 末端和S-氨乙基半胱氨酸残基的肽键,用于蛋白测序和Lys-X 化合物的酶催化合成。该酶稳定性高,在4M 尿素或0.1%SDS 溶液中30℃孵育6小时之后,仍然拥有完整的生物活性。

     

    外观

      冻干粉(包含ca. 10% Tris-HCl buffer,pH 8)

    活性

      见包装

    分子量

      27,000(凝胶过滤);30,000 (SDS-PAGE)

    溶解性

      易溶于水或缓冲液

    pH

      9.0-9.5(酰胺酶的活性pH)

    等电点

      6.9-7.0

    抑制剂

      DFP、PMSF、TLCK

    来源

      细菌

    稳定性

     溶于pH 值5.0-12.0 的缓冲液中,可于4℃稳定保存。溶于pH值6.0-11.0的缓冲液中,可于30℃稳

     定保存,但是50℃及以上不稳定。

    单位定义

     一单位酰胺酶(AU) 指在30℃ pH 9.5 时每分钟产生1 μmol对硝基苯胺所需的酶量。

    底物特异性

     水解底物:Tos-Lys-Ome、Bz-Lys-NH2、Bz-Lys-pNA、Lys-pNA

     非水解底物:Bz-Arg-NH2、Bz-Arg-pNa、Arg-pNA

     

    产品编号 产品名称 产品规格 产品等级
     125-05061 赖氨酰肽链内切酶,MS级   20 μg×5 质谱级 

     

    质谱级赖氨酰肽链内切酶

    ABI DNA测序仪3130

    ABI DNA测序仪3130

    ABI DNA测序仪3130

  • 商品品牌: ABI
    商品编号:3130
  • 商品价格: 请与我们联系
  • ABI DNA测序仪3130-ABI-3130

    • 最大功率 :2000W
    • 品牌属性:进口
    生命科学仪器|||分子生物|||DNA测序仪|||ABIDNA测序仪3130
    DNA测序仪

    ABI DNA测序仪3130

    3130 基因分析仪由美国应用生物系统公司和日本东京日立公司旗下的日立高科技公司共同研制。美国应用生物系统公司和日本东京日立高科技公司自1997年开始合作研发基因分析仪器的新产品。

    性能特点:

    • 3130xl 采用 16 道毛细管,3130 系统采用 4道毛细管
    • 24 小时无人监控操作
    • 仪器设置更方便更简单
    • 新型自动灌胶系统进行灌胶
    • 检测池加热器改进了温度控制
    • 通过 96 孔和 384 孔板自动进样
    • 3130 POP-7™、POP-6™ 和 POP-4™ 分离胶
    • 多色荧光检测
    • 一种分离胶一种毛细管用于多种应用

    系统组成

    3130 基因分析仪由以下组件组成:

    • 毛细管电泳仪

    • 计算机工作站:用于仪器控制和数据分析

    • 软件:用于仪器控制、数据收集和样品文件自动分析

    分析软件包括:

    – 用于碱基识别的序列分析软件

    – 用于微卫星、SNP、AFLP 和 LOH 分析的 GeneMapper®/GeneMapper® ID 软件

    – 用于比较测序、突变检测,以及杂合子插入和剔除的 SeqScape® 软件

    – 用于基因分析仪和实时荧光定量PCR仪的 BioTrekker™ 软件,

    该软件可将分析好的基因型数从 GeneMapper™ Software v3.5 和 SDS Enterprise Database v2.2 下载至单一结果数据库。

    毛细管束

    提供预组装的 4 根或 16 根内壁无涂层毛细管。毛细管束有多种长度,为多种应用和分析

    方法提供支持。这些毛细管束在 3130xl 系统上的特定使用寿命为 100 次,在 3130 系统

    上为 150 次。它们与业界标准的 96 孔和 384 孔板配合使用。

    分离胶

    3130 POP-7™、POP-6™ 和 POP-4™ 三种分离胶(性能优化分离胶)均可以在美国应用

    生物系统公司的 3130 和 3130xl 基因分析仪上用作分离介质。在每次分析之前,毛细管

    自动使用新胶进行补充,这些新胶动态覆盖毛细管壁,以消除电渗流。

    样品要求

    3130 系列系统可以分析由各种样品制备方法制备的多种类型的模板。可以从 96 孔和 384 孔微孔板中自动进样。

    • 激光 氩离子多波长单模激光器,主要激发波长为:488 和 514.5 nm。

    • 检测光学系统 美国应用生物系统公司 3130 系统基因分析仪使用专利的激发光和荧光

    检测光路 来增强荧光信号强度的均一性。这些检测光学系统实时检测来自各泳道毛细管的低本底、全波长光谱数据。毛细管的外径 (od)、内径 (id) 和间距都已进行优化,将因折射引起的信号丢失降至最低。

    • 电泳电压 最高 可达20 kV

    • 操作温度范围 18°C–65°C


    商品属性

    • 最大功率 :2000W
    • 品牌属性:进口
    商品属性
    商品名称 ABI DNA测序仪3130-3130-ABI
    型号 3130
    类别 生命科学仪器|||分子生物|||DNA测序仪|||ABIDNA测序仪3130
    品牌 ABI
    品牌简介 ABI
    关键字 DNA测序仪,毛细管,系统,基因,日立,软件,荧光

    ABI DNA测序仪3130

    NEBNext® 免疫测序试剂盒(人) #E6320L 96 次反应-NEB酶试剂 New England Biolabs

    上海金畔生物科技有限公司代理New England Biolabs(NEB)酶试剂全线产品,欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

    产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于 Illumina 测序平台/免疫测序

    NEBNext® 免疫测序试剂盒(人)                              收藏

    货 号
    规 格
    价 格(元)
    北京库存
    上海库存
    广州库存
    成都库存
    苏州库存
    武汉库存

    #E6320L
    96 次反应
    74,739.00

    #E6320S
    24 次反应
    21,809.00

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    产品特点

     • 通过对受体序列的深入分析,揭示复杂的免疫系统

    对 B 细胞受体(BCR)和 T 细胞受体(TCR)进行富集和测序
    制备 B 细胞和 T 细胞的全长免疫基因组库
    使用唯一分子标签序列(UMI)准确定量转录本
    使用用于生物信息流程(教程)的开源软件工具——pRESTO 分析数据
     

    产品说明

     概述

    免疫组库测序常常用来分析当下的和过去的免疫应答反应。最常应用领域包括:自身免疫性疾病的表征、肿瘤学、传染病中和抗体的发现、肿瘤浸润淋巴细胞以及用作研究残留病的工具。二代测序(NGS)平台在读长和通量方面的最新进展促进了免疫组库测序的发展。

     
    NEBNext® 免疫测序试剂盒(人)通过对 B 细胞和 T 细胞全长免疫组库分析,能获得体细胞的所有突变信息。该试剂盒提供引物模块,可用于分析完整的 V、D、J 区域和 IgM、IgD、IgG、IgA、IgE 亚类,并分析 BCR 轻链、BCR 重链、TCRα 链和 TCRβ 链。该试剂盒还提供唯一分子标签序列(UMI),将来源于同一个分子的 PCR 产物组成共有序列,以便提高测序准确性,消除 PCR 偏差。Galaxy 平台提供一个开源软件工具——pRESTO,用于在本地或云端开展超强生物信息分析。为了确保不熟悉 Galaxy 平台的用户能成功使用分析软件,pRESTO 提供教学教程。
     
    抗体和 TCR 结构的简化示意图:
    NEBNext® 免疫测序试剂盒(人)                               #E6320L 96 次反应
     
     
    免疫组建库流程:
    NEBNext® 免疫测序试剂盒(人)                               #E6320L 96 次反应
     
    产品描述
    NEBNext® 免疫测序试剂盒(人)                               #E6320L 96 次反应
    使用唯一分子标签序列(UMI)实现克隆型的精准检测。比较克隆型频率:使用 10 ng 和 100 ng T 细胞总 RNA 制备人类 TCR 文库,在有或没有 UMI 情况下分别建库。根据有 UMI 的测序结果,对前 100 个高表达克隆型进行排序。重复建库,克隆型频率重叠绘制于图中。每个条形或圆点代表一个克隆,该克隆经过总读长分析或使用 UMI 过滤。使用 UMI 可对原始样本中的起始 RNA 分子进行绝对定量。当将克隆按照富集度从高到底进行排序,没有 UMI 的数据会导致 PCR 或测序扩增的偏差,从而误导样本中克隆型频率的分析。UMI 的使用通过对起始样本中 RNA 的绝对定量来校正偏差。使用 UMI 也可以在重复本之间实现更好的相关性,尤其是起始量较低时。各个文库向下抽样 500,000 reads。
     
    NEBNext® 免疫测序试剂盒(人)                               #E6320L 96 次反应
    使用 NEBNext 免疫测序试剂盒(人),能够在同一管中制备人 BCR 和 TCR 文库。分别使用 1 μg、100 ng 和 10 ng 人 PBMC 总 RNA(Takara Bio #636592)制备人 BCR+TCR 文库,每个起始量都做有平行实验。所有文库向下抽样 950,000 reads。使用 pRESTO 工具完成 reads 过滤、序列组装和基于 UMIs 组成共有序列。使用 MiGMAP 鉴别 V、D 和 J 区域。图(A)表示每个人类 PBMC 总 RNA 起始样本检测到的克隆型数量。图(B)表示各文库中 B 细胞链和 T 细胞链所占百分比。
     

     

    NEBNext® 免疫测序试剂盒(小鼠) #E6330L 96 次反应-NEB酶试剂 New England Biolabs

    上海金畔生物科技有限公司代理New England Biolabs(NEB)酶试剂全线产品,欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

    产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于 Illumina 测序平台/免疫测序

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    #E6330L
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    相关产品

    NEBNext® 免疫测序试剂盒(人)

    产品特点

     • 通过对受体序列的深入分析,揭示复杂的免疫系统

    对 B 细胞受体(BCR)和 T 细胞受体(TCR)进行富集和测序
    制备 B 细胞和 T 细胞的全长免疫基因组库
    使用唯一分子标签序列(UMI)准确定量转录本
    使用用于生物信息流程(教程)的开源软件工具——pRESTO 分析数据
     

    产品说明

    概述:

    免疫组库测序常常用来分析当下的和过去的免疫应答反应。最常应用领域包括:自身免疫性疾病的表征、肿瘤学、传染病中和抗体的发现、肿瘤浸润淋巴细胞以及用作研究残留病的工具。二代测序(NGS)平台在读长和通量方面的最新进展促进了免疫组库测序的发展。

     

    NEBNext® 免疫测序试剂盒(人)通过对 B 细胞和 T 细胞全长免疫组库分析,能获得体细胞的所有突变信息。该试剂盒提供引物模块,可用于分析完整的 VDJ 区域和 IgMIgDIgGIgAIgE 亚类,并分析 BCR 轻链、BCR 重链、TCRα 链和 TCRβ 链。该试剂盒还提供分子标签序列(UMI,将来源于同一个分子的 PCR 产物组成共有序列,以便提高测序准确性,消除 PCR 偏差。Galaxy 平台提供一个开源软件工具——pRESTO,用于在本地或云端开展超强生物信息分析。为了确保不熟悉 Galaxy 平台的用户能成功使用分析软件,pRESTO 提供教学教程。

     

     抗体和 TCR 结构的简化示意图:

     

     NEBNext® 免疫测序试剂盒(小鼠)                               #E6330L 96 次反应

     

     免疫组建库流程:

     

     NEBNext® 免疫测序试剂盒(小鼠)                               #E6330L 96 次反应

    产品描述:

    NEBNext® 免疫测序试剂盒(小鼠)                               #E6330L 96 次反应

    使用唯一分子标签序列(UMI)实现克隆型的精准检测。在有或没有 UMI 情况下,比较小鼠 TCR 克隆型频率。根据有 UMI 的测序结果,对前 100 个高表达克隆型进行排序。在有或没有 UMI 情况下,重复建库,克隆型频率重叠绘制于图中。每个条形或圆点代表一个克隆,该克隆经过总读长分析或使用 UMI 过滤。使用 UMI 可对原始样本中的起始 RNA 分子进行绝对定量。当将克隆按照富集度从高到底进行排序,没有 UMI 的数据会导致 PCR 或测序扩增的偏差,从而误导样本中克隆型频率的分析。UMI 的使用通过对起始样本中 RNA 的绝对定量来校正偏差。使用 UMI 也可以在重复本之间实现更好的相关性,尤其是起始量较低时。各个文库向下抽样 500,000 reads

    NEBNext® 免疫测序试剂盒(小鼠)                               #E6330L 96 次反应

    使用 NEBNext 免疫测序试剂盒(小鼠),能够在同一管中制备小鼠 BCR TCR 文库。分别使用 10 ng100 ng 1,000 ng 小鼠脾脏总 RNATakara Bio #636605)制备小鼠 BCR+TCR 文库,每个起始量都做有平行实验。所有文库向下抽样 1,000,000 reads。使用 pRESTO 工具完成 reads 过滤、序列组装和基于 UMIs 组成共有序列。使用 MiGMAP 鉴别 VD J 区域。图(A)表示每个小鼠脾脏总 RNA 起始样本检测到的克隆型数量。图(B)表示各文库中 B 细胞重链(IGH)和轻链(IGK IGL)以及 链(TRA)、β 链(TRB)、δ 链(TRD)和 γ 链(TRG)所占百分比。